New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1887956 = | 58 (1.070) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.8% | coding (2317/3480 nt) | PP_1695 | sodium‑solute symporter/two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | 1888001 = | 42 (0.810) | coding (2272/3480 nt) | PP_1695 | sodium‑solute symporter/two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
AAGGCGGCAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGCCCGGCATCGGGTTGCCGATCAGCTCGATCACCCGG > NC_002947/1887808‑1888095 | aaGGCGGCAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGt < 8:18426/149‑1 (MQ=255) aaGGCGGCAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGt < 3:276975/149‑1 (MQ=255) aGGCGGCAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTg < 4:294840/149‑1 (MQ=255) gatgcgccagggccgcgcgcactcctccgagcggctgttccccaatggccgggtgatcgagctgatcggcaacccgatgccgggcggtggctttgtcatgagcttcaccgacatcaccccgttccgcgaggccgagcaggcccTgcgc < 5:342561‑M1/5‑1 (MQ=255) gatgcgccagggccgcgcgcactcctccgagcggctgttccccaatggccgggtgatcgagctgatcggcaacccgatgccgggcggtggctttgtcatgagcttcaccgacatcaccccgttccgcgaggccgagcaggcccTgcg > 7:149278‑M1/144‑147 (MQ=255) gcAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTc > 1:44165/1‑149 (MQ=255) cAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTcc > 2:203886/1‑149 (MQ=255) agagAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCg > 4:87614/1‑149 (MQ=255) agaAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGc > 7:112849/1‑148 (MQ=255) aaGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCAcgc > 4:181527/1‑149 (MQ=255) ccGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGtt < 2:50456/149‑1 (MQ=255) cGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTg < 4:276329/149‑1 (MQ=255) cGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTg < 4:239714/149‑1 (MQ=255) gcgTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAg < 1:238056/149‑1 (MQ=255) gagTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACTGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTTGCTTCGGACAGCTCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAg < 5:301910/147‑1 (MQ=255) ggTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcgtt < 2:21223/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATc < 1:132071/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATc > 6:98990/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATc < 3:181527/149‑1 (MQ=255) tCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAg > 6:63149/1‑149 (MQ=255) tCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAg < 7:33520/149‑1 (MQ=255) cccaatggccgggtgatcgagctgatcggcaacccgatgccgggcggtggctttgtcatgagcttcaccgacatcaccccgttccgcgaggccgagcaggcccTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCa > 5:274630‑M1/104‑148 (MQ=255) cATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcatt < 4:63012/136‑1 (MQ=255) cATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcatt > 3:63012/1‑136 (MQ=255) aTGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAgg < 8:112849/148‑1 (MQ=255) aTGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAgg < 1:203886/148‑1 (MQ=255) aTGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAgg < 4:223239/148‑1 (MQ=255) aCGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATcg < 1:300511/135‑1 (MQ=255) aCGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATcg > 2:300511/1‑135 (MQ=255) ggcggcCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcgtt > 3:74515/1‑126 (MQ=255) ggcggcCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcgtt < 4:74515/126‑1 (MQ=255) gcggcCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGc > 5:46615/1‑149 (MQ=255) cggcCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGcc < 2:44165/149‑1 (MQ=255) cggcCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGcc > 1:112521/1‑149 (MQ=255) ggcCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCt < 3:87614/149‑1 (MQ=255) tcgagctgatcggcaacccgatgccatgcggtggctttgtcatgagcttcaccgacatcaccccgttccgcgaggccgagcaggcccTgc > 1:276317‑M1/88‑90 (MQ=255) cAGGAAGCGGGTCTTTGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGTCCTGCTCGGCCTcgc < 6:52705/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTcgc > 1:173157/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCCGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTcgc > 1:65295/1‑149 (MQ=255) gagctgatcggcaacccgatgccgggcggtggctttgtcatgagcttcaccgacatcaccccgttccgcgaggccgagcaggcccTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAgg < 4:35411‑M1/47‑1 (MQ=255) gagctgatcggcaacccgatgccgggcggtggctttgtcatgagcttcaccgacatcaccccgttccgcgaggccgagcaggcccTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAgg > 3:35411‑M1/86‑132 (MQ=255) aGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCCGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTcgcg < 2:65295/149‑1 (MQ=255) gAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCgg > 6:46212/1‑148 (MQ=255) gggTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACggg < 6:46615/149‑1 (MQ=255) gggTCGTGGTGGTGCTCACCGCTGGGGCCTGGCGCTTTGCGTCGGACAGCGCCTGGTGCACCTGCGCCCGTTCGGTGGTGCTCTCCGCCACGGGGTGCGCTAGGCGTTCGTTGGCAGCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACggg < 5:199288/149‑1 (MQ=255) gTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGt < 5:46212/149‑1 (MQ=255) ggAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcgtt > 4:5601/1‑105 (MQ=255) ggAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGcgttcgtt < 3:5601/105‑1 (MQ=255) ggAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGAt < 2:173157/147‑1 (MQ=255) ccGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCt > 4:211078/1‑148 (MQ=255) cGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGAc < 5:63149/148‑1 (MQ=255) gCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACa > 6:342561/1‑147 (MQ=255) ccTGGCTCTTGGCTTCGGAAAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATAGCTAAGGGCCTGCTAGGCCTCGCTGAACTGGTTGATGTCGGTGAAGCTCATGACa > 7:183981/1‑146 (MQ=255) cTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGc > 8:263098/1‑149 (MQ=255) gCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCAc < 3:211078/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGccc > 3:29770/1‑149 (MQ=255) gACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGcc < 4:258781/93‑1 (MQ=255) gACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGcc > 3:258781/1‑93 (MQ=255) gACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGCCCGGCATCgg < 5:98990/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCCCCGCCCGGCATCGGGtt > 8:287659/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCCCCCGGCATCGGGTTGcc > 6:203970/1‑148 (MQ=255) aaCTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGt > 4:246611/1‑101 (MQ=255) aaCTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGt < 3:246611/101‑1 (MQ=255) aGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGCCCGGCATCGGGTTGCCGATCAGCTCGATCACCCg < 3:156271/149‑1 (MQ=255) gtgcGTTGGTGCGAGCCGCCAAGCGTTGAGCACTGCGTTCGTTGGCATCGCGCATGGACTGCTCGTCCTCGCGTAACGGGGTGATGTCGTTGAAGCTCATGAAAAAGCAACCGCCAGGCATCGGGTTGCCGATCAGCTCGATCACCCgg < 8:183981/146‑1 (MQ=255) ttCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGCCCGGCATCGGGTTGCCGATCa < 6:191156/134‑1 (MQ=255) ttCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGCCCGGCATCGGGTTGCCGATCa > 5:191156/1‑134 (MQ=255) | AAGGCGGCAGAGAAAAGCCGTGCGGCGTTCAACGGTTGCATCAGGTCATGGCTGACGGCGGCCAGGAAGCGGGTCTTGGAGTTGCTCACCGCTTCGGCCTGGCTCTTGGCTTCGGACAGCGCCTGGTTCAACTGCGACAGTTCGTGGGTGCGCTCCGCCACGCGTTGCTCAAGGCGTTCGTTGGCATCGCGCAGGGCCTGCTCGGCCTCGCGGAACGGGGTGATGTCGGTGAAGCTCATGACAAAGCCACCGCCCGGCATCGGGTTGCCGATCAGCTCGATCACCCGG > NC_002947/1887808‑1888095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |