New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4238005 = | 67 (1.050) | 7 (0.120) | 6/240 | NT | 9.8% | coding (245/1122 nt) | catB | muconate cycloisomerase 1 |
? | NC_002947 | 4238048 = | 65 (1.080) | coding (202/1122 nt) | catB | muconate cycloisomerase 1 |
GGCCACCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGT > NC_002947/4237859‑4238153 | ggCCACCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAgg > 8:375222/1‑149 (MQ=255) ggCCACCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAgg < 1:412905/149‑1 (MQ=255) cACCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGcc > 1:53692/1‑148 (MQ=255) cACCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGGCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGcc > 3:260498/1‑148 (MQ=255) aCCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCaa < 2:90639/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATc < 3:405100/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTg < 4:260498/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTg < 2:53692/149‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGc < 8:43226/130‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGc > 7:43226/1‑130 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGa < 3:162661/148‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg < 5:413306/149‑1 (MQ=255) aCCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg < 5:407693/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg < 3:280195/147‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg > 4:280195/1‑147 (MQ=255) acaccatgcagcagcagaccctggtggtattgcgactgcgctgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTa < 3:269050‑M1/26‑1 (MQ=255) gCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTAc < 8:25850/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCg < 8:108005/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGa > 2:142555/1‑149 (MQ=255) agcagaccctggtggtattgcgactgcgctgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGtt < 7:299572‑M1/38‑1 (MQ=255) gTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTg < 7:11736/126‑1 (MQ=255) gTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTg > 8:11736/1‑126 (MQ=255) agaccctggtggtattgcgactgcgctgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGc > 4:269050‑M1/109‑149 (MQ=255) accctggtggtattgcgactgcgctgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccaccatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCt > 5:123196‑M1/107‑149 (MQ=255) ccctggtggtattgcgactgcgctgcagcgatggcgtggaaggcatcggtgaagccaccacgatcggtggcctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCt > 8:299572‑M1/106‑148 (MQ=255) ccTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTg < 2:178201/143‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGACGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTg > 1:178201/1‑143 (MQ=255) cGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCt > 7:231752/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCtt < 7:375222/149‑1 (MQ=255) aGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg > 4:278887/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACTCTGGGGCTAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTc < 4:352366/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTc < 8:231752/149‑1 (MQ=255) cTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTa < 6:415472/149‑1 (MQ=255) cTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTa < 1:370421/149‑1 (MQ=255) cTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTa < 8:218554/149‑1 (MQ=255) tttCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAg > 5:82332/1‑149 (MQ=255) tCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGc > 4:136647/1‑148 (MQ=255) gCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACg > 5:58077/1‑149 (MQ=255) gACTTGTCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAg < 3:367375/149‑1 (MQ=255) gACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg > 4:306486/1‑128 (MQ=255) gACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg < 3:306486/128‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg > 1:279339/1‑90 (MQ=255) ggCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAg < 2:279339/90‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATc < 7:38556/114‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATc > 8:38556/1‑114 (MQ=255) gAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGa > 6:187432/1‑149 (MQ=255) aaGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAt < 6:82332/149‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCg < 1:46027/90‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCg > 2:46027/1‑90 (MQ=255) ttGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtggt > 7:203181/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTc > 1:365912/1‑106 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTc < 2:365912/106‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCt > 2:190090/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGAGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCt > 5:166320/1‑149 (MQ=255) ttGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCtt > 7:129241/1‑148 (MQ=255) aGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGAt < 7:258371/149‑1 (MQ=255) gCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATg < 8:129241/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTc < 8:203181/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCg > 3:362802/1‑92 (MQ=255) ccAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCg < 4:362802/92‑1 (MQ=255) cAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCa < 1:190090/149‑1 (MQ=255) ctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGcc > 1:24264‑M1/35‑76 (MQ=255) ctggcgtatggctacgaaagccccgaagggatcaAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGcc < 2:24264‑M1/42‑1 (MQ=255) ttGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGc > 1:148924/1‑148 (MQ=255) gAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGcc < 2:148924/147‑1 (MQ=255) gCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCg > 7:242489/1‑149 (MQ=255) ggcggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTg > 8:387997/1‑148 (MQ=255) ggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgc > 4:154345/1‑149 (MQ=255) aTTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 3:136647/149‑1 (MQ=255) aTTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 1:142555/149‑1 (MQ=255) aTTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 7:387997/149‑1 (MQ=255) aTGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgcg < 4:7265/143‑1 (MQ=255) aTGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgcg > 3:7265/1‑143 (MQ=255) gttgtCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCg > 1:117884/1‑147 (MQ=255) gttgtCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCg < 2:117884/147‑1 (MQ=255) ctctcCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCAACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGACTTCCACGACATAGCTGCAGCGCAGTCGCAATa > 6:327902/2‑149 (MQ=255) tCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATac < 6:166320/149‑1 (MQ=255) tCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTAACAGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATac > 7:214728/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgc < 6:160492/134‑1 (MQ=255) tGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgc > 5:160492/1‑134 (MQ=255) ggCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAg > 2:239550/1‑149 (MQ=255) AGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGt < 2:77342‑M1/149‑1 (MQ=255) | GGCCACCCAGCAGTTCGCTGACCGGCAGGCCCAGGCGTTTGCCCTGGGCGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGT > NC_002947/4237859‑4238153 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |