New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1543831 | 72 (1.330) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 5.8% | coding (635/1245 nt) | mdfA | multidrug MFS transporter |
? | NC_002947 | = 1543880 | 62 (1.200) | coding (684/1245 nt) | mdfA | multidrug MFS transporter |
CTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGG > NC_002947/1543734‑1544023 | cTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAgg > 5:338663‑M2/1‑147 (MQ=255) cTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAgg > 7:307675‑M2/1‑147 (MQ=255) gACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAgg < 3:103668‑M2/147‑3 (MQ=255) ggCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGcgcc > 5:102404/1‑149 (MQ=255) gctgctgctGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGcgcc < 2:71623/148‑1 (MQ=255) tgctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCtt > 5:50778/1‑149 (MQ=255) ctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg < 7:212523/149‑1 (MQ=255) ctgTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTg < 6:199585/148‑1 (MQ=255) ccGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTgg > 3:43128/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCg < 2:159078/149‑1 (MQ=255) gTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCg > 2:296141/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCg > 8:253851/1‑149 (MQ=255) gATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGa < 7:253851/148‑1 (MQ=255) gATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGAt > 6:146667/1‑149 (MQ=255) tGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTg > 8:227278/1‑149 (MQ=255) ccGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCTACCGCCGCTTCGTTGCAggca > 4:184535‑M2/1‑117 (MQ=255) ccGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCGACCGCCGCTTCGTTGCAggca < 3:184535‑M2/121‑5 (MQ=255) ccGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGc > 2:317161/1‑148 (MQ=255) cGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCg > 1:118350/1‑149 (MQ=255) gAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑TATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTg < 7:56991/130‑1 (MQ=255) gAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTg > 8:56991/1‑130 (MQ=255) aaaCCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTg < 6:234002/149‑1 (MQ=255) accgcTGGTCGTTGAGCGCCGTGACGGCTCGGGGCTGGCGTTCACGCA‑GATTCAGCTGCTGCCACTGTTGGCTTGATATTGACAGTATCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGAAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTTGTCGGATTTCCGCTGa < 4:49653/145‑1 (MQ=255) cccTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGAtt > 2:41388/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTg > 8:17890/1‑149 (MQ=255) ggCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCTCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCt < 1:41388/148‑1 (MQ=255) ggCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCt < 2:118350/148‑1 (MQ=255) ggCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTg < 4:43128/149‑1 (MQ=255) tGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCCGGATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGAt > 1:61787/1‑149 (MQ=255) cGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTc > 6:340092/1‑149 (MQ=255) aCGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCg < 5:146667/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGtg < 7:17890/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATAGGCCTGTCGCCGGtg < 4:103668/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGtgc > 8:127870/1‑149 (MQ=255) gcgGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGtgctgc < 1:296141/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg < 8:78177/95‑1 (MQ=255) cTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTgg > 7:78177/1‑95 (MQ=255) tCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGAt > 6:329976/1‑149 (MQ=255) cACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGGTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGAt < 6:197817/148‑1 (MQ=255) aCGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGAt > 2:30387/1‑147 (MQ=255) aCGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATg < 6:102404/148‑1 (MQ=255) cGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAg < 7:227278/149‑1 (MQ=255) c‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAgggg < 7:127870/149‑1 (MQ=255) aTTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGtt > 5:77469/1‑149 (MQ=255) aTTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGtt < 2:61787/149‑1 (MQ=255) gtccTTCTGCGACTGTTGGCGGGCTATTGCCAGTTTCTTGACAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGAt < 8:136954/105‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGACAACCGACGCTTCGTTGCAGGAAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGTATTGCCGCTGATTGGCTTGAt > 7:136954/2‑107 (MQ=255) aCCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAg > 4:260586/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAggcagcaggtgaatcggcgtgaacgccagccgcgagccgtcacggcgctccacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcag > 8:309541‑M2/1‑58 (MQ=255) ccTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAggcagcaggtgaatcggcgtgaacgccagccgcgagccgtcacggcgctccacgcccagggtttccggcatcaaccggtacagcagcag < 7:309541‑M2/147‑90 (MQ=255) ccTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTa > 4:271455/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAggcagcaggtgaatcggcgtgaacgccagccgcgagccgtcacggcgctccacgcccagggtttccggcatcaaccggtac < 6:323159‑M2/138‑82 (MQ=255) ctgctgCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAggcagcaggtgaatcggcgtgaacgccagccgcgagccgtcacggcgctccacgcccagggtttccggcatcaaccggtac > 5:323159‑M2/1‑57 (MQ=255) ctgcCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCt < 5:340092/149‑1 (MQ=255) ccACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGa < 6:50778/149‑1 (MQ=255) ccACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGATGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTg > 4:45640/1‑147 (MQ=255) cACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAg < 5:50255/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTAt < 3:271455/147‑1 (MQ=255) ggCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGCTTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTAAGACTtgtg > 4:250991/1‑149 (MQ=255) gCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCACTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTgg < 1:317161/149‑1 (MQ=255) tATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTgg > 4:4603/1‑147 (MQ=255) tGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGt > 1:68007/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGtt < 1:30387/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGc > 1:44742/1‑149 (MQ=255) aGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCg < 3:4603/149‑1 (MQ=255) gggCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCACTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAgg > 5:114630/1‑104 (MQ=255) gggCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCACTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAgg < 6:114630/104‑1 (MQ=255) ggCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTg > 8:111424/1‑149 (MQ=255) ccgccgCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGt < 3:289276/106‑1 (MQ=255) ccgccgCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGt > 4:289276/1‑106 (MQ=255) cGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCt < 2:44742/147‑1 (MQ=255) cGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCt < 6:77469/147‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCgg < 3:45640/149‑1 (MQ=255) | CTGACCTGGCTGCTGCTGTACCGGTTGATGCCGGAAACCCTGGGCGTGGAGCGCCGTGACGGCTCGCGGCTGGCGTTCACGCC‑GATTCACCTGCTGCCACTGTTGGCGGGCTATGGCCAGTTGCTGGGCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGG > NC_002947/1543734‑1544023 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |