New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 799772 = | 47 (0.730) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.8% | coding (701/969 nt) | ispB | octaprenyl diphosphate synthase |
? | NC_002947 | 799809 = | 52 (0.840) | coding (664/969 nt) | ispB | octaprenyl diphosphate synthase |
CGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAA > NC_002947/799661‑799950 | tggcccaggccaccgacgagcagcgcgaagccctgcgtacctttggcgaccatctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGt > 4:27701‑M1/112‑149 (MQ=255) gAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGACTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTc > 5:288602/1‑149 (MQ=255) aTCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTACCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTg < 6:49705/149‑1 (MQ=255) tGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGc > 5:122264/1‑147 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGa < 7:174597/147‑1 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGt > 7:286911/1‑149 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGt > 3:320152/1‑149 (MQ=255) ttCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCCGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGTCAGGGTAGGATAAACATCATAAAGCTCGTCACAGACGTTCTTGACCAGGCTCTGCGAga > 8:376916/1‑148 (MQ=255) cAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCATGGTAGTTTTTAAATCAGACAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCAc > 8:184497/1‑149 (MQ=255) aGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCAcc > 7:7644/1‑149 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTTCAAACAGCAAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTc > 6:59752/1‑145 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTc < 5:59752/145‑1 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCACCGGCATCGAAGGATAAAAATAAAAAAGTTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCAccc > 6:37668/1‑149 (MQ=255) ttttCCCGGCCACCCTTTTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCtt < 6:288602/147‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGGCGGCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTTTAGATCAGCGGCAGGGGAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTg < 2:290544/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTg < 7:184497/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTg < 4:320152/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTa < 8:286911/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTa < 2:326152/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTa < 1:258289/148‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCGTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCATGCTCGGCAGTGGCTTCGCGCATGGTGTAGTTCAGCGGGATGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGt < 5:291335/149‑1 (MQ=255) cAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCACCGTCATCGAAGTATAAAAAAAAAAAAAATCGTAACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGt > 4:377130/1‑149 (MQ=255) gCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGGCTGCTCGGCTGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCca < 6:122264/149‑1 (MQ=255) aCCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCcagca < 8:7644/149‑1 (MQ=255) cccTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCTCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCTGCGGCATGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCcagcag < 5:113145/149‑1 (MQ=255) gATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGa < 5:10520/149‑1 (MQ=255) gcgaccatctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGc < 4:230522‑M1/42‑1 (MQ=255) gcgaccatctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGc > 3:230522‑M1/67‑108 (MQ=255) gTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAg < 3:104065/149‑1 (MQ=255) gTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAg < 7:376916/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGcc < 3:377130/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTc > 5:205443/1‑149 (MQ=255) ggTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCtt > 3:303502/1‑149 (MQ=255) gtAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAg > 6:225222/1‑141 (MQ=255) gtAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAg < 5:225222/141‑1 (MQ=255) tAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGGCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTcgcg < 8:378459/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCgctgc > 2:350702/1‑149 (MQ=255) gtgTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGGCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑Tg < 5:359350/147‑1 (MQ=255) gcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagggTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGc < 4:230522‑M2/66‑1 (MQ=255) gcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagggTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGc > 3:230522‑M2/43‑108 (MQ=255) gTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGgtcg > 4:72908/1‑74 (MQ=255) gTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGgtcg < 3:72908/74‑1 (MQ=255) tttGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTggg > 5:14148/1‑149 (MQ=255) tttGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTggg < 4:303502/149‑1 (MQ=255) accctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagggTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCa > 4:27701‑M2/39‑149 (MQ=255) CCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAgc < 4:408217‑M1/149‑1 (MQ=255) CTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAgcg < 8:340365‑M1/149‑1 (MQ=255) CTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAgcg < 8:254751‑M1/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCt‑cgt > 1:42308/1‑128 (MQ=255) ggCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCt‑cgt < 2:42308/128‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGcgccgc < 3:408217/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTg < 4:20237/136‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTg > 3:20237/1‑136 (MQ=255) ccAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGcgccg > 6:367813/1‑147 (MQ=255) tcgtcACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACt > 8:170312/1‑149 (MQ=255) gtcACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACtgt < 7:254751/149‑1 (MQ=255) tcACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACtgtg > 4:27056/1‑149 (MQ=255) tcACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACtgtg > 2:359959/1‑149 (MQ=255) aCCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTggg < 7:340365/149‑1 (MQ=255) aCCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTggg > 8:330129/1‑149 (MQ=255) aCCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTgg < 6:205443/148‑1 (MQ=255) ccGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGt < 5:37668/149‑1 (MQ=255) gACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTggg > 7:194877/1‑146 (MQ=255) tCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCt > 2:285145/1‑149 (MQ=255) cccAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGaa < 5:367813/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGGCTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGaa < 1:285145/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGcc < 2:238522/116‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGcc > 1:238522/1‑116 (MQ=255) ccAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGaa > 3:356194/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGaa > 3:381828/1‑148 (MQ=255) cAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGaa > 8:253843/1‑147 (MQ=255) tCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTGCGGCGC‑TGGCCCAGGCCAccgac > 6:363787/1‑115 (MQ=255) tCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTGCGGCGC‑TGGCCCAGGCCAccgac < 5:363787/117‑3 (MQ=255) | CGAATCTGTTCCAGATCTTCCAGGCCACCCTTCTGGATCGCCTGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCT‑CGTCGG‑TGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAA > NC_002947/799661‑799950 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |