New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4932061 = | 60 (0.940) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.4% | coding (157/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
? | NC_002947 | 4932103 = | 48 (0.800) | coding (115/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
GGGTGTTGCGGTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCT > NC_002947/4931914‑4932208 | gggTGTTGCGGTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATg > 5:164696/1‑149 (MQ=255) tgtTGCGGTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCg < 3:376718/149‑1 (MQ=255) ggtgcaacccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTg > 3:227310‑M1/146‑147 (MQ=255) gtgcaacccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCg < 6:303149‑M1/5‑1 (MQ=255) gcaacccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacagccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCgg > 1:302275‑M1/144‑149 (MQ=255) gCGGTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCt > 8:302192/1‑149 (MQ=255) caacccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGc > 3:307607‑M1/142‑148 (MQ=255) caacccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGc > 1:406069‑M1/142‑148 (MQ=255) cGGTGTACCGCACGCGGCGCCCAGTCGCCTCTGCGCACTTCGTCCAGCACGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGGCTCAAACCTGGCGCCCTTGCTGGCGGCG‑TATTTGCTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGcc < 4:202902/147‑1 (MQ=255) cGGTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTg > 5:46832/1‑149 (MQ=255) ggTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTgg < 1:47276/149‑1 (MQ=255) ccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCg < 6:132428‑M1/5‑1 (MQ=255) ccaccagcgcgggacccgtactatgaacgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCg > 5:132428‑M1/138‑142 (MQ=255) gtACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATc < 7:158483/149‑1 (MQ=255) ccGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTTGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAgg > 6:254856/1‑149 (MQ=255) ccGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGc > 2:16906/1‑139 (MQ=255) ccGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGc < 1:16906/139‑1 (MQ=255) ccGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAgg > 8:320612/1‑149 (MQ=255) ccGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAg < 6:46832/148‑1 (MQ=255) ccGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGAGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAgg > 3:244642/1‑149 (MQ=255) cgtaCGCGGCGCCCAGTCGGCTTTGCGCACTTCGTGCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGTTGGCGGCGTAGGTCTCAAACCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGCTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAgg < 1:95749/146‑1 (MQ=255) cGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAgg > 4:99380/1‑148 (MQ=255) cGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGt > 5:332127/1‑149 (MQ=255) gAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTc > 4:196164/1‑149 (MQ=255) gcggcgCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCg < 8:108586/149‑1 (MQ=255) ggcgCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGAc > 5:186109/1‑149 (MQ=255) cgcCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCt < 7:320612/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCa < 1:154015/149‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTg < 5:387706/148‑1 (MQ=255) cgccagcggcttcaagatgtacagccgggcggcgaaggacgcccagtacgagctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCg > 2:155198‑M1/111‑149 (MQ=255) tGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCg < 6:186109/147‑1 (MQ=255) gcACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGc > 6:304406/1‑146 (MQ=255) gcACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCaa < 5:304406/148‑1 (MQ=255) ttCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAg > 4:48760/1‑117 (MQ=255) ttCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAg < 3:48760/117‑1 (MQ=255) ttCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAgcgcg > 7:376555/1‑149 (MQ=255) cGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTTGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAgcgcgc < 5:254856/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGcc < 3:381345/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTCGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGcc > 5:356419/1‑148 (MQ=255) tCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCaa > 3:73127/1‑149 (MQ=255) cAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCaa > 6:35412/1‑147 (MQ=255) cAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACa < 3:99380/149‑1 (MQ=255) gCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGc > 5:425645/1‑134 (MQ=255) gCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGc < 6:425645/134‑1 (MQ=255) tGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAggtgg < 6:164696/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAggtg > 5:37678/1‑143 (MQ=255) ccGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAggtg < 6:37678/143‑1 (MQ=255) gAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATg < 8:204206/149‑1 (MQ=255) gCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCt > 5:257984/1‑149 (MQ=255) cGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGc > 4:251721/1‑149 (MQ=255) gCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCt > 2:399151/1‑94 (MQ=255) cGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCggg < 7:302192/149‑1 (MQ=255) tctcAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCATGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTa < 4:244642/148‑1 (MQ=255) gctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCaa > 3:230280‑M1/60‑102 (MQ=255) gctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCaa < 4:230280‑M1/43‑1 (MQ=255) cccTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTc > 8:216669/1‑149 (MQ=255) gCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg < 6:356419/147‑1 (MQ=255) gtcg‑tATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGt > 5:63296/1‑149 (MQ=255) tATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCtt > 5:63332/1‑149 (MQ=255) tATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCtt > 7:145722/1‑149 (MQ=255) tttGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcg > 2:45962/1‑149 (MQ=255) tttGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcg > 1:36845/1‑149 (MQ=255) tttGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTc < 8:145722/148‑1 (MQ=255) tgttgGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcgc < 6:257984/148‑1 (MQ=255) ggCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGAGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCgccgcc < 3:196164/148‑1 (MQ=255) cACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGc < 3:260309/105‑1 (MQ=255) cACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGc > 4:260309/1‑105 (MQ=255) ttCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg < 5:242096/127‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg > 6:242096/1‑127 (MQ=255) ccAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGt < 6:332127/147‑1 (MQ=255) cagcagGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTAc < 3:251721/148‑1 (MQ=255) cagGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCt > 5:303149/1‑149 (MQ=255) tCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCg < 4:73127/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCt > 5:371076/1‑149 (MQ=255) | GGGTGTTGCGGTGTACCGAACGCGGCGCCCAGTCGCCTTTGCGCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCG‑TATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCT > NC_002947/4931914‑4932208 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |