New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4298253 = | 45 (0.830) | 6 (0.120) | 6/250 | NT | 13.0% | coding (39/354 nt) | PP_3769 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4298310 = | 37 (0.710) | coding (96/354 nt) | PP_3769 | hypothetical protein |
GGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTATTACGCGCCGCCGCCGGTGTACGTACAACCGC > NC_002947/4298163‑4298458 | gtacggtcatggccgccataaaccgtcgcccccaccacggcgccgaccactgccgcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtg > 2:71082‑M1/91‑149 (MQ=255) tCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtggtgg > 8:18968/1‑149 (MQ=255) aTAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggtt > 5:143978/1‑149 (MQ=255) aTAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggtt > 5:140423/1‑149 (MQ=255) aTAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggtt > 7:95026/1‑149 (MQ=255) tAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg > 8:200513/1‑149 (MQ=255) gTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttggt < 5:301699/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATgg < 5:62870/149‑1 (MQ=255) cccGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCATGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg > 6:173969/1‑148 (MQ=255) ccGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTAGTTTTATGAACCGACTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATAAGAGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATCGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGACCGGGa > 2:85051/1‑149 (MQ=255) cGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGAc > 8:237140/1‑149 (MQ=255) gTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACtt > 2:210120/1‑149 (MQ=255) ggggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg < 5:165073/128‑1 (MQ=255) ggggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg > 6:165073/1‑128 (MQ=255) gggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCt < 6:143978/148‑1 (MQ=255) cTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCgg < 4:195664/148‑1 (MQ=255) tGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCgt < 3:68107/148‑1 (MQ=255) gcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtgg < 2:296543‑M1/60‑1 (MQ=255) gcacctagaagtggtcccggcccataccaaccaccaTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtgg > 1:296543‑M1/37‑96 (MQ=255) cATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGa > 3:141689/1‑149 (MQ=255) tttCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCGAGGCCATCAGCTGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGGGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGc < 8:90483/145‑1 (MQ=255) aTTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTc > 2:270489/1‑112 (MQ=255) aTTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTc < 1:270489/112‑1 (MQ=255) gAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTTGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTAt < 5:173969/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATggcggc < 1:221625/147‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATggcggc > 2:221625/1‑147 (MQ=255) ctgctgGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGCGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCa > 5:215749/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGCGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCa < 6:215749/149‑1 (MQ=255) ccatgcccatggccgccatagccgccgtgcgctgctgcaggcccgctgatggccagggcaTGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGc > 1:296543‑M2/61‑96 (MQ=255) ccatgcccatggccgccatagccgccgtgcgctgctgcaggcccgctgatggccagggcaTGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGc < 2:296543‑M2/36‑1 (MQ=255) ggTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTAc > 5:261914/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTAc > 1:227928/1‑149 (MQ=255) catgcccatggccgccatagccgccgtgcgctgctgcaggcccgctgatggccagggcaTGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTAc > 2:71082‑M2/60‑149 (MQ=255) TGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACgg > 7:18968‑M1/1‑149 (MQ=255) ccgggCCATGAGGGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGGGGCTGGTTTGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTTTGGCGGCCA‑TGACCGTACGgtgt < 8:52202/146‑1 (MQ=255) ccatggccgccatagccgccgtgcgctgctgcaggcccgctgatggccagggcaTGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGgtgt > 5:88848‑M2/55‑149 (MQ=255) CCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGgtg < 3:31935‑M1/148‑1 (MQ=255) CCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGGCGGCGCCGTGGTGGGGGCTACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGgtgt > 1:210120‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTa > 4:141689‑M1/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGGTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAg > 2:274883/1‑149 (MQ=255) gCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAgcgc < 6:261914/149‑1 (MQ=255) caggGCACGGCGGCTATGGCGGCGATGGGCTTGGTGGTTGGTTTGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCGGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGGCGAGCGCCAGCCGGTCTAt < 8:95026/149‑1 (MQ=255) gctgctgcaggcccgctgatggccagggcaTGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTAtt < 6:88848‑M2/119‑1 (MQ=255) agcGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGGGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTAtt < 6:140423/149‑1 (MQ=255) cACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCTGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTATTAcgc < 4:31935/149‑1 (MQ=255) aCGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCt < 6:303117/141‑1 (MQ=255) aCGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCt > 5:303117/1‑141 (MQ=255) caggcccgctgatggccagggcaTGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCACTGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTATTACgcgc < 1:71082‑M2/126‑1 (MQ=255) cTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGc > 6:237249/1‑128 (MQ=255) cTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGc < 5:237249/128‑1 (MQ=255) gcCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGTCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTATTACGCGCCGCCGCCGGTgtac < 1:85051/149‑1 (MQ=255) tggtggTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTATTACGCGCCGCCGCCGGTGTACGTACAACCGc < 8:22497/149‑1 (MQ=255) | GGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGGACCACTTCTAGGTGCGGCAGTGGTCGGCGCCGTGGTGGGGGCGACGGTTTATGGCGGCCA‑TGACCGTACGGTGTATGTCGAGCGCCAGCCGGTCTATTACGCGCCGCCGCCGGTGTACGTACAACCGC > NC_002947/4298163‑4298458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |