New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4298253 = | 45 (0.830) | 6 (0.120) | 6/250 | NT | 13.0% | coding (39/354 nt) | PP_3769 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4298310 = | 37 (0.710) | coding (96/354 nt) | PP_3769 | hypothetical protein |
TGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCATGACCGTACGG > NC_002947/4298109‑4298401 | tGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGTCCGTAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑Gccc < 5:250801/149‑1 (MQ=255) gtcgtcCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCt < 4:317475/148‑1 (MQ=255) gtcCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGcc < 5:337903/149‑1 (MQ=255) cccTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCa > 3:54910/1‑148 (MQ=255) cccTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCa > 3:195664/1‑148 (MQ=255) acacAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGc < 7:32421/148‑1 (MQ=255) gcgcgtaatagaccggctggcgctcgacatacaccgtacggtcagtggccgccataaaccgtcgcccccaccacggcgccgaccactgccgcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTg < 1:71082‑M1/23‑1 (MQ=255) ccTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGATCCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTg < 4:62577/149‑1 (MQ=255) ccTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCTGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGTCCATCAGCGGGCCTg < 4:79347/149‑1 (MQ=255) cTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTgc < 8:306096/149‑1 (MQ=255) cTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTgc < 5:158732/149‑1 (MQ=255) aCCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTGCTGCGAGGTTGTGTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTACTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCCGCGGGCCTgcagca > 2:258506/1‑149 (MQ=255) aatagaccggctggcgctcgacatacaccgtacggtcatggccgccataaaccgtcgcccccaccacggcgccgaccactgccgcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCagcagc < 6:88848‑M1/30‑1 (MQ=255) ccTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCAcgg < 3:178547/149‑1 (MQ=255) cTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCCTCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTa > 6:62870/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTAt > 7:22497/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTGTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTAt > 4:68107/1‑149 (MQ=255) agagGCCGGAGTCATAGTAACAAGACCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCCGCGCACGGCGGCTATggcggcact > 7:52202/1‑146 (MQ=255) agGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATgg < 4:54910/149‑1 (MQ=255) acaccgtacggtcatggccgccataaaccgtcgcccccaccacggcgccgaccactgccgcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATgg > 5:88848‑M1/96‑149 (MQ=255) ggCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATggg < 8:105727/149‑1 (MQ=255) cgCCGGTGTCATAGTTACAGGGGGCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGTGGTTGTGTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGGCCTGCTGGGCGGTCTCGCTGGCCTTCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATg < 1:258506/147‑1 (MQ=255) ccGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCAcgg > 8:169775/1‑128 (MQ=255) ccGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCAcgg < 7:169775/128‑1 (MQ=255) gtacggtcatggccgccataaaccgtcgcccccaccacggcgccgaccactgccgcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtg > 2:71082‑M1/91‑149 (MQ=255) tCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtggtgg > 8:18968/1‑149 (MQ=255) aTAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggtt > 5:140423/1‑149 (MQ=255) aTAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggtt > 5:143978/1‑149 (MQ=255) aTAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggtt > 7:95026/1‑149 (MQ=255) tAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg > 8:200513/1‑149 (MQ=255) gTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttggt < 5:301699/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATgg < 5:62870/149‑1 (MQ=255) cccGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCATGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg > 6:173969/1‑148 (MQ=255) ccGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTAGTTTTATGAACCGACTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATAAGAGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATCGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGACCGGGa > 2:85051/1‑149 (MQ=255) cGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGAc > 8:237140/1‑149 (MQ=255) gTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACtt > 2:210120/1‑149 (MQ=255) ggggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg < 5:165073/128‑1 (MQ=255) ggggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg > 6:165073/1‑128 (MQ=255) gggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCt < 6:143978/148‑1 (MQ=255) cTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCgg < 4:195664/148‑1 (MQ=255) tGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCgt < 3:68107/148‑1 (MQ=255) gcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtgg > 1:296543‑M1/37‑96 (MQ=255) gcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtgg < 2:296543‑M1/60‑1 (MQ=255) cATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGa > 3:141689/1‑149 (MQ=255) tttCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCGAGGCCATCAGCTGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGGGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGc < 8:90483/145‑1 (MQ=255) aTTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTc > 2:270489/1‑112 (MQ=255) aTTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTc < 1:270489/112‑1 (MQ=255) gAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTTGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTAt < 5:173969/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATggcggc > 2:221625/1‑147 (MQ=255) ctgctgGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATggcggc < 1:221625/147‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGCGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCa < 6:215749/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGCGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCa > 5:215749/1‑149 (MQ=255) ggT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCATGACCGTAc > 5:261914/1‑149 (MQ=255) ggT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCATGACCGTAc > 1:227928/1‑149 (MQ=255) T‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCATGACCGTACgg > 7:18968‑M1/1‑149 (MQ=255) | TGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGT‑GCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCATGACCGTACGG > NC_002947/4298109‑4298401 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |