New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5458249 = | 45 (0.830) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 7.1% | coding (1981/2607 nt) | leuS | leucine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | 5458336 = | 61 (1.150) | coding (2068/2607 nt) | leuS | leucine‑‑tRNA ligase |
CATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCGCCCAGGTGA > NC_002947/5458188‑5458480 | cATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCAGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCa > 8:282598/1‑149 (MQ=255) gatgaccttttgcgcgtcgtccagggcggcaacatccagcttgcctggcaggccctggctGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAg > 6:161665‑M1/61‑149 (MQ=255) gATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGc > 3:30582/1‑148 (MQ=255) tCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAg > 7:271922/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGCAGCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCACAGGCTCACGTCAGCCAg > 1:263395/1‑149 (MQ=255) gacgCCGACGGGGGCGACTCCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGTCATGAGCCTGGAATGGTGCTACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAgg < 4:202386/145‑1 (MQ=255) aaGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGc > 1:11731/1‑149 (MQ=255) gCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCt < 8:271922/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCa < 5:239160/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAg < 7:288785/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAgg < 1:216769/128‑1 (MQ=255) cTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAgg > 2:216769/1‑128 (MQ=255) cTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATg > 8:227708/1‑149 (MQ=255) ccgccTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGt < 4:30582/147‑1 (MQ=255) gggcggTTCATGATGTTCCCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGGCCGACTCGGGCGTCGAAGGTGCCAGCGGCTTCCTCGAGCCGTGTCTGGCGGCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTg < 1:275873/144‑1 (MQ=255) ttCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCt > 3:85939/1‑149 (MQ=255) cATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTg < 2:301545/148‑1 (MQ=255) cATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTg > 1:340827/1‑148 (MQ=255) atgatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTgg < 2:263395/148‑1 (MQ=255) tgatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCTTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCACCCAGGACCTGCCATGCAAACAGAATATTGCCGCCCTGga > 8:212159/1‑148 (MQ=255) gatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGc > 1:227849/1‑124 (MQ=255) gatgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGc < 2:227849/124‑1 (MQ=255) atgTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGgacga > 3:1185/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCTCGCCGC‑CCCACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAACCTGGATGTTGCCGCCCTGGacgacg > 7:146653/1‑149 (MQ=255) tcgcctcgccGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGAcgcg > 8:23621/1‑149 (MQ=255) cctcgccGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCa > 6:72384/1‑148 (MQ=255) ctcgccGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCaa > 3:38041/1‑148 (MQ=255) gccgc‑cCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAgg < 7:311237/149‑1 (MQ=255) cgc‑cCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGt > 4:55527/1‑148 (MQ=255) ctgacgtgagcctgagccagacgccagacacggcgcaggaagcggctggcaccttcgacgccggagtcggaccattccaggctcatgtcAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATc > 6:161665‑M2/90‑149 (MQ=255) aTGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATccgccg < 4:85939/149‑1 (MQ=255) aTGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATccgccg > 2:190213/1‑149 (MQ=255) gtaGCCTGTAATGGTCCGACTCCGGCGTCTAAGGTGCCATCCGCGTCCT‑CCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCATGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCGCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCcgccgc < 8:146653/147‑1 (MQ=255) aGCCTGGAATGGTGCGACTCGGGCGGCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCTCCgcgc < 6:39169/149‑1 (MQ=255) gcatGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGACTGGCGTCTGGCTCAGCCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCgcgc > 5:239077/4‑148 (MQ=255) ccTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACCCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCa > 4:202782/1‑149 (MQ=255) ggAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCAtt > 5:229245/1‑148 (MQ=255) gAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTc < 2:11731/148‑1 (MQ=255) gAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTc < 3:55527/148‑1 (MQ=255) cagacgccagacacggcgcaggaagcggctggcaccttcgacgccggagtcggaccattccaggctcatgtcAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAACAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGc > 5:284830‑M2/73‑149 (MQ=255) cGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGcc < 7:23621/148‑1 (MQ=255) cGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCa < 4:38041/149‑1 (MQ=255) aCTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCAt > 1:59603/1‑148 (MQ=255) tCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATc > 2:257257/1‑147 (MQ=255) cGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGa > 5:287689/1‑87 (MQ=255) cGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGa < 6:287689/87‑1 (MQ=255) cGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAg < 2:59603/148‑1 (MQ=255) gCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAg < 2:340827/149‑1 (MQ=255) cgcaggaagcggctggcaccttcgacgccggagtcggaccattccaggctcatgtcAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGcc < 5:161665‑M2/93‑1 (MQ=255) gcaggaagcggctggcaccttcgacgccggagtcggaccattccaggctcatgtcAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCa < 6:284830‑M2/94‑1 (MQ=255) gAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAg < 4:1185/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAg > 6:105873/1‑148 (MQ=255) gCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTg < 5:105873/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTgg < 6:229245/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTgg < 7:227708/149‑1 (MQ=255) gcCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCcac < 1:39131/149‑1 (MQ=255) tgtCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGt > 2:307833/1‑149 (MQ=255) tctggcgtctggcTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTc < 5:72384/149‑1 (MQ=255) gcgtctggcTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCaa < 1:190213/147‑1 (MQ=255) gtctggcTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGcc > 8:12659/1‑129 (MQ=255) gtctggcTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGcc < 7:12659/129‑1 (MQ=255) gtctggcTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATAcc > 2:250958/1‑149 (MQ=255) ggctcaggctcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCa > 3:11292/1‑149 (MQ=255) gctcaggctcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATa < 3:217549/142‑1 (MQ=255) gctcaggctcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATa > 4:217549/1‑142 (MQ=255) tcaggctcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCg > 6:88551/1‑149 (MQ=255) tcaggctcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCg > 5:195135/1‑149 (MQ=255) gctcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCGcc > 4:313860/1‑147 (MQ=255) tcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGtt > 2:132186/1‑129 (MQ=255) tcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGtt < 1:132186/129‑1 (MQ=255) tcaCGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCGCCCAgg > 2:131320/1‑149 (MQ=255) cagcAGCCAGGGCCGGCCCTGCACGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCGCCCAGGtga < 6:239077‑M2/145‑1 (MQ=255) cAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTcc < 2:318906‑M2/115‑1 (MQ=255) cAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTcc > 1:318906‑M2/2‑116 (MQ=255) | CATGATCGAAGCCTACGGCGCCGACACCTGCCGCCTGTTCATGATGTTCGCCTCGCCGC‑CCGACATGAGCCTGGAATGGTCCGACTCCGGCGTCGAAGGTGCCAGCCGCTTCCT‑GCGCCGTGTCTGGCGTCTGGCTCAGGCTCACGTCAGCCAGGGCCTGCCAGGCAAGCTGGATGTTGCCGCCCTGGACGACGCGCAAAAGGTCATCCGCCGCGCCATTCACGCTGCCATCAAGCAGGCCAGCACCGACGTGGGCCAGTTCCACAAGTTCAATACCGCCATCGCCCAGGTGA > NC_002947/5458188‑5458480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |