New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3490531 | 64 (0.980) | 4 (0.060) | 4/254 | NT | 6.4% | coding (860/2637 nt) | clpV | protein ClpV1 |
? | NC_002947 | = 3490575 | 55 (0.880) | coding (816/2637 nt) | clpV | protein ClpV1 |
GCCGATCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCC > NC_002947/3490431‑3490723 | gCCGATCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCaggg > 1:143306‑M2/1‑145 (MQ=255) aTCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGTGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCACCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAAc < 7:195979/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAAc < 8:27987/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACg > 7:269485/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACg < 3:363032/149‑1 (MQ=255) aGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTc > 7:260634/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCt > 2:117842/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCt > 6:94794/1‑149 (MQ=255) gtgtGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCtt < 7:331083/149‑1 (MQ=255) gtgGCCTTCGTCGATGACCAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGa < 7:361920/149‑1 (MQ=255) ggCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCa > 5:297296/1‑149 (MQ=255) cgtcgATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCAccgc < 6:297296/148‑1 (MQ=255) aTGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCAc > 4:275146/1‑149 (MQ=255) aCAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAACACCGCCGGCACGTCa > 4:373408/1‑149 (MQ=255) gatgatCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTc > 4:75546/1‑123 (MQ=255) gatgatCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTc < 3:75546/123‑1 (MQ=255) gatgatCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCt > 7:291740/1‑149 (MQ=255) gatgatCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCt > 5:194718/1‑149 (MQ=255) tgatCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTgg < 8:291740/149‑1 (MQ=255) gatCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTggg > 4:289871/1‑149 (MQ=255) tCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAg > 3:370602/1‑124 (MQ=255) tCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAg < 4:370602/124‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATg < 1:117842/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATgcgc < 3:275146/148‑1 (MQ=255) gACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCtt > 4:60404/1‑149 (MQ=255) aCCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTc < 5:94794/149‑1 (MQ=255) aCCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTc < 2:228617/149‑1 (MQ=255) tctTCGATCACAGCCTTGAGGTGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGAc > 2:263143/1‑149 (MQ=255) ctTCGATCACAGCCTTGAGGCGCTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGAGCCGGCCTGTAACAGCCCCAGGTCGACGCTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCAAAGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGTCCTTCGAc > 8:365374/1‑148 (MQ=255) ttCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCa > 8:69829/1‑149 (MQ=255) ttCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCa > 4:77804/1‑149 (MQ=255) caGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCAcc > 1:177547/1‑109 (MQ=255) caGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCAcc < 2:177547/109‑1 (MQ=255) caGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTggg > 4:6430/1‑114 (MQ=255) caGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTggg < 3:6430/114‑1 (MQ=255) gCCTTGAGGCGGGCCATCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGttt < 1:140091/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCAGTAAAAGGCCCCTGTCGAGGGGGTTGAGGGCAAAGTACTTGAGCACCCCCGGCCCCTACCCCGGGGCGCAGGGCCGCCCCAGGCCTTCGGCCACCGCGTGTTTg > 6:276726/1‑149 (MQ=255) cTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTATCAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCTGTTTTGc < 7:365374/149‑1 (MQ=255) ggCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGAcc > 2:342882/1‑149 (MQ=255) tcGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTc > 7:272074/1‑149 (MQ=255) cGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGCTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCAACCTCGGCGATGCGCAGCGCCATCCCGTCGACCACGGCGCTTATGCAGACCCCTGCttag > 4:38434/1‑147 (MQ=255) gAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCACCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGc > 1:259949/1‑149 (MQ=255) aaCTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCagggcgagttcgagaaccgcctcaaggctgtgatcgaagaggtcaagcgcagcctgcacccgatcatcctgttcatcgacgaagcccacaccct < 5:296108‑M2/148‑95 (MQ=255) aaCTCGCCCTAGACCCCGGCGCCGGCATGTAACACGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACCTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACACTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTAAGACCACGGCGGTTTTGCCGACCACGGCTTCGcc > 4:182201/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCg > 3:62444/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCagggcgagttcgagaaccgcctcaaggctgtgatcgaagaggtcaagcgcagcctgcacccgatcatcctgttcatcgacgaagcccacaccctgatc < 3:70375‑M2/149‑99 (MQ=255) gCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCagggcgagttcgagaaccgcctcaaggctgtgatcgaagaggtcaagcgcagcctgcacccgatcatcctgttcatcgacgaagcccacacc > 5:215517‑M2/1‑49 (MQ=255) gCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCagggcgagttcgagaaccgcctcaaggctgtgatcgaagaggtcaagcgcagcctgcacccgatcatcctgttcatcgacgaagcccacacc < 6:215517‑M2/141‑93 (MQ=255) gCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGa < 8:260634/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGa < 3:60404/149‑1 (MQ=255) ttGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGAt > 7:206291/1‑149 (MQ=255) ccccGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCggg > 5:182384/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGgtt > 1:138041/1‑149 (MQ=255) gtcgcCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCTCGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGACAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGgttgt < 3:182201/147‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGgttgtt < 6:194718/149‑1 (MQ=255) gcCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAACACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCt < 3:373408/149‑1 (MQ=255) ccTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCcgg < 1:263143/149‑1 (MQ=255) tAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCcg > 6:69019/1‑144 (MQ=255) tAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCcg < 5:69019/144‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAgg < 6:182384/149‑1 (MQ=255) cGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCg < 7:225379/149‑1 (MQ=255) cGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGGTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCg < 7:219516/149‑1 (MQ=255) gggTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGAcc < 3:77804/149‑1 (MQ=255) gtgtGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCAt > 5:356265/1‑149 (MQ=255) cAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGcc < 8:272074/149‑1 (MQ=255) cAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGcc < 1:244980/149‑1 (MQ=255) | GCCGATCAGGGTGTGGGCTTCGTCGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTC‑TCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCC > NC_002947/3490431‑3490723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |