New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 674337 = | 56 (1.040) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 6.6% | intergenic (‑229/+77) | PP_0575/PP_0576 | membrane protein/lipoprotein |
? | NC_002947 | 674395 = | 61 (1.210) | intergenic (‑287/+19) | PP_0575/PP_0576 | membrane protein/lipoprotein |
CGGGGGAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCG > NC_002947/674189‑674482 | cGGGGGAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGcc < 3:320791/149‑1 (MQ=255) gggggAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCa > 4:79857/1‑149 (MQ=255) gggAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATg < 1:246426/149‑1 (MQ=255) atggcgcggcagtgccgagcagatcatgaacaactacccgccaagcccggaagaacgcaacagcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgcatg‑ca < 5:233745‑M1/6‑1 (MQ=255) atggcgcggcagtgccgagcagatcatgaacaactacccgccaagcccggaagaacgcaacagcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgcatg‑ca < 3:86126‑M1/6‑1 (MQ=255) cGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCATGG‑CACC‑ggc < 5:42903/149‑2 (MQ=255) ggTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGc < 3:79857/149‑1 (MQ=255) gagcagatcatgaacaactacccgccaagcccggaagaacgcaacagcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTc < 1:51708‑M1/22‑1 (MQ=255) gAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTcg > 4:276931/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGt < 3:236233/149‑1 (MQ=255) cgtgcgtgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAAc < 3:24225/149‑1 (MQ=255) gtgcgtgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAAcc > 7:188414/1‑149 (MQ=255) tgcgtgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGCCACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGGGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAAccc < 6:222017/149‑1 (MQ=255) gcgtgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCg > 4:223783/1‑149 (MQ=255) tgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTcgc < 7:245417/135‑1 (MQ=255) tgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTcgc > 8:245417/1‑135 (MQ=255) ggAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGATGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa < 1:246722/149‑4 (MQ=255) gAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 8:188414/148‑1 (MQ=255) aaTGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCccg < 3:223783/149‑1 (MQ=255) ccgccaagcccggaagaacgcaacagcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCccgcc > 2:51708‑M1/107‑149 (MQ=255) tCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACg < 7:283772/148‑1 (MQ=255) tAGCTGACACAGGACAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATCTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATT‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGtg > 4:330209/1‑148 (MQ=255) aGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGtgca > 5:289421/1‑149 (MQ=255) acaGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAAc < 7:107555/118‑1 (MQ=255) acaGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAAc > 8:107555/1‑118 (MQ=255) ggccaggccGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGcc < 3:276931/149‑1 (MQ=255) tcgcaatcctcaataccgttgccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATG‑CAGC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGt > 8:119798‑M1/82‑134 (MQ=255) gcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATG‑CACC‑GGGCAAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGt < 7:119798‑M1/53‑1 (MQ=255) gTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCaa > 5:354464/1‑148 (MQ=255) gTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCaa < 6:354464/148‑1 (MQ=255) aGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCgg > 6:323372/1‑111 (MQ=255) aGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCgg < 5:323372/111‑1 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCTGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 3:1689/1‑149 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 1:266480/1‑149 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 1:318018/1‑149 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGAGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 5:232279/1‑149 (MQ=255) cGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGcc > 2:272146/1‑149 (MQ=255) tAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCg > 6:194971/1‑149 (MQ=255) gCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCTGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTggg < 4:1689/149‑1 (MQ=255) ccATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGCTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACTCTATTTTTTGCTGCCCggagcg > 6:156796/1‑144 (MQ=255) cATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTggg > 6:233745/1‑147 (MQ=255) aTCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACA‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAg > 8:247683/1‑149 (MQ=255) aTCGATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAg > 1:133139/1‑149 (MQ=255) cTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGtt > 5:6330/1‑149 (MQ=255) tATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTg > 8:15326/1‑149 (MQ=255) tGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGc < 7:15326/148‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGccc < 2:266480/148‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGcc > 8:130545/1‑147 (MQ=255) ggCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAg > 2:80366/1‑148 (MQ=255) ggCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAg < 2:318018/148‑1 (MQ=255) gTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCAcc > 2:203676/1‑149 (MQ=255) ggccaccGGGAAAATCCGCGTATCCGGGGGCCAG‑CACCGGGGCAAATTGCTTGCGGGGAAAACCGGCCCCCGCCGGGCAACGTGGATTTCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTgg < 1:272146/144‑1 (MQ=255) ccGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACg > 4:20392/1‑148 (MQ=255) aCATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGc < 1:203676/149‑1 (MQ=255) aTCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑AACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCTTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTgag > 4:125340/1‑146 (MQ=255) tcggcgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGTGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCGGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGa < 3:330209/146‑1 (MQ=255) ccGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGAt > 4:86126/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGtt < 7:61208/84‑1 (MQ=255) gcgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGtt > 8:61208/1‑84 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg > 2:207138/1‑129 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg > 2:204836/1‑129 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg < 1:207138/129‑1 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg < 1:204836/129‑1 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgc < 1:80366/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgcg < 6:289421/149‑1 (MQ=255) cggtgCATGGCACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGtt < 7:200832‑M1/144‑1 (MQ=255) tGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCg < 5:194971/149‑1 (MQ=255) | CGGGGGAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCG > NC_002947/674189‑674482 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |