New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5666565 | 51 (0.940) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (579/1236 nt) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
? | NC_002947 | = 5666609 | 60 (1.160) | coding (623/1236 nt) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
CCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATC > NC_002947/5666418‑5666712 | cccGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGTCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGa < 1:130135/149‑1 (MQ=255) cccGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCGAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGa < 7:306714/149‑1 (MQ=255) ccGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAg > 5:329098/1‑149 (MQ=255) ccGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAg < 1:223636/149‑1 (MQ=255) tGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGa > 5:154834/1‑148 (MQ=255) ggagcgcTGCGTACTGCCAATGCTCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACTACGTCACTGCAGTCGTTGTATTCACCGTGTTTCTGGGCATCATCCATCTGGGTGAAAAACCTAGCATGGCCGACACgg < 7:303831/145‑1 (MQ=255) ggCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACgg < 6:154834/148‑1 (MQ=255) cgcTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATc < 6:248579/149‑1 (MQ=255) cTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGa > 1:331321/1‑127 (MQ=255) cTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGa < 2:331321/127‑1 (MQ=255) gTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTc < 3:106953/149‑1 (MQ=255) gCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCcg > 4:110649/1‑149 (MQ=255) cAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCcgc > 7:234933/1‑148 (MQ=255) aTGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAg < 4:180236/149‑1 (MQ=255) gcCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGCCGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTTTTCTCCATCGAGTCCa > 5:64470/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcg < 1:135054‑M2/149‑3 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGccaatggcctcgcgggcgaacaggatcgccgtgtcgg > 7:56565‑M1/1‑101 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGccaatggcctcgcgggcgaacaggatcgccgtgtcgg < 8:56565‑M1/138‑38 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATg < 4:306546/107‑1 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATg > 3:306546/1‑107 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggt < 5:182847‑M2/149‑5 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggt < 3:175563‑M2/149‑5 (MQ=255) cTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGccaatggcctcgcgggcgaacaggatcgccgtgtcggccatgctcggtgt < 8:42733‑M1/149‑51 (MQ=255) accaccATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGtt < 6:329098/149‑1 (MQ=255) accaTCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCgg < 6:114461/149‑1 (MQ=255) tcgGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCt > 7:198374/1‑148 (MQ=255) gCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATc < 4:188205/149‑1 (MQ=255) cGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCg < 8:57876/149‑1 (MQ=255) gAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGAtag > 3:207634/1‑146 (MQ=255) gAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCgg > 4:181383/1‑149 (MQ=255) tGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGcc > 8:28080/1‑149 (MQ=255) cgacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc > 4:304160/1‑149 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGTATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTg > 1:185851/1‑124 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGTATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTg < 2:185851/124‑1 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGtt > 2:54708/1‑119 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGtt < 1:54708/119‑1 (MQ=255) ggcacggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCAt < 3:110649/149‑1 (MQ=255) ggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATc > 3:246202/1‑148 (MQ=255) gcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCaa < 4:246202/149‑1 (MQ=255) caGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAag < 8:198374/149‑1 (MQ=255) aGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAaga < 4:175563/149‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTCACCGTGTTGGTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCTTGGCCGACACGGCGATCCTGTTGGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTTGTGTTCGGTGGCCTGATGGTCTACGCCACCTACCGCTTGATCAAGAgt < 4:155097/148‑1 (MQ=255) gTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGcc > 1:321386/1‑109 (MQ=255) gTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGcc < 2:321386/109‑1 (MQ=255) tCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCa < 8:234933/148‑1 (MQ=255) tCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAg > 4:289125/1‑149 (MQ=255) cACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAg > 6:318131/1‑148 (MQ=255) tgtTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAg < 6:182847/149‑1 (MQ=255) cTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTgg < 3:289125/148‑1 (MQ=255) tGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTAc > 4:332521/1‑140 (MQ=255) tGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTAc < 3:332521/140‑1 (MQ=255) ggCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc < 8:270482/112‑1 (MQ=255) ggCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc > 7:270482/1‑112 (MQ=255) atcatcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAgg > 3:249355/1‑145 (MQ=255) atcatcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAgg < 4:249355/145‑1 (MQ=255) tcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGT‑GAGGTCATGCTGa > 4:194796/1‑149 (MQ=255) tGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTg < 3:181383/149‑1 (MQ=255) ggTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgc > 1:284985/1‑149 (MQ=255) gTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgcg > 1:105654/1‑149 (MQ=255) tGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgcgc < 2:284985/149‑1 (MQ=255) aaaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg > 5:96834/1‑149 (MQ=255) aaaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg > 3:258711/1‑149 (MQ=255) aaaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGGGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg < 4:258711/149‑1 (MQ=255) acacCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaag < 8:42733‑M2/149‑100 (MQ=255) acCGccaatggcctcgcgggcgaacaggatcgccgtgtcggccatgctcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaagcg < 3:175563‑M1/149‑146 (MQ=255) acCGccaatggcctcgcgggcgaacaggatcgccgtgtcggccatgctcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaagcg < 5:182847‑M1/149‑146 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCt < 1:48012/132‑1 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCt > 2:48012/1‑132 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTaa > 1:69564/1‑149 (MQ=255) cGccaatggcctcgcgggcgaacaggatcgccgtgtcggccatgctcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaagcggt < 1:135054‑M1/149‑148 (MQ=255) | CCCGATTGCCGTGCTTGGCGCGCTGCGTACTGCCAATGCGCCCAAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATC > NC_002947/5666418‑5666712 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |