New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5269812 = | 40 (0.740) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.1% | coding (527/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
? | NC_002947 | 5269874 = | 40 (0.780) | coding (465/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
GCCAGCGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCC > NC_002947/5269665‑5269959 | gaccattttgctacagaccttgtgcaacattgccgtgggcatgccggccctgtatgtcacgggggaggagtcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgca < 5:172334‑M1/1‑1 (MQ=255) ccagcGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTTGGCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGAt > 1:95005/1‑149 (MQ=255) ccagcGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATc < 2:281079/149‑1 (MQ=255) cattttgctacagaccttgtgcatcattgccgtgggcatgccggccctgtatgtcacgggggaggagtcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATCg < 8:147306‑M1/4‑1 (MQ=255) cattttgctacagaccttgtgcaacattgccgtgggcatgccggccctgtatgtcacgggggaggagtcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATc < 1:176210‑M1/3‑1 (MQ=255) cGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGt < 6:189535/149‑1 (MQ=255) tcctTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCAc > 6:220333/1‑149 (MQ=255) ccGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCtt > 3:262109/1‑149 (MQ=255) aGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCGTAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCAc < 5:220323/128‑1 (MQ=255) aGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCGTAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCAc > 6:220323/1‑128 (MQ=255) gAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGAccc < 2:95005/149‑1 (MQ=255) gATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGt < 6:10081/116‑1 (MQ=255) gATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGt > 5:10081/1‑116 (MQ=255) ccGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTg < 8:287017/149‑1 (MQ=255) tACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGc > 3:292139/1‑148 (MQ=255) aCCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCaa > 4:101308/1‑149 (MQ=255) acgggggaggagtcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGtctc > 6:172334‑M1/91‑149 (MQ=255) tAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCa < 6:62244/149‑1 (MQ=255) gcgcACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg < 4:139680/148‑1 (MQ=255) gcgcACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg < 8:287556/148‑1 (MQ=255) cACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGttt < 4:292139/149‑1 (MQ=255) tcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg > 3:203131‑M1/79‑144 (MQ=255) tcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg < 4:203131‑M1/66‑1 (MQ=255) cAGCACCGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCGCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGCCCCGCGCCGAGGCAAAGATCGTCGCGATGCCGCTTTCgg > 5:228494/1‑149 (MQ=255) gCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCAc > 3:239730/1‑149 (MQ=255) tgCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCt < 4:330422/147‑1 (MQ=255) cTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTtct > 7:191721/1‑94 (MQ=255) cTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTtct < 8:191721/94‑1 (MQ=255) tttCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtcatca > 8:23421/1‑141 (MQ=255) tttCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtcatca < 7:23421/141‑1 (MQ=255) gcgcACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAg < 7:65583/144‑1 (MQ=255) gcgcACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAg > 8:65583/1‑144 (MQ=255) ccTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg < 5:220333/149‑1 (MQ=255) gggCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgggg > 4:41997/1‑148 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtc > 5:340104/1‑123 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtc < 6:340104/123‑1 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAg > 5:106028/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAg < 4:262109/149‑1 (MQ=255) cACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGc > 2:55965/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGcc < 1:55965/149‑1 (MQ=255) gccgccCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTg > 8:225140/1‑127 (MQ=255) gccgccCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg > 6:44264/1‑139 (MQ=255) gccgccCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg < 5:44264/139‑1 (MQ=255) ggCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCcgcg > 7:147306/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACct > 1:258261/1‑149 (MQ=255) ggTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACctgct > 7:8307/1‑149 (MQ=255) ggTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACctg < 4:239730/147‑1 (MQ=255) gTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGActc < 3:41997/149‑1 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtgctgctgc < 4:147130/139‑1 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtgctgctgc > 3:147130/1‑139 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGActcctc < 8:8307/147‑1 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTccc < 3:101308/149‑1 (MQ=255) | GCCAGCGAGCCCTCCTTGGTCACGTGGCCGACCAGGAAGATTGCCGTACCGCTTT‑GCTTGGCATAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCC > NC_002947/5269665‑5269959 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |