New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4700136 | 61 (0.940) | 4 (0.070) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (552/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
? | NC_002947 | = 4700167 | 64 (1.060) | coding (521/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
CGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCA > NC_002947/4700021‑4700314 | cGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgc > 5:44755‑M2/1‑147 (MQ=255) gTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgctc < 1:201882‑M2/149‑5 (MQ=255) gCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgctcgaac > 7:35692‑M2/1‑141 (MQ=255) cATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgctcgaac > 7:147920‑M2/1‑140 (MQ=255) tGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCt > 5:261336/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTcc > 3:124003/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATAGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTcc < 2:298611/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTg > 6:90106/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTg > 6:277867/1‑148 (MQ=255) cTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgc > 6:170882/1‑148 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgcag < 2:201882/147‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGGCGATCAGCACCAGCTCGCACGCTTCCTgcagca > 5:242217/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGt > 1:26857/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGt > 2:84716/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCg < 3:6453/149‑1 (MQ=255) gTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCgg < 1:84716/149‑1 (MQ=255) ttgcctaaaaTAAGCATCGCAGGCCCGCCTTTGCTGGTCCGGGACGTTCACCTTGCCTTGCAGGATGCGTTGGACGATGTCTCGGGGACGCCCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGtctc < 1:315494/143‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgc > 3:221249/1‑149 (MQ=255) tGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgc < 5:336458/148‑1 (MQ=255) gCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcgcg > 1:299551/1‑148 (MQ=255) aaaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACt > 4:198192/1‑149 (MQ=255) aaaaTACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACtt < 5:90106/149‑1 (MQ=255) aCGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcg < 5:205961/137‑1 (MQ=255) aCGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTcg > 6:205961/1‑137 (MQ=255) aCGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTgacag > 7:101135/1‑145 (MQ=255) gCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGcc > 6:249794/1‑149 (MQ=255) cATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCg > 7:314656/1‑149 (MQ=255) aTCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCgg > 8:215406/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCCTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTaa < 7:215406/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGAAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGt > 6:296292/1‑149 (MQ=255) ccgccCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTcg < 5:277867/149‑1 (MQ=255) cccTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCgg > 8:47776/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGa < 8:39653/149‑1 (MQ=255) tGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgctcgaac > 3:246875‑M2/1‑73 (MQ=255) tGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgctcgaac < 4:246875‑M2/81‑9 (MQ=255) tGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTc > 7:66974/1‑149 (MQ=255) tGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTc > 5:142727/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCg < 6:261336/148‑1 (MQ=255) tCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGtt > 8:118986/1‑149 (MQ=255) gggCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGa < 8:314656/149‑1 (MQ=255) ggCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAg < 2:299551/149‑1 (MQ=255) acacCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCtt > 7:284087/1‑146 (MQ=255) acacCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCtt < 8:284087/146‑1 (MQ=255) acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg < 8:66974/149‑1 (MQ=255) cTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGt > 2:383495/1‑149 (MQ=255) 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cTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTg > 3:122130/1‑148 (MQ=255) aCGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCg < 4:290116/103‑1 (MQ=255) aCGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCg > 3:290116/1‑103 (MQ=255) cGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGtt < 5:249794/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGtt > 7:299205/1‑124 (MQ=255) gCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGtt < 8:299205/124‑1 (MQ=255) 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3:297166/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAgctcgaacgcctgcgtgaaggcaaggtgtacgtgcccgagcaggcaagggcggccatcgatgcgtatttttcgcaaaccaacctcaccgccctgcgcgagctggccatg < 3:303483‑M2/148‑110 (MQ=255) gTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtg < 7:118986/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtg < 7:363489/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtggt < 2:343571/148‑1 (MQ=255) gAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtggtg < 4:221249/148‑1 (MQ=255) gAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtggtg < 5:170882/148‑1 (MQ=255) gcagcTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTac < 2:26857/149‑1 (MQ=255) ctctCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGt < 1:321498/149‑1 (MQ=255) tctcGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg > 2:63380/1‑119 (MQ=255) tctcGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg < 1:63380/119‑1 (MQ=255) tctcGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGAc > 6:29699/1‑128 (MQ=255) tctcGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGAc < 5:29699/128‑1 (MQ=255) gg‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCcgc < 7:47776/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGt > 7:110551/1‑149 (MQ=255) gCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCt > 4:233892/1‑149 (MQ=255) cACCAgctcgaacgcctgcgtgaaggcaaggtgtacgtgcccgagcaggcaagggcggccatcgatgcgtatttttcgcaaaccaacctcaccgccctgcgcgagctggccatgcagaccgccgctgctcaggtcgatgccgacctggc > 2:195411‑M2/1‑5 (MQ=255) cACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCtt > 7:232670/1‑149 (MQ=255) cACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCtt < 2:399020/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTCTAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTg < 5:331731/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTg > 5:415720/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAaga > 7:374035/1‑140 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAaga < 8:374035/140‑1 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGGCCTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTGGACCGTGGTGTAGACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGca > 6:380341/1‑149 (MQ=255) | CGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGG‑‑CAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCA > NC_002947/4700021‑4700314 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |