New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3336525 = | 46 (0.720) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 6.3% | coding (71/843 nt) | yghU | GSH‑dependent disulfide bond oxidoreductase |
? | NC_002947 | 3336564 = | 45 (0.740) | coding (32/843 nt) | yghU | GSH‑dependent disulfide bond oxidoreductase |
AATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGCACAGGGTGCAGGCG > NC_002947/3336416‑3336697 | ttgcgtcgaacccgtggcatagatgcaggtcaaggttttcacgtgaccgttttcgcgcctttgaaggagattcatgcatgagcaagcctgcctacgtgccacccaaagtCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGa > 7:220753‑M1/110‑149 (MQ=255) ggTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACtt > 6:180286/1‑149 (MQ=255) aCCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTggg > 4:285422/1‑149 (MQ=255) ccTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGt < 4:363191/149‑1 (MQ=255) cTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTg > 8:80972/1‑149 (MQ=255) gACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTATGGGTGGCa > 7:362708/1‑149 (MQ=255) gCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCa < 7:82187/146‑1 (MQ=255) gCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCa > 8:82187/1‑146 (MQ=255) gTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTgg > 8:297577/1‑134 (MQ=255) gTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTgg < 7:297577/134‑1 (MQ=255) gCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGc < 1:61444/148‑1 (MQ=255) cAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTca < 3:47323/149‑1 (MQ=255) gggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGc < 1:366284/144‑1 (MQ=255) gggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGc > 2:366284/1‑144 (MQ=255) ggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACttt < 4:65965/120‑1 (MQ=255) ggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACttt > 3:65965/1‑120 (MQ=255) ggAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTcatgc < 3:386875/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGaa < 5:180286/148‑1 (MQ=255) cAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAAt > 2:223822/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAAt < 8:175062/149‑1 (MQ=255) aGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAAtc > 5:53014/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTcc < 4:9774/147‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGgcgc > 7:743/1‑148 (MQ=255) gCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGa > 2:313406/1‑148 (MQ=255) ggCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTc < 8:743/149‑1 (MQ=255) ttGTCGTGAGTCTGGCGGTCTTCCTGGCGGTTTATGCTGGCGAACTGGCGGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGTGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑aaaa < 7:153554/149‑1 (MQ=255) ttGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑aaaa > 8:216766/1‑149 (MQ=255) gTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTg < 7:80972/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTcc > 3:333243/1‑106 (MQ=255) ggCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTcc < 4:333243/106‑1 (MQ=255) ccGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATc > 3:327640/1‑148 (MQ=255) gCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATg > 8:280800/1‑149 (MQ=255) aCCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCa > 5:113927/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCAc < 6:53014/149‑1 (MQ=255) ggTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATg < 5:113757/139‑1 (MQ=255) ggTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATg > 6:113757/1‑139 (MQ=255) ttGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGa > 7:273178/1‑149 (MQ=255) tctggcgcaacgacgcagcctccggcggccagttcgccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCaa > 7:220753‑M2/41‑149 (MQ=255) CTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCaa > 1:223822‑M1/1‑148 (MQ=255) CTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAAt > 5:139460‑M1/1‑149 (MQ=255) tggcgcaacgacgcagcctccggcggccagttcgccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCg < 6:61346‑M2/103‑1 (MQ=255) tggcgcaacgacgcagcctccggcggccagttcgccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCg > 5:61346‑M2/39‑141 (MQ=255) cTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAAt < 7:280800/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATg > 7:237971/1‑148 (MQ=255) gccgccGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGca < 6:113927/149‑1 (MQ=255) ccgccgGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCAc < 2:187206/123‑1 (MQ=255) ccgccgGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCAc > 1:187206/1‑123 (MQ=255) gccgGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTGTAAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGcaca < 1:313406/149‑1 (MQ=255) ccgGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGCACAgg < 4:327640/149‑1 (MQ=255) ggAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCtt > 6:173053/1‑100 (MQ=255) ggAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCtt < 5:173053/100‑1 (MQ=255) gCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGTCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCTCGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGCACAGGGTGCAg < 1:327267/149‑1 (MQ=255) gCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGCACAGGGTGCAg < 1:234920/149‑1 (MQ=255) gCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AACACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGCACAGGGTGCAGgcg > 6:136137/1‑149 (MQ=255) gccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGgc > 6:152212‑M2/6‑58 (MQ=255) gccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGgc < 5:152212‑M2/53‑1 (MQ=255) gccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGAGTTCGAc < 4:220283‑M2/105‑1 (MQ=255) gccagACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGAGTTCGAc > 3:220283‑M2/6‑110 (MQ=255) | AATGGTGACCTTGACGCCATTGGGCGTGGCCAGGGAATACAGCTGCAGCGGGTGCTTGCCCAGCGGCAGGTCCTTGTCGTGAGTCGGGCCGGCTACCGGGCGGTTGATGCTGGCGAACTGGCCGCCGGAGGCTGCGTCGTTGCGCCAGACTTTGGGTGGCACGTAGGCAGGCTTGCTCATGCATGAATCTCCTTCAAAGGCGCGAAAACGGTCACGTG‑AAAACCTTGACCTGCATCTATGCCACGGGTTCGACGCAATGCGCAAATGCACAGGGTGCAGGCG > NC_002947/3336416‑3336697 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |