New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 403251 = | 68 (1.260) | 4 (0.080) | 4/230 | NT | 9.1% | intergenic (‑54/+115) | msrA/PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein |
? | NC_002947 | = 5162580 | 20 (0.420) | intergenic (+103/+98) | PP_4544/PP_4545 | hypothetical protein/beta‑ketodecanoyl‑ACP synthase |
TCGGGCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAG > NC_002947/403103‑403398 | tCGGGCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCAt > 8:122846/1‑149 (MQ=255) gCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGccc < 1:170315/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGccc < 2:202664/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGccc > 5:62103/1‑149 (MQ=255) gCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:142342/1‑149 (MQ=255) tCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGTAAGCCGCAGCAAATGGAGCTTTCATGTGTTTTTATTAAGTGGGTTAGGGTTTTGGGCATTCGCGGGCATGCCCgat > 1:107161/1‑147 (MQ=255) tCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 3:248354/1‑148 (MQ=255) cATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 2:9057/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcac < 1:83311/149‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 6:92561/1‑148 (MQ=255) acaccctgcaggtagacctggaagccaagttctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTccc < 1:260024‑M1/11‑1 (MQ=255) ggCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 6:108847/148‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGGGGTAGCGGGGACCCCCGCGCCCACAggggaagcc > 5:344063/1‑141 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAc > 8:118475/1‑144 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAc < 7:118475/144‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGca > 2:58292/1‑148 (MQ=255) ccAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGt > 1:24778/1‑149 (MQ=255) ggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTc < 2:238356/149‑1 (MQ=255) 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ttCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTTTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgt < 5:158421/147‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg < 5:92561/148‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgt < 4:248354/147‑1 (MQ=255) ccGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTgtggtg > 2:249061/1‑149 (MQ=255) ctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTcc < 5:75422‑M1/10‑1 (MQ=255) ctaagcaacaccctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTcc > 6:75422‑M1/108‑117 (MQ=255) gTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCt < 7:254751/149‑1 (MQ=255) tgtgCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACG‑‑ATGG‑GCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCtg < 8:277912/146‑1 (MQ=255) tGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCtg > 4:102342/1‑149 (MQ=255) gCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑gg < 6:62103/149‑1 (MQ=255) gCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑gg < 1:58292/149‑1 (MQ=255) taTGACGTTTTTGTTCACCAGTATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGttt < 6:43610/124‑1 (MQ=255) aTGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑gg > 2:289040/1‑147 (MQ=255) cctgctctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAAGGTCTGTGGTGATACTGT‑‑gg > 5:333499‑M1/97‑149 (MQ=255) gTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCTAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCggg > 4:224660/1‑149 (MQ=255) gTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCggg > 3:43435/1‑149 (MQ=255) tctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTcc > 2:52355‑M1/92‑101 (MQ=255) tctgcttcacctgaagcgggaaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggccccttcgcgggctTGCCCGCTcc < 1:52355‑M1/10‑1 (MQ=255) gTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGc < 6:289824/148‑1 (MQ=255) aCCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGGGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTAAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCcgc < 2:142342/148‑1 (MQ=255) ccAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 3:313227/1‑148 (MQ=255) cAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCAGGTACAGCACAGGTTTGAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 4:44668/1‑148 (MQ=255) 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aTTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTg < 7:40181/137‑1 (MQ=255) aTTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTg > 8:40181/1‑137 (MQ=255) aaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggcctcttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAAGGTCTGTGGTGATACTGT‑‑GGGa > 7:198922‑M1/72‑126 (MQ=255) aaacgccgaccccatccggcgtttcccgcttctttttgtctgtgtgaaatgcgccggcctcttcgcgggctTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGTTCTCAAGGTCTGTGGTGATACTGT‑‑GGGa < 8:198922‑M1/55‑1 (MQ=255) gctggACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGGTTTTATTCAGTGGGGTTGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGc < 2:18603/146‑1 (MQ=38) gCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGGGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGc < 4:207373/149‑1 (MQ=255) c‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCtata > 7:117749/1‑149 (MQ=255) tGG‑CGGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGACCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCgg < 7:184796/113‑1 (MQ=255) g‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTg < 1:249061/148‑1 (MQ=255) ctctGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAgg < 1:9057/148‑1 (MQ=255) ctGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTTAAAGAGCGGGCTTCCCCGCAAAAGGC‑CCCAAATGGATAATATAGTGCCagagta > 1:111186/1‑147 (MQ=25) 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cAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGAtt < 4:275545/138‑1 (MQ=255) aGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGt > 1:181902/1‑147 (MQ=255) gTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAg > 2:239595/1‑149 (MQ=255) gggTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGc < 1:239595/149‑1 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCAc > 8:163827/1‑149 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGGGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCAc > 2:252127/1‑149 (MQ=255) aGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTGCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCCGCTGTCAGGCCACCg > 3:199816/1‑149 (MQ=255) gggCCTTCGCGTGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCa < 3:258969/126‑1 (MQ=255) gggCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCa > 4:258969/1‑126 (MQ=255) cTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTGGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGCCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGa > 7:270875/1‑148 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACTGGTACAGCACAGTTTTCAATGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGTAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATa < 2:247593/147‑1 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAGGTTTCAAAGGCGGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATa < 6:22319/147‑1 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAgc > 7:134066/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAg < 3:102342/148‑1 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAgcg > 2:212245/1‑149 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCtt > 2:95796/1‑148 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTc < 2:24778/149‑1 (MQ=255) ctTGCCCGCTCCCACTGGTACAGAACTGTTTTAAATGGTTGTGGTGTTCCTGG‑‑GGTTGGGGGGGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCa > 4:313227‑M1/3‑149 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAATGGTTGGGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAg < 4:199816/149‑1 (MQ=255) | TCGGGCAGGCTCATTGGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACC‑‑ATGG‑CCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGG‑CCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAG > NC_002947/403103‑403398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |