New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 799772 = | 47 (0.730) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.8% | coding (701/969 nt) | ispB | octaprenyl diphosphate synthase |
? | NC_002947 | 799809 = | 52 (0.840) | coding (664/969 nt) | ispB | octaprenyl diphosphate synthase |
GGTGTATTTCAGTGCGCCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGG > NC_002947/799624‑799916 | ggTGTATTTCAGTGCGCCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGc < 7:209422/149‑1 (MQ=255) gtgtATTTCAGTGCGCCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGcc < 7:27208/149‑1 (MQ=255) tATTTCAGTGCGCCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGccca > 2:370540/1‑147 (MQ=255) cgcCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGgtc < 1:335088/148‑1 (MQ=255) gcCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGgtcg > 8:125612/1‑148 (MQ=255) ccGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCa < 1:370540/149‑1 (MQ=255) cGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCAc < 7:125612/149‑1 (MQ=255) gATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCACCGTCAGCGTAGGTTAGACATCTACAAGGTCGTCAcc > 6:10520/1‑149 (MQ=255) cttcGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGAc < 1:253868/148‑1 (MQ=255) ttcGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTACCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGt > 5:49705/1‑149 (MQ=255) aaCGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGcc > 1:326152/1‑147 (MQ=255) tggcccaggccaccgacgagcagcgcgaagccctgcgtacctttggcgaccatctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGt > 4:27701‑M1/112‑149 (MQ=255) gAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGACTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTc > 5:288602/1‑149 (MQ=255) aTCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTACCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTg < 6:49705/149‑1 (MQ=255) tGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGc > 5:122264/1‑147 (MQ=255) gTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGgtcgt < 3:152250/120‑1 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGa < 7:174597/147‑1 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGt > 7:286911/1‑149 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGt > 3:320152/1‑149 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCCGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGTCAGGGTAGGATAAACATCATAAAGCTCGTCACAGACGTTCTTGACCAGGCTCTGCGAga > 8:376916/1‑148 (MQ=255) cAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCATGGTAGTTTTTAAATCAGACAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCAc > 8:184497/1‑149 (MQ=255) cAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCa < 3:283628/118‑1 (MQ=255) cAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCAAGGTCGTCa > 4:283628/1‑118 (MQ=255) aGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCAcc > 7:7644/1‑149 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTTCAAACAGCAAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTc > 6:59752/1‑145 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTc < 5:59752/145‑1 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCACCGGCATCGAAGGATAAAAATAAAAAAGTTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCAccc > 6:37668/1‑149 (MQ=255) ttttCCCGGCCACCCTTTTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCtt < 6:288602/147‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGGCGGCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTTTAGATCAGCGGCAGGGGAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTg < 2:290544/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTg < 7:184497/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTg < 4:320152/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTa < 8:286911/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTa < 2:326152/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTa < 1:258289/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCACCGTCATGGTAGTTTTCAAATCTAAAAAGTCGTCACCGACGtt > 8:35333/1‑118 (MQ=255) cAGGCCAGCGTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCATGCTCGGCAGTGGCTTCGCGCATGGTGTAGTTCAGCGGGATGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGt < 5:291335/149‑1 (MQ=255) cAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCACCGTCATCGAAGTATAAAAAAAAAAAAAATCGTAACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGt > 4:377130/1‑149 (MQ=255) gCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGGCTGCTCGGCTGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCca < 6:122264/149‑1 (MQ=255) aCCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCcagca < 8:7644/149‑1 (MQ=255) cccTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCTCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCTGCGGCATGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCcagcag < 5:113145/149‑1 (MQ=255) gATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGa < 5:10520/149‑1 (MQ=255) gcgaccatctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGc > 3:230522‑M1/67‑108 (MQ=255) gcgaccatctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGc < 4:230522‑M1/42‑1 (MQ=255) gTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAg < 3:104065/149‑1 (MQ=255) gTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAg < 7:376916/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGcc < 3:377130/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTc > 5:205443/1‑149 (MQ=255) ggTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCtt > 3:303502/1‑149 (MQ=255) gtAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAg > 6:225222/1‑141 (MQ=255) gtAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAg < 5:225222/141‑1 (MQ=255) tAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGGCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTcgcg < 8:378459/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCgctgc > 2:350702/1‑149 (MQ=255) gtgTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGGCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTg < 5:359350/147‑1 (MQ=255) gTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGgtcg < 3:72908/74‑1 (MQ=255) gTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGgtcg > 4:72908/1‑74 (MQ=255) tttGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTggg < 4:303502/149‑1 (MQ=255) tttGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTggg > 5:14148/1‑149 (MQ=255) | GGTGTATTTCAGTGCGCCCGATTCTTCGACCGCAACGCGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGG > NC_002947/799624‑799916 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |