New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4978918 | 51 (0.940) | 8 (0.160) | 6/244 | NT | 13.6% | coding (504/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
? | NC_002947 | = 4978941 | 54 (1.060) | coding (481/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
CGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACG > NC_002947/4978794‑4979089 | cGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTg > 7:96161‑M2/1‑148 (MQ=255) gTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTgg > 5:28143‑M2/1‑147 (MQ=255) ttCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTg < 5:125129‑M2/147‑2 (MQ=255) ttCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTg > 6:125129‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatc > 3:18050‑M2/1‑142 (MQ=255) ggCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatc > 5:43494‑M2/1‑142 (MQ=255) ggCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatc > 7:197981‑M2/1‑142 (MQ=255) ggCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatc > 6:152457‑M2/1‑142 (MQ=255) gggTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACg > 1:294543/1‑149 (MQ=255) gggTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACg > 2:39344/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACgg < 3:149444/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACgg < 6:154340/149‑1 (MQ=255) cGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCg > 5:90153/1‑149 (MQ=255) cTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTgg > 2:313318‑M2/1‑126 (MQ=255) cTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTgg < 1:313318‑M2/128‑3 (MQ=255) cTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCt < 6:284278/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGcc > 1:293201/1‑148 (MQ=255) aCTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGa < 5:103500/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGaa < 4:1434/149‑1 (MQ=255) cggcggTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCGAGCTGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGt > 1:115339/1‑149 (MQ=255) ggcggTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCt > 3:285662/1‑149 (MQ=255) ctcGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTTGGATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGcgcg > 1:76904/1‑149 (MQ=255) tcGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTgg > 7:57564/1‑126 (MQ=255) tcGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTgg < 8:57564/126‑1 (MQ=255) gAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTc > 7:49110/1‑139 (MQ=255) gAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTc < 8:49110/139‑1 (MQ=255) gAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGcgt < 8:161645/146‑1 (MQ=255) gAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGAGcgtcgt > 2:51654/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAg < 6:90153/149‑1 (MQ=255) aGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTgcg < 5:60110/136‑1 (MQ=255) aGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTgcg > 6:60110/1‑136 (MQ=255) gTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGa < 1:39344/149‑1 (MQ=255) ttGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGAc < 3:196960/149‑1 (MQ=255) tCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGCTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAAt > 5:191863/1‑149 (MQ=255) gCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATgg < 2:76904/149‑1 (MQ=255) gCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATg < 3:295911/148‑1 (MQ=255) cGATCGCCTGCAGGCTGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATgg > 8:239807/1‑147 (MQ=255) gATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAg > 1:40290/1‑149 (MQ=255) ccggccggGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTa < 2:21484/149‑1 (MQ=255) cggGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGcgtcg > 8:286838/1‑112 (MQ=255) cggGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGcgtcg < 7:286838/112‑1 (MQ=255) gTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTg > 7:93174/1‑148 (MQ=255) gTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGt < 4:285662/149‑1 (MQ=255) gatgaAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAg > 2:215603/1‑149 (MQ=255) atgaAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGcgt > 2:55017/1‑103 (MQ=255) atgaAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGcgt < 1:55017/103‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGAc < 2:293201/149‑1 (MQ=255) gTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGcc < 2:40290/149‑1 (MQ=255) tCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCg > 3:259025/1‑149 (MQ=255) tGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTc > 6:288067/1‑149 (MQ=255) gATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTc < 7:239807/147‑1 (MQ=255) ccGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCTG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccagg < 6:141982‑M2/149‑118 (MQ=255) ccGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagcggcgcgcctcaggtcggcaccccagg < 5:295503‑M2/149‑118 (MQ=255) cGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggc < 2:111654‑M2/149‑119 (MQ=255) cGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcacccc < 2:240505‑M2/145‑115 (MQ=255) cGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgtctcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcacccc > 1:240505‑M2/1‑31 (MQ=255) cGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGACGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAgg > 3:41502/1‑149 (MQ=255) gATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCTG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcc > 5:141982‑M2/1‑30 (MQ=255) gATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGt < 4:259025/149‑1 (MQ=255) ccTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagtggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaac < 5:350615‑M2/149‑125 (MQ=255) ccTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGCCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTGAGGCACGACAATGGCAGGCTCAAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATATGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAg > 2:52553/1‑149 (MQ=255) cTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGt > 6:103888/1‑63 (MQ=255) cTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGt < 5:103888/63‑1 (MQ=255) cTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAgg > 1:328053/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCg > 8:287579/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTGCCG‑GCGGTggtgatcggcaacatccagaccgccgacttcatcaacccggccggcctgcaggcgatcggcgacaacctgttcctcgagaccgccgccagcggcgcgcctcaggtcggcaccccaggcctgaacggttttggc > 6:295503‑M2/1‑16 (MQ=255) ccGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGt < 5:155424/135‑1 (MQ=255) ccGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGt > 6:155424/1‑135 (MQ=255) ggTTGCCT‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGGAAAGGGTGAAGGTGTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGTCTATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGATGGTACCTTCACgg < 6:191863/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAATGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACgg < 8:93174/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACgg < 5:288067/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACgg < 2:115339/149‑1 (MQ=255) ccG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAg > 6:312588/1‑132 (MQ=255) ccG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAg < 5:312588/132‑1 (MQ=255) tggtgATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACg < 2:6894/149‑1 (MQ=255) | CGTTCAGGCCTGGGGTGCCGACCTGAGGCGCGCCACTGGCGGCGGTCTCGAGGAACAGGTTGTCGCCGATCGCCTGCAGGCCGGCCGGGTT‑GATGAAGTCGGCGGTCTGGATGTTGCCGATCACCTGTGCAGCCGGGTTGCCG‑GCGGTGGTGATCGACACGGTGCCGTCCTGGCCAACGGTGAAGGTCTGCGCGTCGTTAGGCACGACAATGGCAGGCTCCAGGGCGTAGCCGTTGTCAGTGACGATCTGGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACG > NC_002947/4978794‑4979089 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |