| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 487574 = | 66 (1.220) | 5 (0.100) | 5/246 | NT | 7.7% | coding (728/990 nt) | pdxA | 4‑hydroxythreonine‑4‑phosphate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 487613 = | 57 (1.110) | coding (689/990 nt) | pdxA | 4‑hydroxythreonine‑4‑phosphate dehydrogenase | |||||
GCCGAAGCCTTTGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAGGATACGGGTTACACGTTCG > NC_002947/487465‑487759 | gcCGAAGCCTTTGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCa < 5:134811/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTTTGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCACCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAggg < 3:44553/149‑1 (MQ=255) ccTTTGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCgg < 6:3621/149‑1 (MQ=255) tttGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCa < 1:174099/140‑1 (MQ=255) tttGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCa > 2:174099/1‑140 (MQ=255) tttGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCt > 7:77533/1‑149 (MQ=255) ttGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTc > 2:76871/1‑149 (MQ=255) tGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCt < 6:254233/147‑1 (MQ=255) tACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCgat < 2:53385/149‑1 (MQ=255) ttGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAg < 1:260402/134‑1 (MQ=255) ttGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAg > 2:260402/1‑134 (MQ=255) gAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCgatgat < 8:77533/147‑1 (MQ=255) gggAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGAtt > 1:66889/1‑148 (MQ=255) gcggcctcaacccgcatgcgggcgagggcggccacctgggccgcgaagaaatcgacatcatcgagccgaccctGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAgg > 3:67343‑M1/74‑115 (MQ=255) gcggcctcaacccgcatgcgggcgagggcggccacctgggccgcgaagaaatcgacatcatcgagccgaccctGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAgg < 4:67343‑M1/42‑1 (MQ=255) gTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGAGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGgc > 3:111590/1‑149 (MQ=255) tACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGgcc < 2:239863/149‑1 (MQ=255) aCATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGgccg > 7:117723/1‑149 (MQ=255) aGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGcc > 1:38447/1‑149 (MQ=255) ccGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCa > 2:61989/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGtt < 4:223442/149‑1 (MQ=255) aGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGatgatg > 2:277610/1‑101 (MQ=255) aGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGatgatg < 1:277610/101‑1 (MQ=255) gTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGa < 7:18888/149‑1 (MQ=255) gTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGa < 3:237737/149‑1 (MQ=255) cTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGc > 3:147584/1‑149 (MQ=255) cTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGc > 4:80847/1‑149 (MQ=255) ccAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCa > 6:169799/1‑78 (MQ=255) ccAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCa < 5:169799/78‑1 (MQ=255) ccAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAg > 3:11451/1‑79 (MQ=255) ccAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAg < 4:11451/79‑1 (MQ=255) ccAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGt < 5:73278/117‑1 (MQ=255) ccAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGt > 6:73278/1‑117 (MQ=255) aGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGca > 4:30690/1‑149 (MQ=255) tttGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑a < 1:147679/149‑1 (MQ=255) gggTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATa > 4:284044/1‑149 (MQ=255) ggTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGc > 1:241644/1‑116 (MQ=255) ggTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGc < 2:241644/116‑1 (MQ=255) gTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATttcttc > 5:315845/1‑92 (MQ=255) gTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATttcttc < 6:315845/92‑1 (MQ=255) aGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGtt < 3:80847/149‑1 (MQ=255) gggTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTg < 8:117723/149‑1 (MQ=255) gggTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTg < 6:228217/149‑1 (MQ=255) ggTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGGTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTgg > 3:145603/1‑149 (MQ=255) gTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGc < 6:347092/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCa > 4:207229/1‑148 (MQ=255) tCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAAt < 2:66889/149‑1 (MQ=255) ggccggcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑Ag > 6:311789/1‑129 (MQ=255) ggccggcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑Ag < 5:311789/129‑1 (MQ=255) cggcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAAt > 1:289603/1‑144 (MQ=255) cggcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAAt < 2:289603/144‑1 (MQ=255) cggcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCaa < 4:169553/149‑1 (MQ=255) gcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCaa > 4:254131/1‑141 (MQ=255) gcAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCaa < 3:254131/141‑1 (MQ=255) cAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACt > 6:201084/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCAATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACt > 4:259056/1‑149 (MQ=255) cctggcccgcctgcgcaccgaaggcatggacctgcgcgggccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGc > 3:67343‑M2/43‑115 (MQ=255) cctggcccgcctgcgcaccgaaggcatggacctgcgcgggccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGc < 4:67343‑M2/73‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCaaa < 3:90332/146‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCaaa > 4:90332/1‑146 (MQ=255) ccgcctgcgcaccgaaggcatggacctgcgcgggcgggccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATAcgc > 6:325217‑M2/41‑127 (MQ=255) ccgcctgcgcaccgaaggcatggacctgcgcgggcgggccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATAcgc < 5:325217‑M2/87‑1 (MQ=255) GGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTg > 3:67616‑M1/1‑132 (MQ=255) GGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTg < 4:67616‑M1/132‑1 (MQ=255) GGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTc > 5:220690‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCgg > 6:150631‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCgg < 5:150631‑M1/100‑1 (MQ=255) cccgcctgcgcaccgaaggcatggacctgcgcgggccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTcgc > 4:273780‑M2/38‑149 (MQ=255) 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gCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAAc < 3:279753/127‑1 (MQ=255) gCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGACCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAAc > 4:279753/1‑127 (MQ=255) ccTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAg < 4:111846/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAg > 3:182712/1‑148 (MQ=255) cGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAGGAt < 4:182712/148‑1 (MQ=255) cgcAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCgg < 6:8335/101‑1 (MQ=255) cgcAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCgg > 5:8335/1‑101 (MQ=255) cgcAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAGGATACGGGt < 4:147584/149‑1 (MQ=255) gcgggccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGCATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAGGATACGGGTTaaac > 6:225022‑M2/8‑149 (MQ=255) ccAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAGGATACGGGTTACACGTTCg < 3:207229‑M2/147‑1 (MQ=255) cAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCggg > 5:126282‑M2/2‑64 (MQ=255) cAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCggg < 6:126282‑M2/63‑1 (MQ=255) | GCCGAAGCCTTTGTACTTGAGTACGGGAAGGCCCTGGTCGTGGTACATCGCCAGCACCGCATCGCAGTGCTCCAGATATTTGGGGGTAAACAGGGTATCGGCCGGCAGCGGCCCGCGCAGGTCCATGCCTTCGGTGCGCAGGCGGGCCAGGGTCGGCTCGATGATGTCGATTTCTTCGCGGCCCAGGTGGCCGCCCTCGCCCGCATGCGGGTTGAGGCCGCACACG‑AGGATACGCGGGTTGGCAATGCCAAACTTGTCGCGCATGTCGGCATGCAGGATACGGGTTACACGTTCG > NC_002947/487465‑487759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |