| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3886896 | 51 (0.800) | 5 (0.080) | 4/244 | NT | 7.9% | coding (961/2118 nt) | PP_3430 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | = 3886952 | 67 (1.090) | coding (905/2118 nt) | PP_3430 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
AGCCGCCCCTCCTGCAGGCGCCGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAA > NC_002947/3886748‑3887043 | aGCCGCCCCTCCTGCAGGCGCCGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACG > 8:262379‑M1/1‑149 (MQ=255) gccCCTCCTGCAGGCGCCGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGCTACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGAcgcg > 5:97774/1‑147 (MQ=255) cccTCCTGCAGGCGCCGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGTCAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGgcagcc > 3:152799‑M1/1‑143 (MQ=255) gcgcCGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGt > 6:80860/1‑149 (MQ=255) agcagTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGAt > 2:327723/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTcc > 4:206487/1‑149 (MQ=255) ttCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTccc > 8:204240/1‑149 (MQ=255) gAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCgg < 4:245547/148‑1 (MQ=255) cTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGGTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAAc < 8:296163/149‑1 (MQ=255) cgacgATACCCGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGTCCAATGCCGCCCGCAAACTGGCCAACCACCTCAATACCCACACTCTAGTGCATCAGCCCCTCTGCCAGACGCCCAGCCTCTT‑CA‑CGCTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAAccgcc > 3:322905/4‑149 (MQ=255) ccGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCagga < 2:284183/148‑1 (MQ=255) cGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTTGATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCaggagg < 4:322905/149‑1 (MQ=255) cGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCaggagg > 6:274330/1‑149 (MQ=255) gACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGTCTGACGCGCAGCctc < 4:383035/104‑1 (MQ=255) gACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGTCTGACGCGCAGCctc > 3:383035/1‑104 (MQ=255) aaGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCcgt < 1:121240‑M2/148‑4 (MQ=255) gttgttCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGgcagcctcctgacggcggttggccgggacatcaccgcagaccgtgaagaggctgcgcgtcag < 3:212843‑M1/149‑63 (MQ=255) gttgttCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGgcagcctcctgacggcggttggccgggacatcaccgcagaccgtgaagaggctgcgcgtcag < 4:152799‑M1/149‑63 (MQ=255) tacttcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTCGCCCACCACCTCAAAACCCACACTGATGTGCATAAGAGCCTCTCCCTGACGACCAGACTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCACGGCCAACCGCAGTAAGGAGACTGCCGTCaaa > 4:257676/4‑149 (MQ=255) ttcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGt < 6:118581/128‑1 (MQ=255) ttcatttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGt > 5:118581/1‑128 (MQ=255) catttcatGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTc < 6:97774/148‑1 (MQ=255) cccATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGgcagcctcctgacggcggttggccgggacatcaccgcagaccgtgaagaggctgc > 4:43745‑M1/1‑71 (MQ=255) cccATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGgcagcctcctgacggcggttggccgggacatcaccgcagaccgtgaagaggctgc < 3:43745‑M1/126‑56 (MQ=255) cccATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCACCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTTCCATCGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCaa < 1:327723/149‑1 (MQ=255) ccATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACg > 7:221124/1‑148 (MQ=255) aTGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGaaa < 7:204240/149‑1 (MQ=255) gccgccCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCg < 5:82291/134‑1 (MQ=255) gccgccCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCg > 6:82291/1‑134 (MQ=255) cgcccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCATTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAg > 5:64403/1‑149 (MQ=255) cgcccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAg < 3:211913/149‑1 (MQ=255) gcccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAAcctgc > 8:289636/1‑146 (MQ=255) gcccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGt < 8:221124/149‑1 (MQ=255) cccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTg > 4:30659/1‑149 (MQ=255) ccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAg < 8:245338/146‑1 (MQ=255) ccgccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAg > 7:245338/1‑146 (MQ=255) gccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTgg > 4:122596/1‑147 (MQ=255) gccAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTa < 2:121240/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTg < 7:262379/149‑1 (MQ=255) ccaccaCCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATcg > 2:236873/1‑149 (MQ=255) caccTCCATACGCTCTCTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGgt < 3:257676/149‑1 (MQ=255) ccATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCaa > 5:196147/1‑116 (MQ=255) ccATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCaa < 6:196147/116‑1 (MQ=255) tACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAgg < 3:206487/149‑1 (MQ=255) cGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCg < 3:30659/149‑1 (MQ=255) aCTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTTACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGAtct > 5:15730/1‑149 (MQ=255) aCTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGAtct < 5:80860/149‑1 (MQ=255) aCTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCACAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCgg > 1:331901/1‑145 (MQ=255) aCTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCACAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCgg < 2:331901/145‑1 (MQ=255) tgttgtGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGc < 4:267575/141‑1 (MQ=255) tgttgtGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGc > 3:267575/1‑141 (MQ=255) ttgtGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAg < 6:64403/149‑1 (MQ=255) gtgCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAgc < 3:46697/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTcc > 7:104768/1‑149 (MQ=255) cgcCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGt < 8:193511/149‑1 (MQ=255) tctGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCt > 4:221507/1‑149 (MQ=255) tGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGATg > 2:281744/1‑148 (MQ=255) ccTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAgc < 7:288390/131‑1 (MQ=255) ccTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAgc > 8:288390/1‑131 (MQ=255) cTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCcgtcaggcagaggcgctgatgcacaacagtgagcgtatggaggtggtgggccagttggcgggcggcatgggccatgaaatgaacaac < 3:212843‑M2/149‑88 (MQ=255) cTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCcgtcaggcagaggcgctgatgcacaacagtgagcgtatggaggtggtgggccagttggcgggcggcatgggccatgaaatgaacaac < 4:152799‑M2/149‑88 (MQ=255) aCGgcagcctcctgacggcggttggccgggacatcaccgcagaccgtgaagaggctgcgcgtcaggcagaggcgctgatgcacaacagtgagcgtatggaggtggtgggccagttggcgggcggcatgggccatgaaatgaacaactt < 1:121240‑M1/148‑146 (MQ=255) aCGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTgg < 1:236873/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGaa > 1:14482/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGaa > 8:317475/1‑148 (MQ=255) | AGCCGCCCCTCCTGCAGGCGCCGCTGCAGCAGTTCGAGGCTGCCGCCGATACCGGACAGCAAGTTGTTCATTTCATGGCCCATGCCGCCCGCCAACTGGCCCACCACCTCCATACGCTCACTGTTGTGCATCAGCGCCTCTGCCTGACGCGCAGCCTCTT‑CA‑CGGTCTGCGGTGATGTCCCGGCCAACCGCCGTCAGGAGGCTGCCGTCAAACCTCGCACTCCAACGAAACCAGTGGTAGTGACCATCGCGGTGTCGCAGGCGGATCTCCAGCTGCTCCGCGTGGCTGCATTGGAA > NC_002947/3886748‑3887043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |