New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5269812 = | 40 (0.740) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.1% | coding (527/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
? | NC_002947 | 5269874 = | 40 (0.780) | coding (465/1371 nt) | radA | DNA repair enzyme |
TAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTC > NC_002947/5269728‑5270021 | tAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCa < 6:62244/149‑1 (MQ=255) gcgcACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg < 4:139680/148‑1 (MQ=255) gcgcACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg < 8:287556/148‑1 (MQ=255) cACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGttt < 4:292139/149‑1 (MQ=255) tcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg < 4:203131‑M1/66‑1 (MQ=255) tcgcagcagcaggtggccatgcgctcgcggcggctgggcctaccccaggaccaactcaaggtgatgaccgaaacctgcATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAg > 3:203131‑M1/79‑144 (MQ=255) cAGCACCGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCGCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGCCCCGCGCCGAGGCAAAGATCGTCGCGATGCCGCTTTCgg > 5:228494/1‑149 (MQ=255) gCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCAc > 3:239730/1‑149 (MQ=255) tgCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCt < 4:330422/147‑1 (MQ=255) tttCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtcatca > 8:23421/1‑141 (MQ=255) tttCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtcatca < 7:23421/141‑1 (MQ=255) gcgcACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAg > 8:65583/1‑144 (MQ=255) gcgcACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAg < 7:65583/144‑1 (MQ=255) ccTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg < 5:220333/149‑1 (MQ=255) gggCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgggg > 4:41997/1‑148 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtc < 6:340104/123‑1 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGtc > 5:340104/1‑123 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAg < 4:262109/149‑1 (MQ=255) gCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAg > 5:106028/1‑149 (MQ=255) cACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGc > 2:55965/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGcc < 1:55965/149‑1 (MQ=255) gccgccCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTg > 8:225140/1‑127 (MQ=255) gccgccCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg < 5:44264/139‑1 (MQ=255) gccgccCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTgg > 6:44264/1‑139 (MQ=255) ggCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCcgcg > 7:147306/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACct > 1:258261/1‑149 (MQ=255) ggTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACctgct > 7:8307/1‑149 (MQ=255) ggTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACctg < 4:239730/147‑1 (MQ=255) gTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGActc < 3:41997/149‑1 (MQ=255) ctgcatcgagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactcgatGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGa > 3:203131‑M2/67‑144 (MQ=255) ctgcatcgagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactcgatGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGa < 4:203131‑M2/78‑1 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtgctgctgc > 3:147130/1‑139 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtgctgctgc < 4:147130/139‑1 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGActcctc < 8:8307/147‑1 (MQ=255) gATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTccc < 3:101308/149‑1 (MQ=255) gagacgatcattgccacggcgcgggtcgagaagccgcgggtaatggtgatcgactcgatGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGt > 6:172334‑M2/60‑149 (MQ=255) AGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGcc < 6:145963‑M1/122‑1 (MQ=255) AGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGcc > 5:145963‑M1/1‑122 (MQ=255) ccATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAgg < 6:106028/149‑1 (MQ=255) cgttACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACa < 2:221326/140‑1 (MQ=255) cATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCTCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATagatcg > 1:221326/1‑144 (MQ=255) cATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCtcctgctgc > 4:46890/1‑124 (MQ=255) cATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAggg > 3:227481/1‑149 (MQ=255) aTTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGc > 2:176210/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCa > 1:216655/1‑149 (MQ=255) cTTCTCGCGCCGCGCCGTCGCAATGTTCGTGTCGATGCAGGTTTCGGTGATCACCTTGAGGTGGGCCTGGGGTAGGCCCAGCCTCCGCGTGCGCATGGCCAGCTTCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGTGCCGGCATGccaa < 6:228494/149‑3 (MQ=255) cccGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATg > 6:30749/1‑149 (MQ=255) gCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGt > 5:324571/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCt > 4:306324/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCt > 2:108872/1‑149 (MQ=255) aTCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTa < 6:324571/148‑1 (MQ=255) cgatGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGATGCACAAGGTCTGTAGCAAAATg < 8:147306‑M2/145‑1 (MQ=255) gatGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATg < 1:176210‑M2/145‑1 (MQ=255) tGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTc < 5:172334‑M2/148‑1 (MQ=255) | TAGCGCACCAGCAACGCTGTGCTTTCGCGCACCTGGGCCACGCCGCCCGGGGCCGATTGCAACTGCTCGGTGAAAATGGTCTGGATCGAGTCGATCACCATTACCCGCGGCTTCTCGACCCGCGCCGTGGCAATGATCGTCTCGATGCAGGTTTCGGTCATCACCTTGAGTTGGTCCTGGGGTAGGCCCAGCCGCCGCGAGCGCATGGCCACCTGCTGCTGCGACTCCTCCCCCGTGACATACAGGGCCGGCATGCCCACGGCAATGTTGCACAAGGTCTGTAGCAAAATGGTC > NC_002947/5269728‑5270021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |