New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2882966 | 42 (0.660) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 6.5% | coding (375/723 nt) | PP_2538 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2883012 | 46 (0.760) | coding (421/723 nt) | PP_2538 | hypothetical protein |
TGGCCCATGATCAGGTCGAGCGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGGTGTATTTCGATGCCG > NC_002947/2882818‑2883114 | tGGCCCATGATCAGGTCGAGCGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTACGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAG < 8:185611‑M1/149‑1 (MQ=255) aTGATCAGGTCGAGCGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGaa > 6:147318/1‑148 (MQ=255) gATCAGGTCGAGCGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAAt > 7:160886/1‑149 (MQ=255) tCAGGTCGAGCGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATcc > 8:117687/1‑149 (MQ=255) cGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTgccagc < 5:395832/149‑1 (MQ=255) aTCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAgg < 8:160886/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTg > 5:366474/1‑147 (MQ=255) cAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGt < 6:366474/149‑1 (MQ=255) tCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTgcgc > 3:166666/1‑148 (MQ=255) tGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGct > 4:67441‑M2/1‑146 (MQ=255) cccAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGctgc > 7:117687‑M2/1‑144 (MQ=255) cTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGcatcgcgcacctgcaccaggcccttggctggcaggcggattttcacctgccggacc < 7:149519‑M1/149‑57 (MQ=255) gCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACgctgc > 1:403922/1‑149 (MQ=255) ccTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTg > 4:299207/1‑111 (MQ=255) ccTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTg < 3:299207/111‑1 (MQ=255) cTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGctgctg > 2:373229/1‑149 (MQ=255) cTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGctgctg < 5:315526/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGc > 7:25043/1‑149 (MQ=255) ccGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGcc < 1:373229/149‑1 (MQ=255) gtggACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCa < 4:166666/149‑1 (MQ=255) gACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGcatcgcgcacctgcaccaggcccttggctggcaggcggattttcacctgccggacctg < 4:215589‑M1/118‑59 (MQ=255) gACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGcatcgcgcacctgcaccaggcccttggctggcaggcggattttcacctgccggacctg > 3:215589‑M1/1‑60 (MQ=255) gACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCa < 2:382496/139‑1 (MQ=255) gACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCa > 1:382496/1‑139 (MQ=255) accaccGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGtt > 7:274855/1‑149 (MQ=255) ccGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATc < 4:135879/64‑1 (MQ=255) ccGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATc > 3:135879/1‑64 (MQ=255) ccGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGata > 5:285763/1‑149 (MQ=255) ctgATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGa < 2:403922/149‑1 (MQ=255) aTCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGcc < 6:363510/149‑1 (MQ=255) aaCTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGa < 8:166972/142‑1 (MQ=255) aaCTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGt < 8:274855/149‑1 (MQ=255) aaCTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAAACGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGa > 7:166972/1‑142 (MQ=255) cacaACAGTGGTGATGCGCGGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGctgctg < 8:22457/99‑1 (MQ=255) cacaACAGTGGTGATGCGCGGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGctgctg > 7:22457/1‑99 (MQ=255) caacaGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCt > 3:141842/1‑149 (MQ=255) aacaGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGa > 5:24532/1‑134 (MQ=255) aacaGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGa < 6:24532/134‑1 (MQ=255) caGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCGAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGcc < 1:184589/135‑1 (MQ=255) caGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGcc > 2:184589/1‑135 (MQ=255) tggtgATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAgg > 5:12426/1‑149 (MQ=255) tgATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGc < 4:65053/128‑1 (MQ=255) tgATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGc > 3:65053/1‑128 (MQ=255) aTGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTgg < 5:147318/149‑1 (MQ=255) aTGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTgg > 4:116253/1‑149 (MQ=255) cgcAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGgtg > 4:220636/1‑149 (MQ=255) cgcAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTCATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGgtg > 4:215059/1‑149 (MQ=255) gcAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGgtg > 4:383667/1‑148 (MQ=255) cAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGctgccggacctgcgcatcaccactgttgtgcagttcgatcagcaggccggtacggtggtc < 4:215589‑M2/118‑61 (MQ=255) cAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGctgccggacctgcgcatcaccactgttgtgcagttcgatcagcaggccggtacggtggtc > 3:215589‑M2/1‑58 (MQ=255) ggTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGctgccggacctgcgcatcaccactgttgtgcagttcgatcagcaggccggtacggtggtccaccagcccggcctcgaaaggcttggcgaacag < 7:149519‑M2/149‑94 (MQ=255) cGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGGTGTATTTCGa > 2:138084/1‑149 (MQ=255) gcagcatcgcgcacctgcaccaggcccttggctggcaggcggattttcacctgccggacctgcgcatcaccactgttgtgcagttcgatcagcaggccggtacggtggtccaccagcccggcctcgaaaggcttggcgaacagctggg > 7:117687‑M1/1‑4 (MQ=255) agcatcgcgcacctgcaccaggcccttggctggcaggcggattttcacctgccggacctgcgcatcaccactgttgtgcagttcgatcagcaggccggtacggtggtccaccagcccggcctcgaaaggcttggcgaacagctgggca > 4:67441‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGGTGTATTTCGATGCCg < 4:141842/149‑1 (MQ=255) | TGGCCCATGATCAGGTCGAGCGGCTCATCGAAATGGCGCAGGCTCCTTATGCCCAGCTGTTCGCCAAGCCTTTCGAGGCCGGGCTGGTGGACCACCGTACCGGCCTGCTGATCGAACTGCACAACAGTGGTGATGCGCAGGTCCGGCAGGTGAAAATCCGCCTGCCAGCCAAGGGCCTGGTGCAGGTGCGCGATGCTGCCGGCAACGACACGCTGCTGGAAACCGCCATCGCCCAGGTTGATATCCCTGCCATCGAGCCAGGTGGCACCTGCAAGGTGTGGGTGTATTTCGATGCCG > NC_002947/2882818‑2883114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |