New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2658287 | 46 (0.850) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.1% | coding (514/981 nt) | PP_2330 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2658316 | 47 (0.910) | coding (485/981 nt) | PP_2330 | hypothetical protein |
CGCCGGTGGCCAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGCTCGATTTCCTCATGGCTG > NC_002947/2658188‑2658459 | cGCCGGTGGCCAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCAGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCt > 7:215185/1‑148 (MQ=255) cGGTGGCCAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATg > 8:244354/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCCAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATg < 3:225530/149‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGACACCCACTCGGATGGCGGGCTTGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCGGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTTCCGGGTAGCCCATGAGCTATATGATGCGGATGTCAGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCtt < 7:4145/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTg > 7:19874/1‑148 (MQ=255) cAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGa < 4:279127/149‑1 (MQ=255) gACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCt < 8:19874/149‑1 (MQ=255) acacCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTg < 7:244354/149‑1 (MQ=255) ccACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGctc < 6:17610/134‑1 (MQ=255) ccACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGctc > 5:17610/1‑134 (MQ=255) ccACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGt > 8:163923/1‑147 (MQ=255) ccACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGt < 7:163923/147‑1 (MQ=255) ccACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTcc > 1:112969/1‑149 (MQ=255) cacaCCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGctct < 3:103233/134‑1 (MQ=255) cacaCCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGctct > 4:103233/1‑134 (MQ=255) cacaCCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCg < 6:296413/149‑1 (MQ=255) cacaCCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCg < 8:288144/149‑1 (MQ=255) acacCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCgg < 2:112969/149‑1 (MQ=255) acCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGTTGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCgggg > 5:186568/1‑149 (MQ=255) cGATGGCGCCCTGGTGCCGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGt > 6:279030/1‑148 (MQ=255) cccTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTa < 2:182861/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGTCATGCGCAGCATGGCCATTACC‑GGTAGCCCTTCAGCACGATGATGCGGTTGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGGCCGGGGTCACGCGGTACTCGa < 6:248559/148‑1 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAgcg > 2:116331/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGcgcgg > 5:321395/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGGACGATGATGCGGATGTCCGGTACGCCTTCGTTGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCCGGCGGTACTCGATCAGCGcgcggtcg > 1:343709/1‑149 (MQ=255) ccgGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTg > 2:26102/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCCTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCccgc > 2:39176/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCccgcc > 7:92512/1‑149 (MQ=255) gCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCccgccg < 1:39176/148‑1 (MQ=255) gTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAgg > 1:46284/1‑147 (MQ=255) cAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACa < 1:116331/149‑1 (MQ=255) cgcAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACt < 8:91434/106‑1 (MQ=255) aTGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAg > 3:225619/1‑149 (MQ=255) tGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTccggtaatggccatgctgcgcctgccgacccgccagtccggcggcaaggccaacctgcaccagggcgccatcggtgtgggtgtcgacctggccaccggcgtgaccct < 6:288878‑M2/149‑108 (MQ=255) ccATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTccggtaatggccatgctgcgcctgccgacccgccagtccggcggcaaggccaacctgcaccagggcgccatcggtgtgggtgtcgacctg > 1:58244‑M2/1‑39 (MQ=255) ccATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTccggtaatggccatgctgcgcctgccgacccgccagtccggcggcaaggccaacctgcaccagggcgccatcggtgtgggtgtcgacctg < 2:58244‑M2/129‑91 (MQ=255) cATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTTATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGc > 7:124301/1‑149 (MQ=255) aTTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTGCACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTTCAGCCCAGTGAGGATGCt > 3:60307/1‑149 (MQ=255) ttACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTg < 5:279030/149‑1 (MQ=255) aCCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTgg < 8:92512/148‑1 (MQ=255) gggTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGa < 3:300447/122‑1 (MQ=255) gggTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGa > 4:300447/1‑122 (MQ=255) tAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTg < 6:321395/149‑1 (MQ=255) aGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGaaagcggg > 4:262568/1‑144 (MQ=255) gCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTCATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGt < 8:124301/149‑1 (MQ=255) ccATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGc > 3:35125/1‑149 (MQ=255) aTCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGCTc > 7:251692/1‑149 (MQ=255) aGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGCTCGAt < 4:35125/149‑1 (MQ=255) gCACGATGATGCGGATGTccggtaatggccatgctgcgcctgccgacccgccagtccggcggcaaggccaacctgcaccagggcgccatcggtgtgggtgtcgacctggccaccggcgtgaccctgcgcggcacctggctgaacaacat > 5:288878‑M2/1‑18 (MQ=255) atgCGGATGTCCGGTGCACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTTCAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGCTCGATTTCCTCAt < 4:60307/148‑1 (MQ=255) ggATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGCTCGATTTCCTCATGGCtg < 1:26102/149‑1 (MQ=255) | CGCCGGTGGCCAGGTCGACACCCACACCGATGGCGCCCTGGTGCAGGTTGGCCTTGCCGCCGGACTGGCGGGTCGGCAGGCGCAGCATGGCCATTACCGGGTAGCCCATCAGCACGATGATGCGGATGTCCGGTACACCTTCGTAGCTGATGCTCTTGAATATCTGGTCCGGGGTCACGCGGTACTCGATCAGCGCGCGGTCGCGGTGCCCGCCGAGGGAGTACAGCCCAGTGAGGATGCTGGAAATCTGGTGCTCGATTTCCTCATGGCTG > NC_002947/2658188‑2658459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |