New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5685459 | 79 (1.460) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 5.3% | coding (1434/4941 nt) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
? | NC_002947 | = 5685481 | 70 (1.380) | coding (1412/4941 nt) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
CCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGCCGTCCTGGT > NC_002947/5685314‑5685607 | ccTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGa > 2:250203/1‑149 (MQ=255) gcAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACt > 5:92198/1‑149 (MQ=255) aGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGACCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTc > 7:293594/1‑149 (MQ=255) cTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCAccc < 8:830/149‑1 (MQ=255) cTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCAcc > 3:128187/1‑148 (MQ=255) cAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCCCCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGCCGCACTTCACCCAGt > 5:38939/1‑149 (MQ=255) aaCCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGaggcactgggtgaagtgcg > 1:141377‑M1/1‑130 (MQ=255) ccTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTc < 2:132912‑M2/149‑2 (MQ=255) ccTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTc < 3:211056‑M2/149‑2 (MQ=255) ggACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTcgcgctg < 4:275073‑M2/149‑8 (MQ=255) gACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGaggcactgggtgaagtgcgtcgcgcgctgc < 2:141377‑M1/149‑31 (MQ=255) aCTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCgctgct < 8:242519/149‑1 (MQ=255) cTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGctgctg < 5:106000/149‑1 (MQ=255) tGAGAACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGAAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTgg > 6:172225/1‑149 (MQ=255) aGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTgg < 6:158217/147‑1 (MQ=255) aGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGtt > 7:268892/1‑149 (MQ=255) aGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGtt < 3:314640/149‑1 (MQ=255) cACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGt < 4:47108/149‑1 (MQ=255) cACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGt > 2:240996/1‑149 (MQ=255) aCGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCCCCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTc > 7:167884/1‑149 (MQ=255) aCGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTc < 4:128187/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTc > 6:329/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCgg > 2:231660/1‑149 (MQ=255) tGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCCCCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCa > 7:313490/1‑149 (MQ=255) cGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCAc < 1:240996/148‑1 (MQ=255) ggCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGTCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGaggcactgggtgaagtgcgtcgcgcgctg > 1:216263‑M1/1‑104 (MQ=255) ggCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGaggcactgggtgaagtgcgtcgcgcgctg < 2:216263‑M1/133‑30 (MQ=255) gCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGcc > 3:91070/1‑149 (MQ=255) cccTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCa < 8:268892/149‑1 (MQ=255) ccTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAg > 5:288307/1‑149 (MQ=255) gAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCTCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCa < 5:172225/149‑1 (MQ=255) gAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCa < 5:60228/149‑1 (MQ=255) gAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCa < 4:113338/149‑1 (MQ=255) cGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTg < 4:211056/149‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGgc < 3:275073/149‑1 (MQ=255) agcagGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCt < 3:91117/148‑1 (MQ=255) agGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGAt < 1:132912/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGATGCCGCTGCCTATGAGTCTATGCAGCGCCCGACGCACTTCACCCAGTCCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGAGGCGCGCGAttt > 8:265033/1‑149 (MQ=255) tGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGtt < 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ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACt > 3:214079/1‑82 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACt < 4:214079/82‑1 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCAcc < 6:223660/87‑1 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCAcc > 5:223660/1‑87 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCt < 7:66896/137‑1 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCt > 8:66896/1‑137 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCgg > 3:4086/1‑147 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCgg < 6:92198/147‑1 (MQ=255) gcgcCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGgcag < 3:51870/149‑1 (MQ=255) gcCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGt < 4:161265/88‑1 (MQ=255) gcCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGt > 3:161265/1‑88 (MQ=255) cgcccAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGgcagca < 1:46399/147‑1 (MQ=255) cccAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGt < 5:329/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTcgc < 4:91070/149‑1 (MQ=255) ttCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCt > 5:210060/1‑149 (MQ=255) ttCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCt > 2:198405/1‑149 (MQ=255) aGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCg < 8:293594/148‑1 (MQ=255) cACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCaa < 1:87223/149‑1 (MQ=255) ccGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAg > 6:54451/1‑148 (MQ=255) cATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTgg < 7:267311/149‑1 (MQ=255) aCCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAg > 4:27745/1‑149 (MQ=255) aCCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAg < 1:231660/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCtc < 8:167884/149‑1 (MQ=255) 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gAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGc > 4:24712/1‑149 (MQ=255) tgtATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGTGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGc > 1:343469/1‑140 (MQ=255) tgtATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGTGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGc < 2:343469/140‑1 (MQ=255) tATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCAtt < 6:210060/148‑1 (MQ=255) aTGCAGCGCGCGACGCACTTCCCCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGc > 8:295266/1‑149 (MQ=255) aTGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGc > 7:182367/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTcgcgctgcatacactcaaaggcagcggccgcatggtccatgccgaggcggtggctgaactggcctggggcgccgagcacctgctgaaccgggtgctcgagggccgcagcgtgctcagtc < 2:141377‑M2/149‑120 (MQ=255) cAGCGCGaggcactgggtgaagtgcgtcgcgcgctgcatacactcaaaggcagcggccgcatggtccatgccgaggcggtggctgaactggcctggggcgccgagcacctgctgaaccgggtgctcgagggccgcagcgtgctcagtcc < 4:275073‑M1/149‑143 (MQ=255) cAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTcgcgctgcatacactcaaaggcagcggccgcatggtccatgccgaggcggtggctgaactggcctggggcgccgagcacctgctgaaccgggtgctcgagggcc < 2:216263‑M2/133‑105 (MQ=255) cAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTcgcgctgcatacactcaaaggcagcggccgcatggtccatgccgaggcggtggctgaactggcctggggcgacgagcacctgctgaaccgggtgctcgagggcc > 1:216263‑M2/1‑29 (MQ=255) cAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGCCGt > 1:108354/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGCCGTcc < 8:223171/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGCCGTcc > 8:308127/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGCCGTcc > 3:252054/1‑149 (MQ=255) gaggcactgggtgaagtgcgtcgcgcgctgcatacactcaaaggcagcggccgcatggtccatgccgaggcggtggctgaactggcctggggcgccgagcacctgctgaaccgggtgctcgagggccgcagcgtgctcagtccggaagg < 2:132912‑M1/149‑149 (MQ=255) gaggcactgggtgaagtgcgtcgcgcgctgcatacactcaaaggcagcggccgcatggtccatgccgaggcggtggctgaactggcctggggcgccgagcacctgctgaaccgggtgctcgagggccgcagcgtgctcagtccggaagg < 3:211056‑M1/149‑149 (MQ=255) | CCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCAGTTCAGCCACCGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAAGGAACACTTGGCGAAGCTCATCATCGATGCCATCGCCATTGCCGTCCTGGT > NC_002947/5685314‑5685607 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |