New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4040473 = | 49 (0.750) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.7% | coding (361/948 nt) | PP_3561 | membrane protein |
? | NC_002947 | 4040529 = | 52 (0.840) | coding (417/948 nt) | PP_3561 | membrane protein |
TGCTGTATCAGGGCGCGGCGAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTGGTGCTACG > NC_002947/4040387‑4040675 | ccgtggcgggcgaactgtgacgggggctgaagcgggcaaacaccagtacgcagagcaggttgaccaagggcacgatggcagcgttgGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCt > 6:311624‑M1/87‑149 (MQ=255) tCAGGGCGCGGCGATCCATGAGGGTTCCGACTTCACTTTGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCTACAACTACATGGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGGAGCTCCGGGATTGCCCTGGCGGGGGTGGCCAACGCTGCGATc < 4:104662/148‑1 (MQ=255) tCAGGGCGCGGCGAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCg > 2:127383/1‑149 (MQ=255) ggcgAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGGCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTgg < 1:127383/149‑1 (MQ=255) ggcgAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTgg < 6:169088/149‑1 (MQ=255) gcgAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGt < 3:72/149‑1 (MQ=255) gAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCa > 8:27596/1‑134 (MQ=255) gAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCa < 7:27596/134‑1 (MQ=255) cgggcgctgaagcgggcaaacaccagtacgcagagcaggttgaccaagggcacgatggcagcgttgGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACg < 4:278482‑M1/61‑1 (MQ=255) cgggcgctgaagcgggcaaacaccagtacgcagagcaggttgaccaagggcacgatggcagcgttgGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACg > 3:278482‑M1/67‑127 (MQ=255) gTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGc > 6:44203/1‑149 (MQ=255) gTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGCGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGc < 5:245183/149‑1 (MQ=255) gCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCg > 3:377955/1‑148 (MQ=255) cGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTAc < 5:44203/149‑1 (MQ=255) acttcacttcGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTa > 5:385281/1‑146 (MQ=255) acttcacttcGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTa < 6:385281/146‑1 (MQ=255) cttcGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGttt > 3:63469/1‑149 (MQ=255) ttcGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTg > 4:61922/1‑149 (MQ=255) ttcGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGACAACCTGCTCTGCGTAc > 7:37859/1‑140 (MQ=255) ttcGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGACAACCTGCTCTGCGTAc < 8:37859/140‑1 (MQ=255) tgtTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGc < 3:61922/149‑1 (MQ=255) tgtTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGc < 2:110490/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCa < 7:187132/148‑1 (MQ=255) tATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGc > 7:174806/1‑113 (MQ=255) tATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGc < 8:174806/113‑1 (MQ=255) cGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCTCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAg > 5:359382/1‑149 (MQ=255) gCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGt > 8:39743/1‑149 (MQ=255) aacaacTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTcgcc > 4:352072/1‑149 (MQ=255) acaacTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTcgccc > 3:149934/1‑149 (MQ=255) aacTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTcgcccgc < 4:63469/149‑1 (MQ=255) tACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCAc > 4:99648/1‑149 (MQ=255) aCATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACg > 6:291579/1‑149 (MQ=255) aCATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACg > 8:224006/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACgg > 7:375444/1‑149 (MQ=255) agcgttggccaccgccgccagggcaatcccggcgctgccgtagatgcccgcagccagggtggcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCCCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACgg > 6:311624‑M2/64‑149 (MQ=255) tCGGTGACAAACTCGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGACGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGACAACGCTGCCATCGTGCCCTTCGACAACCTGCTATCCGTACTGGTGTTTGCCCCCTTCCGCGACCGTCACAGTTCGCCCCCCACGGTg > 4:93055/1‑149 (MQ=255) cgttggccaccgccgccagggcaatcccggcgctgccgtagatgcccgcagccagggtggcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCg > 3:278482‑M2/62‑127 (MQ=255) cgttggccaccgccgccagggcaatcccggcgctgccgtagatgcccgcagccagggtggcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCg < 4:278482‑M2/66‑1 (MQ=255) CCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCgg < 6:303045‑M1/149‑1 (MQ=255) CACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCggg > 3:99648‑M1/1‑149 (MQ=255) CCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGc < 7:375287‑M1/148‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCTCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGAt < 6:359382/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGc < 5:94104/87‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGc > 6:94104/1‑87 (MQ=255) gCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATc < 5:303045/147‑1 (MQ=255) cTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTc < 5:257493/149‑1 (MQ=255) cGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGc < 8:375287/148‑1 (MQ=255) cGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGc < 1:92500/148‑1 (MQ=255) gggCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTc > 8:127344/1‑110 (MQ=255) gggCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTc < 7:127344/110‑1 (MQ=255) aTCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAAccc > 4:329876/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGt < 7:39743/146‑1 (MQ=255) cGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGa < 5:291579/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGa > 4:200243/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGAt > 4:169522/1‑149 (MQ=255) gcCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTCTTTGCCAGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCgg > 5:284157/1‑149 (MQ=255) gcCGGGAATGCCCAGGCGGCAGAGGCCAACCCTGCAATCGTGCGCTTGGTCATCCACCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCATCAGCGCCCGTCACATTTCGCACGCCACGGTGCTTCGGGCGAGCTACGCCAGGCCGTTCGTCGTCgg > 6:138889/1‑149 (MQ=255) cccTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAggg > 4:351024/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAgggg > 2:314845/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTGCGGGCGATCTTCGc > 2:381762/1‑118 (MQ=255) tGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTCCGGGCGATCTTCGc < 1:381762/118‑1 (MQ=255) ggcgtTGGCCAACGCTGCCTTCGTTCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTgg < 6:284157/149‑1 (MQ=255) tggcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTGGTGCTa < 4:149934‑M2/145‑1 (MQ=255) tggcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTGGTGCTa < 3:200243‑M2/145‑1 (MQ=255) gcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTGGTGCTACg > 6:67984‑M2/3‑149 (MQ=255) gcCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTGGTGCTACg < 3:169522‑M2/147‑1 (MQ=255) | TGCTGTATCAGGGCGCGGCGAACCATGAGGGTGCCGACTTCACTTCGGTGTTTCAGGGCGGTATCCGCTTCAACAACTACATCGGTGCCACCCTGGCTGCGGGCATCTACGGCAGCGCCGGGATTGCCCTGGCGGCGGTGGCCAACGCTGCCATCGTGCCCTTGGTCAACCTGCTCTGCGTACTGGTGTTTGCCCGCTTCAGCGCCCGTCACAGTTCGCCCGCCACGGTGCTTCGGGCGATCTTCGCCAACCCGTTGATCGTCGGCTGCGCAGGGGGGCTGGTGCTACG > NC_002947/4040387‑4040675 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |