| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4238005 = | 67 (1.050) | 7 (0.120) | 6/240 | NT | 9.8% | coding (245/1122 nt) | catB | muconate cycloisomerase 1 |
| ? | NC_002947 | 4238048 = | 65 (1.080) | coding (202/1122 nt) | catB | muconate cycloisomerase 1 | |||||
CGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTTGT > NC_002947/4237907‑4238185 | cGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCt > 7:231752/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCtt < 7:375222/149‑1 (MQ=255) aGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg > 4:278887/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACTCTGGGGCTAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTc < 4:352366/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTc < 8:231752/149‑1 (MQ=255) cTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTa < 6:415472/149‑1 (MQ=255) cTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTa < 1:370421/149‑1 (MQ=255) cTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTa < 8:218554/149‑1 (MQ=255) tttCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAg > 5:82332/1‑149 (MQ=255) tCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGc > 4:136647/1‑148 (MQ=255) gCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACg > 5:58077/1‑149 (MQ=255) gACTTGTCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAg < 3:367375/149‑1 (MQ=255) gACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg > 4:306486/1‑128 (MQ=255) gACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCggg < 3:306486/128‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATc < 7:38556/114‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATc > 8:38556/1‑114 (MQ=255) gAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGa > 6:187432/1‑149 (MQ=255) aaGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAt < 6:82332/149‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGAtggtggt > 7:203181/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTc < 2:365912/106‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTc > 1:365912/1‑106 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCt > 2:190090/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGAGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCt > 5:166320/1‑149 (MQ=255) ttGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCtt > 7:129241/1‑148 (MQ=255) aGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGAt < 7:258371/149‑1 (MQ=255) gCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATg < 8:129241/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTc < 8:203181/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCg > 3:362802/1‑92 (MQ=255) ccAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCg < 4:362802/92‑1 (MQ=255) cAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCa < 1:190090/149‑1 (MQ=255) ttGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGc > 1:148924/1‑148 (MQ=255) gAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGcc < 2:148924/147‑1 (MQ=255) gCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCg > 7:242489/1‑149 (MQ=255) ggcggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTg > 8:387997/1‑148 (MQ=255) ggcATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgc > 4:154345/1‑149 (MQ=255) aTTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 1:142555/149‑1 (MQ=255) aTTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 7:387997/149‑1 (MQ=255) aTTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCa < 3:136647/149‑1 (MQ=255) aTGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgcg > 3:7265/1‑143 (MQ=255) aTGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgcg < 4:7265/143‑1 (MQ=255) gttgtCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCg < 2:117884/147‑1 (MQ=255) gttgtCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCg > 1:117884/1‑147 (MQ=255) ctctcCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCAACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGACTTCCACGACATAGCTGCAGCGCAGTCGCAATa > 6:327902/2‑149 (MQ=255) tCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATac < 6:166320/149‑1 (MQ=255) tCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTAACAGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATac > 7:214728/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgc > 5:160492/1‑134 (MQ=255) tGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAgc < 6:160492/134‑1 (MQ=255) ggCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAg > 2:239550/1‑149 (MQ=255) aggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGt > 5:123196‑M2/44‑149 (MQ=255) aggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATCGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAggg > 8:299572‑M2/44‑148 (MQ=255) AGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGt < 2:77342‑M1/149‑1 (MQ=255) ggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAg > 1:24264‑M2/43‑76 (MQ=255) ggccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAg < 2:24264‑M2/34‑1 (MQ=255) gccaacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTct > 4:269050‑M2/42‑149 (MQ=255) GCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTct < 4:107479‑M1/149‑1 (MQ=255) CCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGc > 2:71074‑M1/1‑132 (MQ=255) aacatcgacgcgtacctcgccccagcgttgattggcctTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTctgct < 7:299572‑M2/111‑1 (MQ=255) AATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAAt < 1:45979‑M1/133‑1 (MQ=255) AATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAAt > 2:45979‑M1/1‑133 (MQ=255) tCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTctgctgc > 7:215513/1‑149 (MQ=255) cAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTctgctgct > 2:355951/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTctgctgctg > 6:337226/1‑148 (MQ=255) aCGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCtgctgctgc < 1:355951/149‑1 (MQ=255) gCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGCGTTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGACTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCa > 1:90547/1‑149 (MQ=255) 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gTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCg > 6:415065/1‑149 (MQ=255) tACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGc < 3:278887/149‑1 (MQ=255) aCGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGc > 7:32666/1‑148 (MQ=255) cgcgTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGcc < 2:400564/148‑1 (MQ=255) gcgTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGc > 8:285569/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCa < 7:285569/148‑1 (MQ=255) gcgTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAg > 4:225332/1‑149 (MQ=255) gcgTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAg > 6:194624/1‑149 (MQ=255) gTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCt > 6:218384/1‑149 (MQ=255) tCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCtt < 6:58077/149‑1 (MQ=255) cGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCAt < 7:356871/130‑1 (MQ=255) cGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCAt > 8:356871/1‑130 (MQ=255) gATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTtgt < 5:337226/149‑1 (MQ=255) | CGTCGAGCAAGGCGCTTTCGATGCCGGACTTGGCGAAGGTGTTGCCCTTGGCCAGCTTGTCCAGCTTGAGCATGGCGGCATTGATGTTGTCTGCCGGCAGGCCAATCAACGCTGGGGCGAGGTACGCGTCGATGTTGGCCTTGATCCCTTCGGGGC‑TTTCGTAGCCATACGCCAGGCCACCGATGGTGGTGGCTTCACCGATGCCTTCCACGCCATCGCTGCAGCGCAGTCGCAATACCACCAGGGTCTGCTGCTGCATGGTGTGCATCGCCAGCTTGT > NC_002947/4237907‑4238185 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |