New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 327958 | 64 (1.000) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 6.1% | coding (1292/1368 nt) | PP_0270 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 327985 | 63 (1.030) | coding (1265/1368 nt) | PP_0270 | sensor histidine kinase |
TTACCTGATTGCGAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAAC > NC_002947/327814‑328104 | ttACCTGATTGCGAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATTTCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCAtgg‑ctggc < 1:322788/147‑1 (MQ=255) aCCTGATTGCGAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGa > 4:53568/1‑149 (MQ=255) cGAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTggg < 3:235876/149‑1 (MQ=255) gAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTggg > 3:275739/1‑148 (MQ=255) gAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTggg > 7:194042/1‑148 (MQ=255) aTTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTGACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCaa > 1:336439/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATg < 3:53568/148‑1 (MQ=255) tGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGggctgagcattgcccagcggatcg > 5:248742‑M1/1‑125 (MQ=255) cgcAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TTCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccag > 6:182449‑M2/1‑145 (MQ=255) cgcAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccag < 2:170904‑M2/149‑5 (MQ=255) aGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGggctgagcattgcccagcggatcgccgccagcca < 6:248742‑M1/149‑35 (MQ=255) aGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagcc < 4:343779‑M2/148‑7 (MQ=255) tATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATc > 6:93737/1‑149 (MQ=255) tGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATACTCAGCCCCAGCCCATATccg > 5:163746/1‑149 (MQ=255) tgGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGa > 6:61493/1‑149 (MQ=255) gggCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATg > 8:71019/1‑149 (MQ=255) tCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTggcgg < 2:174109/97‑1 (MQ=255) tCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTggcgg > 1:174109/1‑97 (MQ=255) ccACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAc > 1:15678/1‑149 (MQ=255) ccACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAc > 8:534/1‑149 (MQ=255) cacaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg < 6:19280/149‑1 (MQ=255) acaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTg < 8:133149/103‑1 (MQ=255) acaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTg > 7:133149/1‑103 (MQ=255) acaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcgc > 7:26573/1‑149 (MQ=255) acaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcgc > 3:44967/1‑149 (MQ=255) caGAAGATCGCGTTAGCCATGCAGCAGTA‑AGCCGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAAAATCAGCTCACCCCCATGGCCTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcgc < 1:121471/149‑1 (MQ=255) agaagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGa < 7:534/149‑1 (MQ=255) gaagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGAt < 8:194042/149‑1 (MQ=255) aagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACCGGATATCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGCATGCCTGGTTAcgcag > 1:90052/1‑146 (MQ=255) aagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg < 2:90052/144‑1 (MQ=255) agaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATcc < 1:368949/149‑1 (MQ=255) gaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATccc < 2:15678/149‑1 (MQ=255) tCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCt < 4:21950/94‑1 (MQ=255) tCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCt > 3:21950/1‑94 (MQ=255) tCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTc > 7:169959/1‑105 (MQ=255) tCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTc < 8:169959/105‑1 (MQ=255) tCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCt > 4:398869/1‑148 (MQ=255) gTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCACACcg > 1:169900/1‑149 (MQ=255) ttAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACcgc > 6:30740/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCa > 3:61047/1‑149 (MQ=255) ccAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGggctgagcattgcccagcggatcgccgccagccatgg > 3:67218‑M1/1‑73 (MQ=255) ccAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGggctgagcattgcccagcggatcgccgccagccatgg < 4:67218‑M1/110‑38 (MQ=255) cAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCgcgc < 8:194662/146‑1 (MQ=255) cAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCgcgc > 7:194662/1‑146 (MQ=255) cAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCAc > 6:69354/1‑148 (MQ=255) gcagcaGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAAc < 4:61047/149‑1 (MQ=255) a‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCgg < 2:336439/148‑1 (MQ=255) aCCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATg < 5:30740/147‑1 (MQ=255) ccGCAATCCACC‑GCTCTCCCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑ATGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCg > 1:43700/1‑149 (MQ=255) ccACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGCGTCGGTGATGGTCGGcagcag > 8:290617/1‑149 (MQ=255) aCC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCAAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAgcg > 4:29446/1‑149 (MQ=255) tctcACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGc > 8:286589/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGtt > 3:351830/1‑90 (MQ=255) aCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGtt < 4:351830/90‑1 (MQ=255) aCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGa < 5:69354/147‑1 (MQ=255) ggTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg < 2:246689/91‑1 (MQ=255) ggTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg > 1:246689/1‑91 (MQ=255) gACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTg < 5:61493/148‑1 (MQ=255) aCAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgca < 6:115349/126‑1 (MQ=255) aCAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGt > 5:136938/1‑149 (MQ=255) cAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgcagca > 6:6813/1‑122 (MQ=255) cAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgcagca < 5:6813/122‑1 (MQ=255) cTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 4:275739/149‑1 (MQ=255) cTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 1:170904/149‑1 (MQ=255) cTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 3:29446/149‑1 (MQ=255) tCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGa > 8:290784/1‑106 (MQ=255) tCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGa < 7:290784/106‑1 (MQ=255) aCCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 4:313336/146‑1 (MQ=255) aCCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt > 3:313336/1‑146 (MQ=255) cccccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGAt < 3:398869/149‑1 (MQ=255) cccccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGAt < 4:44967/149‑1 (MQ=255) ccccATGG‑CTGGCGGCGAACCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGAtg > 7:250814/1‑149 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctgg > 3:67218‑M2/1‑37 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctgg < 4:67218‑M2/110‑74 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTg > 7:77567/1‑130 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTg < 8:77567/130‑1 (MQ=255) tgg‑ctggcGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctggctaacgcgatcttctgtgggagcagccccacaccataggact < 6:248742‑M2/149‑116 (MQ=255) gg‑CTGGggctgagcattgcccagcggatcgccgccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctggctaacgcgatcttctgtgggagcagccccacaccataggact < 4:343779‑M1/148‑143 (MQ=255) cTGGggctgagcattgcccagcggatcgccgccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctggctaacgcgatcttctgtgggagcagccccacaccataggactgcg < 2:170904‑M1/149‑146 (MQ=255) cTGGggctgagcattgcccagcggatcgccgccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagaatactgctgcctggctaacgcgatcttctgtgggagcagccccacaccataggactgcg > 6:182449‑M1/1‑4 (MQ=255) tggcGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCGCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAac < 7:71019/149‑1 (MQ=255) | TTACCTGATTGCGAATTCCCTGGCCTGCGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTA‑TGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAAC > NC_002947/327814‑328104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |