New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4054993 = | 45 (0.830) | 5 (0.100) | 5/250 | NT | 10.7% | coding (224/393 nt) | PP_3574 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4055047 = | 40 (0.770) | coding (278/393 nt) | PP_3574 | hypothetical protein |
CTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGGGTGGTGACTG > NC_002947/4054899‑4055191 | gcgatcacgtcgatctccatcagccactcggcctgggccaacccggccaccaccaacccggtggaaatcgggaacacgcccttgagccacttgcCCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTggg > 6:136268‑M1/95‑149 (MQ=255) atGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAAGAGTCGATGAAGAACGTCAAGGAACTTATTGAAGAAGCCGGGTCTGACCTGTCGCACATGGTCAAGTCCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTGCGCGAGCCGGTGTTCAAGGAGGTggg < 8:31703/148‑1 (MQ=255) tcacgtcgatctccaccagccactcggcctgggccaacccggccaccaccaacccggtggaaatcgggaacacgcccttgagccacttgcCCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAg > 3:179810‑M1/91‑149 (MQ=255) ccGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCt > 2:165977/1‑149 (MQ=255) caAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCgt > 1:144012/1‑149 (MQ=255) aCCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGtt > 5:344661/1‑149 (MQ=255) gAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTccc > 4:310132/1‑149 (MQ=255) ggcttcttCAAGCAGTTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCgg > 1:64952/8‑149 (MQ=255) gaaCGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGt > 3:282256/1‑149 (MQ=255) tCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTtggtg > 5:238929/1‑149 (MQ=255) gttGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCg < 2:64952/147‑1 (MQ=255) cTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCgg < 4:282256/149‑1 (MQ=255) ttGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGc < 4:172778/142‑1 (MQ=255) ttGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGc > 3:172778/1‑142 (MQ=255) tGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTgg > 8:294609/1‑149 (MQ=255) tGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTgg > 1:300537/1‑149 (MQ=255) gaagaaGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTg < 1:165977/147‑1 (MQ=255) gaagaaGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGc > 5:270194/1‑149 (MQ=255) gaagaaGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGc > 4:17166/1‑149 (MQ=255) gaagCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCa < 6:238929/149‑1 (MQ=255) gCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAACTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGc > 8:175224/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAgg > 4:197132/1‑147 (MQ=255) ccGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAgg < 3:197132/147‑1 (MQ=255) cTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGt < 2:300537/149‑1 (MQ=255) ggACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGc > 4:51053/1‑149 (MQ=255) tGTCGCACATCGTCAAGCCCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTGCCGCGCGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTGCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATg > 6:68961/1‑149 (MQ=255) cGCAAATCGTCAAGACAACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCCGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGgag > 2:68063/1‑149 (MQ=255) cacaTCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGAt < 4:253201/149‑1 (MQ=255) cttgcccacctccttgtacaccggctcgcggaagcgcgggtcggtgatgtaggtggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGGTGGAGATCGACGTGa > 3:179810‑M2/60‑149 (MQ=255) aaGACCACCACCTACATCACCGACCCGGCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCg > 1:190425/1‑110 (MQ=255) aaGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCg < 2:190425/109‑1 (MQ=255) gACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGt > 4:88335/1‑110 (MQ=255) gACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGt < 3:88335/110‑1 (MQ=255) ctCCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATc > 3:142670‑M1/3‑148 (MQ=255) cccacctccttgtacaccggctcgcggaagcgcgggtcggtgatgtaggtggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGc > 6:136268‑M2/56‑149 (MQ=255) ccacctcctcgtacaccggctcgcggaagcgcgggtcggtgatgtaggtggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAgg > 6:46473‑M2/55‑117 (MQ=255) ccacctcctcgtacaccggctcgcggaagcgcgggtcggtgatgtaggtggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAgg < 5:46473‑M2/63‑1 (MQ=255) CACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATc < 4:142670‑M1/145‑1 (MQ=255) CACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCg < 5:207259‑M1/149‑1 (MQ=255) ACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGt > 2:144012‑M1/1‑149 (MQ=255) CCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTg > 7:294609‑M1/1‑149 (MQ=255) accTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGt > 4:333618/1‑149 (MQ=255) cATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGGTCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCg < 1:68063/149‑1 (MQ=255) cACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGAt > 6:231798/1‑148 (MQ=255) aCCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATc < 7:175224/148‑1 (MQ=255) aCCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCa < 6:344661/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGAc > 1:147274/1‑149 (MQ=255) cgggtcggtgatgtaggtggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGGTGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCGGGCCt < 4:179810‑M2/126‑1 (MQ=255) aCAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCAGATTTCCACCGGTTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATAGACGTGATCGCCGAGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCgg > 4:100550/1‑147 (MQ=255) cAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGggtg < 6:207259/149‑1 (MQ=255) cAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGggtg > 1:231557/1‑149 (MQ=255) cAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGggtg < 3:17166/149‑1 (MQ=255) cAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGggtg > 2:81597/1‑149 (MQ=255) ggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCa < 4:140472‑M2/109‑1 (MQ=255) ggtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCa > 3:140472‑M2/6‑114 (MQ=255) gtggGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGGGTGGTGACTg > 5:11637‑M2/5‑149 (MQ=255) | CTGGGTGACCCGCGCGCACAAACCGAACAGGCGATGAAGAACGTCAAGCAACTGCTTGAAGAAGCCGGCTCGGACCTGTCGCACATCGTCAAGACCACCACCTACATCACCGACCC‑GCGCTTCCGCGAGCCGGTGTACAAGGAGGTGGGCAAGTGGCTCAAGGGCGTGTTCCCGATTTCCACCGGGTTGGTGGTGGCCGGGTTGGCCCAGGCCGAGTGGCTGATGGAGATCGACGTGATCGCCGTGGTTCCCGATCAGCAATGACCGCAGGCCTGAATGGCGGGTGGTGACTG > NC_002947/4054899‑4055191 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |