New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3566966 = | 60 (0.940) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.6% | coding (569/1050 nt) | PP_3149 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 3567047 = | 44 (0.730) | coding (650/1050 nt) | PP_3149 | AraC family transcriptional regulator |
GCAATATCTGGATCACGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTGGGGCGGCGG > NC_002947/3566822‑3567114 | gCAATATCTGGATCACGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGc > 4:215428/1‑149 (MQ=255) aagcaggttcagcgtctcttccgggcagtcggccgcccattcgctgacccggtgcatgatcgccctttcctcgtcccgccgccccagggccacgccctgcaaacgctggctggcgttgtcgagaatgaacaggcagtcctccaGCAGCt < 4:129396‑M1/6‑1 (MQ=255) atCTGGATCACGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCt > 4:60998/1‑149 (MQ=255) tGGATCACGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAg > 3:397219/1‑149 (MQ=255) gATCACGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCa < 2:408432/146‑1 (MQ=255) aCGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCAc < 4:397219/149‑1 (MQ=255) cGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCtt > 1:240713/1‑148 (MQ=255) aCCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGCCCCGCAATAGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGtt > 1:121573/1‑149 (MQ=255) aCCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGCAAACGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGACACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGtt > 1:116669/1‑149 (MQ=255) ccAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTgg > 4:11562/1‑149 (MQ=255) gccgcccattcgctgacccggtgcatgatcgccctttcctcgtccagccgccccagggcgacggcctgcaaacgctggctggcgttgtcgagaatgaacaggcagtcctccagcagc > 2:226213‑M1/113‑117 (MQ=255) gccgcccattcgctgacccggtgcatgatcgcacttaccacgtcccgcccccccacggccacgccctgcaaacgctggctggcgttgtcgagaatgaacagccagtcctccagcagc < 1:226213‑M1/5‑1 (MQ=255) aggGGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCgag < 3:110594/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGaggagg > 2:133483/1‑149 (MQ=255) tCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGc > 6:97538/1‑149 (MQ=255) gtgtTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGccc < 2:253339/149‑1 (MQ=255) gtgtTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGcc < 2:240713/148‑1 (MQ=255) gtTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGATGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGt > 5:109551/1‑149 (MQ=255) gACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGc > 7:240303/1‑148 (MQ=255) aCCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCaa < 6:84291/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGGTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCaa < 3:60998/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAgg > 1:123352/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAgg < 3:215428/149‑1 (MQ=255) gCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTTGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAg < 5:54218/101‑1 (MQ=255) gCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAg > 6:54218/1‑101 (MQ=255) cTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAggg > 8:124808/1‑145 (MQ=255) cTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAggg < 7:124808/145‑1 (MQ=255) tGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTg < 6:296754/149‑1 (MQ=255) gCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTgg < 8:15747/148‑1 (MQ=255) gCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTgg < 3:11562/148‑1 (MQ=255) gCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTg < 2:123352/147‑1 (MQ=255) gCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGc > 2:386275/1‑149 (MQ=255) gCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGc > 2:126049/1‑149 (MQ=255) gCCTGGACCCGC‑AGCGCCCGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCTCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAgctg > 4:72325/1‑149 (MQ=255) ccTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAgctgc > 7:214576/1‑149 (MQ=255) cTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAgctgct > 4:375206/1‑149 (MQ=255) gACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGctgctg < 8:214576/147‑1 (MQ=255) cgccccagggccacgccctgcaaacgctggctggcgttgtcgagaatgaacaggcagtcctccaGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTgga > 5:164960‑M1/65‑149 (MQ=255) aCCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTtgag > 3:253341/1‑149 (MQ=255) gccccagggccacgccctgcaaacgctggctggcgttgtcgagaatgaacaggcagtcctccaGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAgctgct > 5:368385‑M1/64‑145 (MQ=255) gccccagggccacgccctgcaaacgctggctggcgttgtcgagaatgaacaggcagtcctccaGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAgctgct < 6:368385‑M1/82‑1 (MQ=255) gC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGtt < 2:257677/111‑1 (MQ=255) gC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGtt > 1:257677/1‑111 (MQ=255) aGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGc < 1:126049/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTACTGGAGGACTGcc > 1:345685/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGtt > 8:53966/1‑148 (MQ=255) gAAGGGTTGTTCCTGGCGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGTCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAATGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCa < 5:291262/148‑1 (MQ=255) ggTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATtctc < 5:394460/149‑1 (MQ=255) gttCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGAc < 1:133483/148‑1 (MQ=255) cATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACg > 2:91912/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACgc > 6:59780/1‑149 (MQ=255) tGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACgcc > 1:370500/1‑149 (MQ=255) ccACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACgccagc > 2:234484/1‑147 (MQ=255) cACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCt > 6:409883/1‑97 (MQ=255) cACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCt < 5:409883/97‑1 (MQ=255) aGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCa < 1:234484/149‑1 (MQ=255) gCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGc < 2:116669/149‑1 (MQ=255) gCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGc < 2:121573/149‑1 (MQ=255) ccAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCg < 8:240303/149‑1 (MQ=255) cAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTgga < 3:146831/101‑1 (MQ=255) cAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTgga > 4:146831/1‑101 (MQ=255) cAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGt > 1:392777/1‑149 (MQ=255) ctcTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCt < 3:72325/146‑1 (MQ=255) gcTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTgg < 7:53966/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTggg > 2:86144/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTggg < 3:375206/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTggg < 1:386275/149‑1 (MQ=255) ttCGGCAGCTGGCTCAGCGCCAGAATGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGAAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTAATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTgggg > 7:61318/1‑147 (MQ=255) ttCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTgggg < 8:61318/147‑1 (MQ=255) ggCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTGGGgcggcg > 2:312127/1‑149 (MQ=255) GCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTGGGGcggcgg < 6:152634‑M1/149‑1 (MQ=255) | GCAATATCTGGATCACGCCGGAGAACTACCAGGAGGTGGCGGTCGTGTTCGACCAGGCCTTTCTGGCCCGCCATGGCCTGGACCCGC‑AGCGCCTGGAAGGGTTGTTCATGGTGCCACTGGGCAGCGGCCAGAATGCGCTGTTCGGCAGCTGGCTCAGCGCCACCTTGACCCGGTTGGGCGAGGAGGGTTGCCCGTTGCAAGGGCAGGCCCTGGCTGAGCAGCTGCTGGAGGACTGCCTGTTCATTCTCGACAACGCCAGCCAGCGTTTGCAGGGCGTGGCCCTGGGGCGGCGG > NC_002947/3566822‑3567114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |