New junction evidence | |||||||||||
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TCTGCTGCAAGGTGGTGCCAAAACCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGG > NC_002947/4978770‑4979066 | tCTGCTGCAAGGTGGTGCCAAAACCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACC > 1:164704‑M1/1‑149 (MQ=255) ctgcggCAAGCTGGGGCCAACACCGTGCAGGCCTGGGGCGCCGACCTGCGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGACGGCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCt < 6:286417/149‑1 (MQ=255) gctgcAAGGTGGTGCCAAAACCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCtgt > 5:284278/1‑149 (MQ=255) 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ccAAAACCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGcc > 5:152457/1‑149 (MQ=255) cAAAACCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCcg > 4:295911/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCcg‑g > 4:149444/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCcg‑g > 6:28143/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCAGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCcg‑g > 1:21484/1‑149 (MQ=255) 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cGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgtctcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcacccc > 1:240505‑M2/1‑31 (MQ=255) cGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGACGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAgg > 3:41502/1‑149 (MQ=255) gATCACCaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcc > 5:43494‑M1/1‑7 (MQ=255) gATCACCaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcc > 7:197981‑M1/1‑7 (MQ=255) gATCACCaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcc > 3:18050‑M1/1‑7 (MQ=255) gATCACCaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcc > 6:152457‑M1/1‑7 (MQ=255) gATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCTG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcc > 5:141982‑M2/1‑30 (MQ=255) gATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGt < 4:259025/149‑1 (MQ=255) ccaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaac > 5:28143‑M1/1‑2 (MQ=255) ccaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcag > 2:313318‑M1/1‑2 (MQ=255) ccaccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcag < 1:313318‑M1/128‑127 (MQ=255) ccTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaac < 5:350615‑M2/149‑125 (MQ=255) ccTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGCCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTGAGGCACGACAATGGCAGGCTCAAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATATGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAg > 2:52553/1‑149 (MQ=255) caccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaacg > 7:96161‑M1/1‑1 (MQ=255) caccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaa > 6:125129‑M1/1‑1 (MQ=255) caccgccggcaacccggctgcacaggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaa < 5:125129‑M1/147‑147 (MQ=255) cTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGt < 5:103888/63‑1 (MQ=255) cTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGt > 6:103888/1‑63 (MQ=255) cTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAgg > 1:328053/1‑149 (MQ=255) | TCTGCTGCAAGGTGGTGCCAAAACCGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGA‑ACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGG > NC_002947/4978770‑4979066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |