New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3973644 | 51 (0.780) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (829/1326 nt) | PP_3503 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 3973680 | 62 (1.010) | coding (793/1326 nt) | PP_3503 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
CCGGTCGCGCAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAGCACCGG > NC_002947/3973537‑3973826 | cctgTCGCGCAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGccac < 7:288790/146‑1 (MQ=255) ccGGTCGCGCAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgcca > 3:229540‑M2/1‑144 (MQ=255) ccGGTCGCGCAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgcca > 1:225734‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGTCGCGCAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgccacc > 8:142898‑M2/1‑143 (MQ=255) cAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCt < 5:147678/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCg < 4:324087/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCAGCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGAtgt < 5:401147/149‑1 (MQ=255) tCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAATACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGATgccaccca < 1:293935‑M2/133‑9 (MQ=255) tCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgccaccca > 2:293935‑M2/1‑124 (MQ=255) ccaccTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GCAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTcc > 6:124379/1‑149 (MQ=255) caccTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCt > 1:350630/1‑149 (MQ=255) caccTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGACGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCt > 8:197821/1‑149 (MQ=255) accTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGCTGGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCt > 1:276946/1‑149 (MQ=255) accTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTg > 4:33132/1‑149 (MQ=255) cAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCaa < 3:33132/147‑1 (MQ=255) aaGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGa > 3:208950/1‑148 (MQ=255) gTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACgca < 7:95537/149‑1 (MQ=255) ggCGGTATTACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCaa > 4:251587/1‑136 (MQ=255) ggCGGTATTACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCaa < 3:251587/136‑1 (MQ=255) gCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCaa > 2:233100/1‑135 (MQ=255) gCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCaa < 1:233100/135‑1 (MQ=255) ggTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTg < 5:247282/149‑1 (MQ=255) ggTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTg > 7:166482/1‑149 (MQ=255) tAATACAGGTCTTCGC‑GCAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGc < 5:124379/149‑1 (MQ=255) aaTACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGcc > 6:312344/1‑149 (MQ=255) aCAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGc < 1:201774/116‑1 (MQ=255) aCAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGc > 2:201774/1‑116 (MQ=255) aCAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCt < 6:285583/147‑1 (MQ=255) aCAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCt > 5:285583/1‑147 (MQ=255) aCAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTg > 5:54168/1‑148 (MQ=255) aGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCaa > 3:313511/1‑149 (MQ=255) ggAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAAtt > 8:378355/1‑141 (MQ=255) ggAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAAtt < 7:378355/141‑1 (MQ=255) gCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGTACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCg > 2:355808/1‑149 (MQ=255) ttGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGa > 1:280187/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGAttt > 4:186357/1‑148 (MQ=255) tCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGAttt > 8:288480/1‑148 (MQ=255) gATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCGCCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTtc < 2:219908/147‑1 (MQ=255) gATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTtcat > 2:356340/1‑149 (MQ=255) gATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTtc < 4:313511/147‑1 (MQ=255) gCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAg < 7:288480/149‑1 (MQ=255) cccGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAg > 2:261866/1‑148 (MQ=255) cccGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGAAGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAg > 4:227393/1‑148 (MQ=255) ccGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGa > 2:377472/1‑148 (MQ=255) ccGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGa > 7:114291/1‑148 (MQ=255) aaGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAAt < 8:166482/148‑1 (MQ=255) tCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTgcc < 5:239655/149‑1 (MQ=255) cacaTGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTgccgc > 7:71613/1‑149 (MQ=255) aTGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgccacccatgtggaccttgagcgggccatcgagcaagggcgtttccgcgaagacctgtattaccgcctgaacgtcttgcaggtg > 5:143948‑M2/1‑45 (MQ=255) aTGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgccacccatgtggaccttgagcgggccatcgagcaagggcgtttccgcgaagacctgtattaccgcctgaacgtcttgcaggtg < 6:143948‑M2/129‑85 (MQ=255) gTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTgccacccatgtggaccttgagcgggccatcgagcaagggcgtttccgcgaagacctgtattaccgcctgaacgtcttgcaggtggtgaccgcgccgttgcgcgaccgg < 2:220013‑M2/149‑109 (MQ=255) tGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGcc > 3:100524/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCg < 2:280187/149‑1 (MQ=255) cAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGa < 1:261866/149‑1 (MQ=255) cccGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGc < 8:71613/149‑1 (MQ=255) cccGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGc > 7:167192/1‑149 (MQ=255) ccGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACgc > 6:36729/1‑67 (MQ=255) ccGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACgc < 5:36729/67‑1 (MQ=255) ccGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAAAGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGcc > 3:70469/1‑149 (MQ=255) aCATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCg > 7:152950/1‑138 (MQ=255) aCATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCg < 8:152950/138‑1 (MQ=255) ccACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTg > 5:215347/1‑68 (MQ=255) ccACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTg < 6:215347/68‑1 (MQ=255) aCCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTgcg < 8:114291/149‑1 (MQ=255) gTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCtt > 1:308077/1‑126 (MQ=255) gTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCtt < 2:308077/126‑1 (MQ=255) tATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGAAGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGt < 3:227393/149‑1 (MQ=255) gggCCGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCAGGTGAg > 1:140542/1‑149 (MQ=255) ggctggctGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAg < 1:355808/148‑1 (MQ=255) ctggctgCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAGCAc < 2:350630/149‑1 (MQ=255) ctggctgCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAGCAc < 6:54168/149‑1 (MQ=255) gctgCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAGCACCgg < 4:208950/149‑1 (MQ=255) gctgCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAGCACCgg > 6:232436/1‑149 (MQ=255) | CCGGTCGCGCAACGGCGCGGTCACCACCTGCAAGACGTTCAGGCGGTAATACAGGTCTTCGC‑GGAA‑ACGCCCTTGCTCGATGGCCCGCTCAAGGTCCACATGGGTGGCCGCCAGCACCCGTACATCCACCGGTATGGGCTGGCTGCCACCCACCCGCTCGATGTGCTTCTCCTGCAAGAAACGCAGCAAGTTGGCCTGCAATTCCAACGGCAGGTCGCCGATTTCATCAAGAAACAATGTGCCGCCATCGGCCGCTTCGATACGCCCGGTCTTGCGCTGGTGAGCACCGG > NC_002947/3973537‑3973826 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |