| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5666565 | 51 (0.940) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (579/1236 nt) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
| ? | NC_002947 | = 5666609 | 60 (1.160) | coding (623/1236 nt) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter | |||||
ACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCGGCACCGAT > NC_002947/5666463‑5666756 | aCCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcg < 1:135054‑M2/149‑3 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggt < 5:182847‑M2/149‑5 (MQ=255) cGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggt < 3:175563‑M2/149‑5 (MQ=255) accaccATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGtt < 6:329098/149‑1 (MQ=255) accaTCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCgg < 6:114461/149‑1 (MQ=255) tcgGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCt > 7:198374/1‑148 (MQ=255) gCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATc < 4:188205/149‑1 (MQ=255) cGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCg < 8:57876/149‑1 (MQ=255) gAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGAtag > 3:207634/1‑146 (MQ=255) gAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCgg > 4:181383/1‑149 (MQ=255) tGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGcc > 8:28080/1‑149 (MQ=255) cgacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc > 4:304160/1‑149 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGTATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTg > 1:185851/1‑124 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGTATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTg < 2:185851/124‑1 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGtt > 2:54708/1‑119 (MQ=255) gacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGtt < 1:54708/119‑1 (MQ=255) ggcacggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCAt < 3:110649/149‑1 (MQ=255) ggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATc > 3:246202/1‑148 (MQ=255) gcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCaa < 4:246202/149‑1 (MQ=255) caGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAag < 8:198374/149‑1 (MQ=255) aGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAaga < 4:175563/149‑1 (MQ=255) cGTGGTTTTCACCGTGTTGGTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCTTGGCCGACACGGCGATCCTGTTGGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTTGTGTTCGGTGGCCTGATGGTCTACGCCACCTACCGCTTGATCAAGAgt < 4:155097/148‑1 (MQ=255) gTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGcc < 2:321386/109‑1 (MQ=255) gTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGcc > 1:321386/1‑109 (MQ=255) tCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCa < 8:234933/148‑1 (MQ=255) tCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAg > 4:289125/1‑149 (MQ=255) cACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAg > 6:318131/1‑148 (MQ=255) tgtTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAg < 6:182847/149‑1 (MQ=255) cTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTgg < 3:289125/148‑1 (MQ=255) tGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTAc < 3:332521/140‑1 (MQ=255) tGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTAc > 4:332521/1‑140 (MQ=255) ggCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc < 8:270482/112‑1 (MQ=255) ggCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc > 7:270482/1‑112 (MQ=255) atcatcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAgg < 4:249355/145‑1 (MQ=255) atcatcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAgg > 3:249355/1‑145 (MQ=255) tcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGT‑GAGGTCATGCTGa > 4:194796/1‑149 (MQ=255) tGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTg < 3:181383/149‑1 (MQ=255) ggTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgc > 1:284985/1‑149 (MQ=255) gTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgcg > 1:105654/1‑149 (MQ=255) tGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgcgc < 2:284985/149‑1 (MQ=255) aaaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg > 5:96834/1‑149 (MQ=255) aaaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg > 3:258711/1‑149 (MQ=255) aaaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGGGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg < 4:258711/149‑1 (MQ=255) acacCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaag < 8:42733‑M2/149‑100 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCt > 2:48012/1‑132 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCt < 1:48012/132‑1 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTaa > 1:69564/1‑149 (MQ=255) ccGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaagcg < 8:56565‑M2/138‑102 (MQ=255) ccGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaagcg > 7:56565‑M2/1‑37 (MQ=255) cGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCgg > 4:111694/1‑149 (MQ=255) ggCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAAtgt > 4:325189/1‑149 (MQ=255) cGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGc < 3:111694/149‑1 (MQ=255) gATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGc > 6:46847/1‑148 (MQ=255) gTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGc > 7:188931/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCt > 5:260242/1‑149 (MQ=255) cGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTg > 3:82642/1‑148 (MQ=255) gCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCa < 7:122012/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCa > 8:122012/1‑149 (MQ=255) cccGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCAt < 7:28080/149‑1 (MQ=255) cccGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCAt < 6:96834/149‑1 (MQ=255) ccGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCggt > 7:36174/1‑121 (MQ=255) ccGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCggt < 8:36174/121‑1 (MQ=255) gcgAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCAtgtg > 1:169435/1‑149 (MQ=255) gAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTc < 5:318131/149‑1 (MQ=255) ggCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCgg < 4:82642/149‑1 (MQ=255) ccATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCGGCa < 2:105654/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCGGCACCGAt > 3:123747/1‑149 (MQ=255) | ACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCGGCACCGAT > NC_002947/5666463‑5666756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |