New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4932061 = | 60 (0.940) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.4% | coding (157/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
? | NC_002947 | 4932103 = | 48 (0.800) | coding (115/741 nt) | fliA | RNA polymerase sigma 28 factor |
GCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACC > NC_002947/4931956‑4932247 | gcACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCaa < 5:304406/148‑1 (MQ=255) ttCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAgcgcg > 7:376555/1‑149 (MQ=255) cGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTTGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAgcgcgc < 5:254856/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGcc < 3:381345/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTCGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGcc > 5:356419/1‑148 (MQ=255) tCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCaa > 3:73127/1‑149 (MQ=255) cAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCaa > 6:35412/1‑147 (MQ=255) cAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACa < 3:99380/149‑1 (MQ=255) tGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAggtgg < 6:164696/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAggtg > 5:37678/1‑143 (MQ=255) ccGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAggtg < 6:37678/143‑1 (MQ=255) gAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATg < 8:204206/149‑1 (MQ=255) gCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCt > 5:257984/1‑149 (MQ=255) cGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGc > 4:251721/1‑149 (MQ=255) cGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCggg < 7:302192/149‑1 (MQ=255) tctcAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCATGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTa < 4:244642/148‑1 (MQ=255) gctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCaa > 3:230280‑M1/60‑102 (MQ=255) gctgatcgaacgctacgccccgctggtcaagcgcatcgcctaccacctgttggcgcgctTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCaa < 4:230280‑M1/43‑1 (MQ=255) cccTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTc > 8:216669/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg < 6:356419/147‑1 (MQ=255) gtcgtATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGt > 5:63296/1‑149 (MQ=255) tATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCtt > 7:145722/1‑149 (MQ=255) tATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCtt > 5:63332/1‑149 (MQ=255) tttGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcg > 2:45962/1‑149 (MQ=255) tttGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcg > 1:36845/1‑149 (MQ=255) tttGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTc < 8:145722/148‑1 (MQ=255) tgttgGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTcgc < 6:257984/148‑1 (MQ=255) ggCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGAGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCgccgcc < 3:196164/148‑1 (MQ=255) cACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGc < 3:260309/105‑1 (MQ=255) cACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGc > 4:260309/1‑105 (MQ=255) ttCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg < 5:242096/127‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTgg > 6:242096/1‑127 (MQ=255) ccAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGt < 6:332127/147‑1 (MQ=255) cagcagGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTAc < 3:251721/148‑1 (MQ=255) cagGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCt > 5:303149/1‑149 (MQ=255) tCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCg < 4:73127/149‑1 (MQ=255) ttgccggccaacgtgcaggtcgaggacctgatccaggccggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGc < 4:230280‑M2/59‑1 (MQ=255) ttgccggccaacgtgcaggtcgaggacctgatccaggccggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGc > 3:230280‑M2/44‑102 (MQ=255) aTGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCt > 5:371076/1‑149 (MQ=255) CCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCg > 4:408091‑M1/1‑93 (MQ=255) CCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCg < 3:408091‑M1/93‑1 (MQ=255) cggccaacgtgcaggtcgaggacctgatccaggccggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCg > 2:155198‑M2/40‑149 (MQ=255) CGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGctgggg < 5:109898‑M1/149‑3 (MQ=255) CTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGGGTTCa > 6:109898‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCa > 6:371076‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCa < 8:215854‑M1/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGCCCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTa < 7:216669/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTAc > 3:35968/1‑149 (MQ=255) aGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACg > 8:291192/1‑149 (MQ=255) ggTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATc > 1:124267/1‑122 (MQ=255) ggTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATc < 2:124267/122‑1 (MQ=255) ggTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCtt > 6:236878/1‑124 (MQ=255) ggTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCtt < 5:236878/124‑1 (MQ=255) tCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACgg > 4:57416/1‑144 (MQ=255) tCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACgg < 3:57416/144‑1 (MQ=255) gACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCcgc > 2:385118/1‑149 (MQ=255) ccTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCgcgc > 8:178248/1‑149 (MQ=255) tGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCATCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtg > 1:10920/1‑149 (MQ=255) gCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtgg > 7:278677/1‑149 (MQ=255) cACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTACGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtggt < 7:226710/149‑1 (MQ=255) aCGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtggtg < 8:376555/149‑1 (MQ=255) aCGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtggtg < 7:291192/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTggg > 4:209222/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCATCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGt < 2:10920/149‑1 (MQ=255) gccggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTg > 3:307607‑M2/8‑148 (MQ=255) gccggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTg > 1:406069‑M2/8‑148 (MQ=255) ccggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGCTGTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGc > 1:302275‑M2/7‑149 (MQ=255) cggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtggtgg > 5:132428‑M2/6‑142 (MQ=255) cggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCtggtgg < 6:132428‑M2/137‑1 (MQ=255) cggcaAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCAc < 6:303149‑M2/144‑1 (MQ=255) caAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCAcc > 3:227310‑M2/3‑147 (MQ=255) | GCACTTCGTCCAGCATGGCCCCGCGAATGCGGATGCCGGCGTAGGTCTCAAAGCTGGCGCCCTTGCTGGCGTCGTATTTGTTGGCCACTTCCAGCAGGCCGATCATGCCGGCCTGGATCAGGTCCTCGACCTGCACGTTGGCCGGCAAGCGCGCCAACAGGTGGTAGGCGATGCGCTTGACCAGCGGGGC‑GTAGCGTTCGATCAGCTCGTACTGGGCGTCCTTCGCCGCCCGGCTGTACATCTTGAAGCCGCTGGCGTTCATAGTACGGGTCCCGCGCTGGTGGGTTGCACC > NC_002947/4931956‑4932247 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |