New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4272 = | 61 (1.130) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 5.9% | coding (110/1896 nt) | trmF | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
? | NC_002947 | 4308 = | 68 (1.290) | coding (74/1896 nt) | trmF | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein |
GTTCAGAACGCGGAACTGGATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGCGAATAGAGAAGGTAAGCG > NC_002947/4124‑4420 | gtttctttactgggggggaagtccctatacttgtccgcttaccttctctattcgcaaaaacaggcacgaggtgcgtggtggatttcccttcccgttttgacgtgatcgtcatcggcggcggccatgccggtaccgaggctgcgcttgcg < 5:134937‑M1/1‑1 (MQ=255) ttCAGAACGCGGAACTGGATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATggg < 8:102014/148‑1 (MQ=255) aaCGGGTAACTGTATGCCGGTGTTGTGGGTGGCATGGGCAATGGGGCGGCGTTGGGATTCTATCTTTTTTACCATATGGCTTTTGCAAATACCGCGCATGGGGGGGTTGATGCTAATGTTACCCTGGG‑TTCCACGTTATGGGTcagcag < 4:170806/149‑1 (MQ=255) ggAACTGGATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTcagcagca < 1:110522/147‑1 (MQ=255) ggAACTGGATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTcagcagca > 2:110522/1‑147 (MQ=255) gATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTca < 3:57131/149‑1 (MQ=255) gATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTca > 3:184350/1‑149 (MQ=255) tGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTcaca < 6:110354/149‑1 (MQ=255) cGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACAcc > 4:1987/1‑148 (MQ=255) ctctTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCAt < 6:59320/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTg > 1:340066/1‑147 (MQ=255) ggTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTg > 4:280695/1‑146 (MQ=255) cAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGc > 1:278649/1‑147 (MQ=255) ttctctattcgcaaaaacaggcacgaggtgcgtggtggatttcccttcccgttttgacgtgatcgtcatcggcggcggccatgccggtaccgaggctgcgcttgcGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGAc < 5:89648‑M1/36‑1 (MQ=255) ttctctattcgcaaaaacaggcacgaggtgcgtggtggatttcccttcccgttttgacgtgatcgtcatcggcggcggccatgccggtaccgaggctgcgcttgcGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGAc > 6:89648‑M1/106‑141 (MQ=255) ccATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCa < 3:158092/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTc > 7:7711/1‑149 (MQ=255) cgccgcCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCg > 8:60768/1‑149 (MQ=255) gccgccGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCgg < 5:132461/149‑1 (MQ=255) ccgAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTAcc < 2:278649/149‑1 (MQ=255) gAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACAccc > 2:197703/1‑115 (MQ=255) aaacaggcacgaggtgcgtggtggatttcccttcccgttttgacgtgatcgtcatcggcggcggccatgccggtaccgaggctgcgcttgcGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAg > 3:40120‑M1/92‑132 (MQ=255) aaacaggcacgaggtgcgtggtggatttcccttcccgttttgacgtgatcgtcatcggcggcggccatgccggtaccgaggctgcgcttgcGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAg < 4:40120‑M1/41‑1 (MQ=255) aTCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑gc > 6:134937/1‑149 (MQ=255) cGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTAc < 8:263481/138‑1 (MQ=255) cGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCAACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTAc > 7:263481/1‑138 (MQ=255) tctTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCgg < 8:70013/136‑1 (MQ=255) tctTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑gccgccgcc > 7:253290/1‑149 (MQ=255) tctTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑gccgccgc > 6:190270/1‑148 (MQ=255) tttGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑gccgc < 6:139239/143‑1 (MQ=255) tGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGa < 3:280695/147‑1 (MQ=255) tGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGAt < 8:253290/148‑1 (MQ=255) tGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGAt < 2:340066/148‑1 (MQ=255) aCCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGAc < 3:1987/149‑1 (MQ=255) ccAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACg < 8:7711/149‑1 (MQ=255) ccAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGATATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCAGCCGCCGATGAc > 6:208114/1‑148 (MQ=255) cAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGa > 2:103200/1‑149 (MQ=255) aGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGAt < 5:72764/149‑1 (MQ=255) gATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATc < 4:114874/149‑1 (MQ=255) tttGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCa > 1:321828/1‑148 (MQ=255) ttGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACggc > 8:210137/1‑144 (MQ=255) ttGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTc < 7:210137/146‑1 (MQ=255) ccAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGAt < 6:99177/137‑1 (MQ=255) ccAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGAt > 5:99177/1‑137 (MQ=255) cAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATg < 8:280851/118‑1 (MQ=255) cAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATg > 7:280851/1‑118 (MQ=255) aaTACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCTATGACGATCACGTCAAAACggg < 5:190270/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑gccg > 8:65216/1‑118 (MQ=255) aCCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑gccg < 7:65216/118‑1 (MQ=255) cAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACgggaag > 7:199340/1‑130 (MQ=255) cAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACgggaag < 8:199340/130‑1 (MQ=255) gCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACgggaagg < 3:212386/129‑1 (MQ=255) gCTCATGTGAACGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACgggaagg > 4:212386/1‑129 (MQ=255) tgtgACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCt > 7:107064/1‑149 (MQ=255) tgtgACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCt < 8:107064/149‑1 (MQ=255) gtgACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTg > 1:166761/1‑149 (MQ=255) aCCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGttt > 5:35881/1‑149 (MQ=255) cGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGttttt > 6:121705/1‑149 (MQ=255) gAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTg < 5:121705/149‑1 (MQ=255) aGGTTTTCCACGTTTTGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATGCTCCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGttttt < 1:103200/149‑1 (MQ=255) aGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGc < 7:60768/149‑1 (MQ=255) tttCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTc > 3:172741/1‑100 (MQ=255) tttCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTc < 4:172741/100‑1 (MQ=255) ttCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGAGAATa > 4:15510/1‑149 (MQ=255) cACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCCTGCCTGTTTTTGCGAATa > 1:153113/1‑146 (MQ=255) aCGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGCGAATAgaga < 6:35881/149‑1 (MQ=255) gTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGCGAATAGAGAAg > 5:117444/1‑149 (MQ=255) tGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGCGAATAGAGAAGGt > 8:218770/1‑147 (MQ=255) GTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGCGAATAGAGAAGGTAAGCg < 5:17876‑M1/149‑1 (MQ=255) | GTTCAGAACGCGGAACTGGATGCCGCTCTTGTCGGTGGCCAGCGCCATGGCGCCGCCGAGCGCATCGATCTCTTTGACCAGATGGCTTTTGCCAATACCGCCGATGGCGGGGTTGCAGCTCATGTGACCGAGGGTTTCCACGTTATGGGTCAGCAGCAGGGTTTTCACACCCATGCGTGCAGACGCAAGCGCAGCCTCGGTACCGGCATG‑‑GCCGCCGCCGATGACGATCACGTCAAAACGGGAAGGGAAATCCACCACGCACCTCGTGCCTGTTTTTGCGAATAGAGAAGGTAAGCG > NC_002947/4124‑4420 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |