New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5458249 = | 45 (0.830) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 7.1% | coding (1981/2607 nt) | leuS | leucine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | 5458336 = | 61 (1.150) | coding (2068/2607 nt) | leuS | leucine‑‑tRNA ligase |
GCCTGAAGACCGACGGCTTGCCGGTGGAAATCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGT > NC_002947/5458103‑5458391 | gccTGAAGACCGACGGCTTGCCGGTGGAAATCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGa > 8:102217/1‑148 (MQ=255) tcacctgggcgatggcggtattgaacttgtggaactggcccacgtcggtgctggcctgcttgatggcagcgtgaatggcgcggcggatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcgtgcagggccggccctggctgctg < 6:239077‑M1/4‑4 (MQ=255) aaGACCGACGGCTTGCCGGTGGAAAGCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGTCCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGa < 7:245839/148‑1 (MQ=255) aCCGACGGCTTGCCGGTGGAAATCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACAGCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCt < 1:246058/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTGGAAATCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGt > 8:288785/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTc < 3:285227/149‑1 (MQ=255) ggaactggcccacgtcggtgctggcctgcttgatggcagcgtgaatggcgcggcggatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctg > 1:318906‑M1/116‑116 (MQ=255) ggaactggcccacgtcggtgctggcctgcttgatggcagcgtgaatggcgcggcggatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctg < 2:318906‑M1/1‑1 (MQ=255) gTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTcc < 6:122694/134‑1 (MQ=255) gTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTcc > 5:122694/1‑134 (MQ=255) gTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGaa < 6:35847/149‑1 (MQ=255) tGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAg < 1:179677/149‑1 (MQ=255) gCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGt > 8:311237/1‑149 (MQ=255) aCCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGc > 6:116398/1‑149 (MQ=255) gaagtcgaaAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCg < 2:335130/125‑1 (MQ=255) gaagtcgaaAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCg > 1:335130/1‑125 (MQ=255) tggcctgcttgatggcagcgtgaatggcgcggcggatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑gc < 6:284830‑M1/55‑1 (MQ=255) ggcctgcttgatggcagcgtgaatggcgcggcggatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑gcg < 5:161665‑M1/56‑1 (MQ=255) aaaCAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTgtct > 2:275873/1‑149 (MQ=255) aactacGGCGTCGACCCGCAGTCCATGCTCGAAGCCTTCTGCGCTGACTCCTTCCTCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTgtctg < 8:162777/149‑1 (MQ=255) aacaacGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTgtctg > 2:39131/1‑149 (MQ=255) caacGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTgtctggc < 7:102217/149‑1 (MQ=255) cGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTgtctggcgtc > 7:324023/1‑149 (MQ=255) gcgtgaatggcgcggcggatgacctgttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTgtctggcgtctg > 5:284830‑M1/78‑149 (MQ=255) cGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCAGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTggctcaggc > 1:301545/1‑148 (MQ=255) cATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCAGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCa > 8:282598/1‑149 (MQ=255) gatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAg > 6:161665‑M1/61‑149 (MQ=255) gATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGc > 3:30582/1‑148 (MQ=255) tCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAg > 7:271922/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGCAGCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCACAGGCTCACGTCAGCCAg > 1:263395/1‑149 (MQ=255) gacgCCGACGGGGGCGACTCCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGTCATGAGCCTGGAATGGTGCTACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAgg < 4:202386/145‑1 (MQ=255) aaGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGc > 1:11731/1‑149 (MQ=255) gCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCt < 8:271922/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCa < 5:239160/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAg < 7:288785/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAgg < 1:216769/128‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAgg > 2:216769/1‑128 (MQ=255) cTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATg > 8:227708/1‑149 (MQ=255) ccgccTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGt < 4:30582/147‑1 (MQ=255) gggcggTTCATGATGTTCCCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGGCCGACTCGGGCGTCGAAGGTGCCAGCGGCTTCCTCGAGCCGTGTCTGGCGGCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTg < 1:275873/144‑1 (MQ=255) ttCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCt > 3:85939/1‑149 (MQ=255) cATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTg > 1:340827/1‑148 (MQ=255) cATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTg < 2:301545/148‑1 (MQ=255) atgatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTgg < 2:263395/148‑1 (MQ=255) tgatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCTTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCACCCAGGACCTGCCATGCAAACAGAATATTGCCGCCCTGga > 8:212159/1‑148 (MQ=255) gatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGc > 1:227849/1‑124 (MQ=255) gatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGc < 2:227849/124‑1 (MQ=255) atgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGgacga > 3:1185/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCTCGCCGC‑CCCACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAACCTGGATGTTGCCGCCCTGGacgacg > 7:146653/1‑149 (MQ=255) tcgcctcgccGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGAcgcg > 8:23621/1‑149 (MQ=255) cctcgccGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCa > 6:72384/1‑148 (MQ=255) ctcgccGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCaa > 3:38041/1‑148 (MQ=255) gccgc‑cCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAgg < 7:311237/149‑1 (MQ=255) cgc‑cCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGt > 4:55527/1‑148 (MQ=255) | GCCTGAAGACCGACGGCTTGCCGGTGGAAATCGGTGGCACCGAGAAAATGTCGAAGTCGAAAAACAACGGCGTCGACCCGCAGTCCATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGT > NC_002947/5458103‑5458391 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |