New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3336525 = | 46 (0.720) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 6.3% | coding (71/843 nt) | yghU | GSH‑dependent disulfide bond oxidoreductase |
? | NC_002947 | 3336564 = | 45 (0.740) | coding (32/843 nt) | yghU | GSH‑dependent disulfide bond oxidoreductase |
GCACCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAAT > NC_002947/3336378‑3336673 | gCACCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCt > 3:363191/1‑149 (MQ=255) cACCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCTGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTg < 1:248145/149‑1 (MQ=255) cACCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTg > 3:9774/1‑149 (MQ=255) aCCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGTAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTgg < 1:209297/149‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTgg < 6:39219/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTg < 4:310389/149‑1 (MQ=255) gcagcTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTAGATGCTGGCGACCTGGCCGCCGGAGGCt > 6:139460/1‑149 (MQ=255) gcTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGcg > 3:134314/1‑149 (MQ=255) ctctTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGcgt > 7:175062/1‑149 (MQ=255) tctTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGcgtc > 4:386875/1‑149 (MQ=255) tCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTAGGGCCCGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCTCCGGAGGCTGCGTCGtt > 8:153554/1‑149 (MQ=255) aaGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTgc < 4:134314/149‑1 (MQ=255) gggCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGTGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTgcgc < 7:160170/149‑1 (MQ=255) ttgcgtcgaacccgtggcatagatgcaggtcaaggttttcacgtgaccgttttcgcgcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGa > 7:220753‑M1/110‑149 (MQ=255) ggTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACtt > 6:180286/1‑149 (MQ=255) gtcgaactcgtggcatagatgcaggtcaaggttttcacgtgaccgttttcgcgcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGc > 3:220283‑M1/106‑110 (MQ=255) gtcgaactcgtggcatagatgcaggtcaaggttttcacgtgaccgttttcgcgcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGc < 4:220283‑M1/5‑1 (MQ=255) cgaacccgtggcatagatgcaggtcaaggttttcacgtgaccgttttcgcgcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCa > 5:61346‑M1/104‑141 (MQ=255) cgaacccgtggcatagatgcaggtcaaggttttcacgtgaccgttttcgcgcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCa < 6:61346‑M1/38‑1 (MQ=255) aCCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTggg > 4:285422/1‑149 (MQ=255) ccTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGt < 4:363191/149‑1 (MQ=255) cTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTg > 8:80972/1‑149 (MQ=255) gACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTATGGGTGGCa > 7:362708/1‑149 (MQ=255) gCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCa > 8:82187/1‑146 (MQ=255) gCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCa < 7:82187/146‑1 (MQ=255) gTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTgg > 8:297577/1‑134 (MQ=255) gTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTgg < 7:297577/134‑1 (MQ=255) gCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGc < 1:61444/148‑1 (MQ=255) cAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTca < 3:47323/149‑1 (MQ=255) gggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGc > 2:366284/1‑144 (MQ=255) gggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGc < 1:366284/144‑1 (MQ=255) ggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACttt < 4:65965/120‑1 (MQ=255) ggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACttt > 3:65965/1‑120 (MQ=255) ggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTcatgc < 3:386875/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGaa < 5:180286/148‑1 (MQ=255) cAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAAt > 2:223822/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAAt < 8:175062/149‑1 (MQ=255) aGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGaa < 6:25017/77‑1 (MQ=255) aGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGaa > 5:25017/1‑77 (MQ=255) aGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAAtc > 5:53014/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTcc < 4:9774/147‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGgcgc > 7:743/1‑148 (MQ=255) gcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGc > 6:152212‑M1/54‑58 (MQ=255) gcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGc < 5:152212‑M1/5‑1 (MQ=255) gCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGa > 2:313406/1‑148 (MQ=255) ggCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTc < 8:743/149‑1 (MQ=255) ttGTCGTGAGTCTGGCGGTCTTCCTGGCGGTTTATGCTGGCGAACTGGCGGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGTGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGaaaa < 7:153554/149‑1 (MQ=255) ttGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGaaaa > 8:216766/1‑149 (MQ=255) gTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTg < 7:80972/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTcc < 4:333243/106‑1 (MQ=255) ggCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTcc > 3:333243/1‑106 (MQ=255) ccGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATc > 3:327640/1‑148 (MQ=255) gCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATg > 8:280800/1‑149 (MQ=255) aCCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCa > 5:113927/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCAc < 6:53014/149‑1 (MQ=255) ggTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATg < 5:113757/139‑1 (MQ=255) ggTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATg > 6:113757/1‑139 (MQ=255) ttGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGa > 7:273178/1‑149 (MQ=255) CTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCaa > 1:223822‑M1/1‑148 (MQ=255) CTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAAt > 5:139460‑M1/1‑149 (MQ=255) | GCACCGGCGTGGCCGAGGGCAAGCAGCTCTTCAAGGGCAATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAAT > NC_002947/3336378‑3336673 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |