New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1880920 = | 68 (1.260) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.1% | coding (594/930 nt) | PP_1688 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 1880970 = | 47 (0.920) | coding (644/930 nt) | PP_1688 | LysR family transcriptional regulator |
GAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTCATCGTGCGGC > NC_002947/1880774‑1881068 | gAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGcc < 2:246611/148‑1 (MQ=255) gAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCg > 5:203843/1‑149 (MQ=255) aaGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGc > 4:200491/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGTTGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTg‑g < 1:89727/147‑1 (MQ=255) cccGGCGCATTGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGc > 6:103098/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCg < 8:92972/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCgg < 3:145013/149‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCt < 1:83929/149‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCt < 3:200491/149‑1 (MQ=255) cGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTgcgc > 8:44202/1‑149 (MQ=255) gTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCt > 7:232743/1‑149 (MQ=255) ttCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCtt < 5:103098/149‑1 (MQ=255) cATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTc < 8:96130/148‑1 (MQ=255) tgttgtGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTg‑g < 8:324423/117‑1 (MQ=255) tgttgtGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTg‑g > 7:324423/1‑117 (MQ=255) cggccgcacgatgaactcggccagacgggtgatgccaccatcgtgcaaggccatctgggtcagggcatcgatatcgtcgctgatcaatacagtgccgaattCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGc > 4:302772‑M1/102‑149 (MQ=255) ttgtGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCgg < 1:120156/149‑1 (MQ=255) ccTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTc > 3:132007/1‑149 (MQ=255) cTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGcttct > 5:239911/1‑101 (MQ=255) cTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGcttct < 6:239911/101‑1 (MQ=255) tgaactcggccagacgggtgatgccaccatcgtgcaaggccatctgggtcagggcatcgatatcgtcgctgatcaatacagtgccgaattCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCgg > 3:216521‑M1/91‑140 (MQ=255) tgaactcggccagacgggtgatgccaccatcgtgcaaggccatctgggtcagggcatcgatatcgtcgctgatcaatacagtgccgaattCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCgg < 4:216521‑M1/50‑1 (MQ=255) aCCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCa > 2:45291/1‑149 (MQ=255) ccGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATGCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACt > 1:109526/1‑149 (MQ=255) aCCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCATGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTAtt > 5:239335/1‑148 (MQ=255) ccTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCg < 3:139871/130‑1 (MQ=255) ccTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCg > 4:139871/1‑130 (MQ=255) gCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCgg > 4:173505/1‑135 (MQ=255) gCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCgg < 3:173505/135‑1 (MQ=255) gCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGAt > 3:283773/1‑147 (MQ=255) gCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGAt > 5:25954/1‑147 (MQ=255) gagCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGc > 1:338506/1‑148 (MQ=255) cTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGat < 6:25954/149‑1 (MQ=255) tGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTAt > 7:52856/1‑134 (MQ=255) tGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGGGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTAt < 8:52856/134‑1 (MQ=255) gTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGa > 6:204899/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATg > 3:59772/1‑149 (MQ=255) ccTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGc > 4:68774/1‑149 (MQ=255) cTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGcttctt > 7:207637/1‑70 (MQ=255) cTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGcttctt < 8:207637/70‑1 (MQ=255) cACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGa < 6:203843/149‑1 (MQ=255) aCGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGGCGCTTCTTGCGCTGAGGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGaa < 1:36487/103‑1 (MQ=255) aCGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGc < 6:119918/143‑1 (MQ=255) aCGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGc > 5:119918/1‑143 (MQ=255) aCGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGAc > 4:287050/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGAGGCCTTGCCCCGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGCAGGATGCCCCCTACTTGCGCTC‑GGGCTTCATGCGGGACCGCCTGCGCTTCGaa > 2:36487/1‑102 (MQ=255) gCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATg < 3:190842/79‑1 (MQ=255) gCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATg > 4:190842/1‑79 (MQ=255) gCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGAccc < 5:219592/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGGGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCACTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTCTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGAcc > 3:34524/1‑146 (MQ=255) cGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGTCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCg < 3:290073/134‑1 (MQ=255) cGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGTCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCg > 4:290073/1‑134 (MQ=255) aGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATg < 8:232743/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCt > 6:18321/1‑138 (MQ=255) ggCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCt < 5:18321/138‑1 (MQ=255) cgcgGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCa < 3:68774/149‑1 (MQ=255) gcgGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCAc < 3:287050/149‑1 (MQ=255) gCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTg < 3:65430/103‑1 (MQ=255) gCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTg > 4:65430/1‑103 (MQ=255) gCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGAtg > 1:204573/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGAtg < 2:109526/149‑1 (MQ=255) aCCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGAtggt < 4:283773/149‑1 (MQ=255) aCCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGAtggt < 4:132007/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCAcc > 6:177320/1‑149 (MQ=255) gtgtTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGa < 4:82028/115‑1 (MQ=255) gtgtTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGa > 3:82028/1‑115 (MQ=255) gCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGcc > 7:166849/1‑149 (MQ=255) cTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCTGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATCTCGATGCCCTGACCCAGAt < 6:233570/114‑1 (MQ=255) cTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCTGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGAt > 5:233570/1‑114 (MQ=255) tCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGa < 4:59772/147‑1 (MQ=255) tCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAg < 4:8529/148‑1 (MQ=255) cGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTc < 5:204899/149‑1 (MQ=255) gTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTCAt > 3:158847/1‑149 (MQ=255) tGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTCATc < 8:166849/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTCATCGTGc < 2:338506/149‑1 (MQ=255) CCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTCATCGTGCGGc < 4:153269‑M1/149‑1 (MQ=255) | GAAGACCAGCTGCTGGCCCGGCGCATCGCCCGCATCCCGTTCATTTGTTGTGCCTCACCCGGTTACCTGCAGAGCGCTGGCGTACCTGCCACGCCCGAGGCCTTGCGCGGGCACCGTTGCCTGGTGTTTCGCTATCCGGTGGATGGCCGCTTCTTGCGCTG‑GGGCTTCATGCGGGACGGCCTGCGCTTCGAAGCGGAATTCGGCACTGTATTGATCAGCGACGATATCGATGCCCTGACCCAGATGGCCTTGCACGATGGTGGCATCACCCGTCTGGCCGAGTTCATCGTGCGGC > NC_002947/1880774‑1881068 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |