New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1200751 | 48 (0.750) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 7.9% | coding (407/456 nt) | gspG | protein secretion protein |
? | NC_002947 | = 1200763 | 47 (0.770) | coding (419/456 nt) | gspG | protein secretion protein |
AGCCGGCTCAGGAGCCGCTGCCTCGGGCCTGGCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGC > NC_002947/1200604‑1200896 | aGCCGGCTCAGGAGCCGCTGCCTCGGGCCTGGCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTg > 4:293114/1‑149 (MQ=255) aGGAGCCGCTGCCTCGGGCCTGGCGGAGTGATGGCTACGTGCGGCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGggcgg < 3:271010/148‑1 (MQ=255) ggAGCCGCTGCCTCGGGCCTGGCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGggcggc > 4:339558/1‑148 (MQ=255) cGCTGCCTCGGGCCTGGCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAaggc > 3:293114‑M2/1‑145 (MQ=255) gCCTGGCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGa > 2:9904/1‑149 (MQ=255) ggCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTg > 6:277737/1‑149 (MQ=255) gcgcAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTTCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTgg < 5:161104/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTgg < 8:77648/149‑1 (MQ=255) cgcAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTggg < 2:286854/149‑1 (MQ=255) gATGGCGACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACt < 8:135916/148‑1 (MQ=255) aTGGCTACGTGCGTCGCGTGCCGTAAGTCACGTGGGGCTGCGCTTATCTGTACCGCATGCCGGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGTCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTg < 3:316068/148‑1 (MQ=255) aTGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTgg < 5:122062/149‑1 (MQ=255) gCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGgcg > 6:94225/1‑149 (MQ=255) cTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGgcgc > 8:200258/1‑149 (MQ=255) tACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCt > 6:310650/1‑149 (MQ=255) gCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAAc > 7:101138/1‑149 (MQ=255) gTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGgcgc < 5:377338/141‑1 (MQ=255) gTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGgcgc > 6:377338/1‑141 (MQ=255) ccTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTgc < 1:9904/149‑1 (MQ=255) tGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTtcgccgcccggcaggccatcggc < 3:299699‑M1/114‑24 (MQ=255) tGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTtcgccgcccggcaggccatcggc > 4:299699‑M1/1‑91 (MQ=255) tGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAgg > 2:204693/1‑111 (MQ=255) ccGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTgcgc < 2:291903/147‑1 (MQ=255) ccGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGcgcg < 5:310650/148‑1 (MQ=255) gAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGAGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTTACTGGGCGCGGTCCCAGGTGCGCGGt > 8:5660/1‑147 (MQ=255) gACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCg < 1:52875/149‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGt < 3:339558/149‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGt < 5:111205/149‑1 (MQ=255) tGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCtt > 6:109729/1‑149 (MQ=255) gggCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGCTGCCGCCCGGGGGAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCtg > 4:271378/1‑146 (MQ=255) gggCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCtt > 3:117214/1‑147 (MQ=255) gCACCCGTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGc < 8:101138/149‑1 (MQ=255) cccTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGa > 5:88102/1‑149 (MQ=255) cTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATc > 3:225560/1‑149 (MQ=255) gTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGt > 2:163500/1‑114 (MQ=255) gTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGt < 1:163500/114‑1 (MQ=255) cGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAg < 2:68903/75‑1 (MQ=255) cGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAg > 1:68903/1‑75 (MQ=255) gCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCtggtg < 5:277737/149‑1 (MQ=255) gCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGgtgt > 4:338588/1‑149 (MQ=255) ccGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTtcgccgcccggcaggccatcg > 5:397707‑M1/1‑49 (MQ=255) ccGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTtcgccgcccggcaggccatcg < 6:397707‑M1/70‑22 (MQ=255) ccGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCtggtg > 7:166049/1‑143 (MQ=255) ccGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTg > 3:313468/1‑149 (MQ=255) ccGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGATGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCtggtg < 8:166049/143‑1 (MQ=255) gTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCt < 4:225560/149‑1 (MQ=255) gTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCtgat < 7:200258/149‑1 (MQ=255) aTGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGAcc < 6:88102/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCAGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCgg > 6:350969/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTgg < 7:15206/148‑1 (MQ=255) cgcCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTACCTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGAGTCAGCCTGATCGAGCTGCTTGTGGTGTTTGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTggccg < 7:5660/149‑1 (MQ=255) gcCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAaggccatcggcgcccagcgagtacacatcgacccggccatgttcaccgggcatgcggtactgataaggggtgccccacgggtcttccggca > 4:299699‑M2/1‑23 (MQ=255) gcCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAaggccatcggcgcccagcgagtacacatcgacccggccatgttcaccgggcatgcggtactgataaggggtgccccacgggtcttccggca < 3:299699‑M2/114‑92 (MQ=255) cGATGGCCTGCCGGGCGGCGAaggccatcggcgcccagcgagtacacatcgacccggccatgttcaccgg < 6:397707‑M2/70‑50 (MQ=255) cGATGGCCTGCCGGGCGGCGAaggccatcggcgcccagcgagtacacatcgacccggccatgttcaccgg > 5:397707‑M2/1‑21 (MQ=255) cGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTggccggcc > 3:325293/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTg < 4:117214/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCAGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTg < 5:350969/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCt < 1:353564/76‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCt > 2:353564/1‑76 (MQ=255) gCCTtcgccgcccggcaggccatcggcgcccagcgagtacacatcgacccggccatgttcaccgggcatgcggtactgataaggggtgccccacgggtcttccggcaggcgacgcacgtagccatcactgcgccaggcccgaggcagcg > 3:293114‑M1/1‑4 (MQ=255) tGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTgg < 7:87942/102‑1 (MQ=255) tGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTgg > 8:87942/1‑102 (MQ=255) | AGCCGGCTCAGGAGCCGCTGCCTCGGGCCTGGCGCAGTGATGGCTACGTGCGTCGCCTGCCGGAAGACCCGTGGGGCACCCCTTATCAGTACCGCATGCCCGGTGAACATGGCCGGGTCGATGTGTACTCGCTGGGCGCCGATGGCCTGCCGGGCGGCGAAGGCCAGGATGCCGACCTGGGTAACTGGGCGCTGTAACCGGTGCGCGGTCAGCGTGGCTTCAGCCTGATCGAGCTGCTGGTGGTGTTGGCTATCGCCGGGCTGATGACCGGGCTGGCGGTGGCCGGCCTTGGC > NC_002947/1200604‑1200896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |