New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 674337 = | 56 (1.040) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 6.6% | intergenic (‑229/+77) | PP_0575/PP_0576 | membrane protein/lipoprotein |
? | NC_002947 | 674395 = | 61 (1.210) | intergenic (‑287/+19) | PP_0575/PP_0576 | membrane protein/lipoprotein |
AGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTCGGCACTGCCGCGCCATACCAGC > NC_002947/674253‑674543 | aacagcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgcatgcaccgtggcccggcgggagcgggtttacccgcgaagcaattggcccggtgccatgcaccg < 7:200832‑M2/5‑4 (MQ=255) ggccaggccGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGcc < 3:276931/149‑1 (MQ=255) gTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCaa < 6:354464/148‑1 (MQ=255) gTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCaa > 5:354464/1‑148 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCTGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 3:1689/1‑149 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 1:266480/1‑149 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 1:318018/1‑149 (MQ=255) tCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGAGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc > 5:232279/1‑149 (MQ=255) cGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGcc > 2:272146/1‑149 (MQ=255) tAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCg > 6:194971/1‑149 (MQ=255) gCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCTGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTggg < 4:1689/149‑1 (MQ=255) ccATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGCTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACTCTATTTTTTGCTGCCCggagcg > 6:156796/1‑144 (MQ=255) cATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTggg > 6:233745/1‑147 (MQ=255) aTCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACA‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAg > 8:247683/1‑149 (MQ=255) aTCGATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAg > 1:133139/1‑149 (MQ=255) cTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGtt > 5:6330/1‑149 (MQ=255) tATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTg > 8:15326/1‑149 (MQ=255) tGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGc < 7:15326/148‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGccc < 2:266480/148‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGcc > 8:130545/1‑147 (MQ=255) ggCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAg < 2:318018/148‑1 (MQ=255) ggCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAg > 2:80366/1‑148 (MQ=255) gTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCAcc > 2:203676/1‑149 (MQ=255) ggccaccGGGAAAATCCGCGTATCCGGGGGCCAG‑CACCGGGGCAAATTGCTTGCGGGGAAAACCGGCCCCCGCCGGGCAACGTGGATTTCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTgg < 1:272146/144‑1 (MQ=255) ccGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACg > 4:20392/1‑148 (MQ=255) aCATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGc < 1:203676/149‑1 (MQ=255) aTCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑AACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCTTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTgag > 4:125340/1‑146 (MQ=255) tcggcgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGTGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCGGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGa < 3:330209/146‑1 (MQ=255) ccGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGAt > 4:86126/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGtt > 8:61208/1‑84 (MQ=255) gcgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGtt < 7:61208/84‑1 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg < 1:207138/129‑1 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg < 1:204836/129‑1 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg > 2:207138/1‑129 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg > 2:204836/1‑129 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgc < 1:80366/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgcg < 6:289421/149‑1 (MQ=255) cggtgCATGGCACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGtt < 7:200832‑M1/144‑1 (MQ=255) tGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCg < 5:194971/149‑1 (MQ=255) ACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCg > 3:125340‑M1/1‑149 (MQ=255) accgtggcccggcgggagcgggtttacccgcgaagcaatttgcccggtgcatgCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgcgc < 7:119798‑M2/81‑1 (MQ=255) accgtggcccggcgggagcgggtttacccgcgaagcaattggcccgctgcatgCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCAACGGTATTGAGGATtgcga > 8:119798‑M2/54‑133 (MQ=255) CC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCgg > 6:232279‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGc < 2:295078‑M1/149‑1 (MQ=255) ccAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTg > 3:176105/1‑149 (MQ=255) aaTTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTTCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGc < 5:156796/149‑1 (MQ=255) aTTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCg > 4:18560/1‑149 (MQ=255) ttGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCgg < 2:133139/149‑1 (MQ=255) ggcgggagcgggtttacccgcgaagcaattggcccggtgcatgCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCgg > 2:51708‑M2/44‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCggg > 4:282707/1‑147 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTa < 3:20392/149‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTa < 8:200832/149‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTa < 1:295078/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGc > 1:16825/1‑138 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGc < 2:16825/138‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAg > 8:195469/1‑149 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAgtt < 6:6330/148‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAgttgtt < 7:195469/149‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAgttgt < 8:77756/148‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAgttgt > 7:77756/1‑148 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTc < 7:130545/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg < 6:37213/85‑1 (MQ=255) ccGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg > 5:37213/1‑85 (MQ=255) ccGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATc > 5:213637/1‑148 (MQ=255) ccGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATc < 6:213637/148‑1 (MQ=255) ccGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCt > 3:64592/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCt < 3:282707/149‑1 (MQ=255) gCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGc < 3:18560/149‑1 (MQ=255) cTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCt < 4:176105/149‑1 (MQ=255) gaagcaattggcccggtgcatgCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTc < 1:51708‑M2/127‑1 (MQ=255) cACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTCGGCACTGCcgc > 2:116743/1‑149 (MQ=255) tgcatgCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTCGGCACTGCCGCGCCAt < 3:86126‑M2/143‑1 (MQ=255) tgcatgCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTCGGCACTGCCGCGCCAt < 5:233745‑M2/143‑1 (MQ=255) caAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTCGGCACTGCCGCGCCATACCAGc > 5:93329/1‑149 (MQ=255) | AGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATG‑CACC‑GGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTGCGTTCTTCCGGGCTTGGCGGGTAGTTGTTCATGATCTGCTCGGCACTGCCGCGCCATACCAGC > NC_002947/674253‑674543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |