| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 327958 | 64 (1.000) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 6.1% | coding (1292/1368 nt) | PP_0270 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | = 327985 | 63 (1.030) | coding (1265/1368 nt) | PP_0270 | sensor histidine kinase | |||||
CGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTGTGGTGGTCCGCTCCAGCGTGA > NC_002947/327841‑328132 | cgcAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATTCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccag > 6:182449‑M2/1‑145 (MQ=255)cgcAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccag < 2:170904‑M2/149‑5 (MQ=255) aGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagcc < 4:343779‑M2/148‑7 (MQ=255) tATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATc > 6:93737/1‑149 (MQ=255) tGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATACTCAGCCCCAGCCCATATccg > 5:163746/1‑149 (MQ=255) tgGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGa > 6:61493/1‑149 (MQ=255) gggCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATg > 8:71019/1‑149 (MQ=255) ccACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAc > 1:15678/1‑149 (MQ=255) ccACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAc > 8:534/1‑149 (MQ=255) cacaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg < 6:19280/149‑1 (MQ=255) acaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcgc > 7:26573/1‑149 (MQ=255) acaGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcgc > 3:44967/1‑149 (MQ=255) caGAAGATCGCGTTAGCCATGCAGCAGTAAGCCGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAAAATCAGCTCACCCCCATGGCCTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcgc < 1:121471/149‑1 (MQ=255) agaagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGa < 7:534/149‑1 (MQ=255) gaagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGAt < 8:194042/149‑1 (MQ=255) aagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACCGGATATCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGCATGCCTGGTTAcgcag > 1:90052/1‑146 (MQ=255) aagaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg < 2:90052/144‑1 (MQ=255) agaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATcc < 1:368949/149‑1 (MQ=255) gaTCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATccc < 2:15678/149‑1 (MQ=255) tCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCt > 4:398869/1‑148 (MQ=255) gTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCACACcg > 1:169900/1‑149 (MQ=255) ttAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACcgc > 6:30740/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCa > 3:61047/1‑149 (MQ=255) cAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCgcgc < 8:194662/146‑1 (MQ=255) cAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCgcgc > 7:194662/1‑146 (MQ=255) cAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCAc > 6:69354/1‑148 (MQ=255) gcagcaGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAAc < 4:61047/149‑1 (MQ=255) aTGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCgg < 2:336439/148‑1 (MQ=255) aCCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATg < 5:30740/147‑1 (MQ=255) ccGCAATCCACC‑GCTCTCCCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑ATGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCg > 1:43700/1‑149 (MQ=255) ccACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGCGTCGGTGATGGTCGGcagcag > 8:290617/1‑149 (MQ=255) aCC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCAAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAgcg > 4:29446/1‑149 (MQ=255) tctcACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGc > 8:286589/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGtt < 4:351830/90‑1 (MQ=255) aCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGtt > 3:351830/1‑90 (MQ=255) aCGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGa < 5:69354/147‑1 (MQ=255) ggTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg > 1:246689/1‑91 (MQ=255) ggTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTAcg < 2:246689/91‑1 (MQ=255) gACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTg < 5:61493/148‑1 (MQ=255) aCAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgca < 6:115349/126‑1 (MQ=255) aCAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGt > 5:136938/1‑149 (MQ=255) cAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgcagca > 6:6813/1‑122 (MQ=255) cAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgcagca < 5:6813/122‑1 (MQ=255) cTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 4:275739/149‑1 (MQ=255) cTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 1:170904/149‑1 (MQ=255) cTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 3:29446/149‑1 (MQ=255) tCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGa > 8:290784/1‑106 (MQ=255) tCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGa < 7:290784/106‑1 (MQ=255) aCCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt < 4:313336/146‑1 (MQ=255) aCCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGgtcgt > 3:313336/1‑146 (MQ=255) cccccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGAt < 4:44967/149‑1 (MQ=255) cccccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGAt < 3:398869/149‑1 (MQ=255) ccccATGG‑CTGGCGGCGAACCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGAtg > 7:250814/1‑149 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctgg > 3:67218‑M2/1‑37 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctgg < 4:67218‑M2/110‑74 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTg > 7:77567/1‑130 (MQ=255) ccATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTg < 8:77567/130‑1 (MQ=255) tgg‑ctggcGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctggctaacgcgatcttctgtgggagcagccccacaccataggact < 6:248742‑M2/149‑116 (MQ=255) tggcGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCGCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAac < 7:71019/149‑1 (MQ=255) ggcgATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTc > 3:66713/1‑149 (MQ=255) ggcgATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTc < 3:343779/149‑1 (MQ=255) gcgATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTcc > 7:373168/1‑149 (MQ=255) cgATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCccagccatgggggtgagctgatattgtcgaaccgtgagagcggtggattgcgggtcagcatactgctgcctggctaacgcgatcttctgtgggagcagccccacaccataggactgcgcaggcca > 5:248742‑M2/1‑24 (MQ=255) cTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTgtggtg < 2:369971/138‑1 (MQ=255) cTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTgtggtg > 1:369971/1‑138 (MQ=255) cTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTGTGGTGGTCCGCTCCa < 6:163746/148‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgcagca > 2:2421/1‑81 (MQ=255) tCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGgcagca < 1:2421/81‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTgtggtg < 6:110123/137‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTgtggtg > 5:110123/1‑137 (MQ=255) agccccagcccATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTGTGGTGGTCCGCTCCAGCGt < 8:250814/149‑1 (MQ=255) ccccagcccATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTGTGGTGGTCCGCTCCAGCGTGa > 1:184856/1‑149 (MQ=255) | CGCAGTCCTATGGTGTGGGGCTGCTCCCACAGAAGATCGCGTTAGCCAGGCAGCAGTATGCTGACCCGCAATCCACC‑GCTCTCACGGTTCGACAATATCAGCTCACCCCCATGG‑CTGGCGGCGATCCGCTGGGCAATGCTCAGCCCCAGCCCATATCCGCCGGATGCCTGGTTACGCGATCCCTCACCGCGCACGAACGGGTCGGTGATGGTCGGCAGCAGCGCTGGCGAAATGCCTGGTCCACGGTCGTCGATGTGGATGAACACTCCTGTGGTGGTCCGCTCCAGCGTGA > NC_002947/327841‑328132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |