| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4958360 = | 54 (0.840) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.4% | coding (340/1020 nt) | fliG | flagellar motor switch protein |
| ? | NC_002947 | 4958434 = | 55 (0.910) | coding (266/1020 nt) | fliG | flagellar motor switch protein | |||||
GTCCAGGCGCACCTTGTGGTCGAAGTTGCTCAGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTC > NC_002947/4958214‑4958507 | gtgcagcgggtgggtgtggccatggcgcagatgggcaatgtgcaccgtgaccaggtcgaacaggtgatgagcgagttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaac < 5:345858‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcagcgggtgtgtgtggccatggcgcagatggtcaatgtgcaccgtgaccaggtcgaacaggtgatgagcgagttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAg > 5:341310‑M1/146‑149 (MQ=255) ccAGGCGCACCTTGTGGTCGAAGTTGCTCAGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAgg > 1:283897/1‑149 (MQ=255) cagcgggtgggtgtggccatggcgcagatgggcaatgtgcaccgtgaccaggtcgaacaggtgatgagcgagttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAGGc < 7:116189‑M1/6‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGTTGTGGTCGTAGTTGCTCAGCAGTTCACCGGGCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTGTTAGCGGATCACGTCGGGCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGTGGCTGTCGAGGc < 6:135810/149‑1 (MQ=255) aaGTTGCTCAGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTg > 1:236285/1‑135 (MQ=255) aaGTTGCTCAGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTg < 2:236285/135‑1 (MQ=255) aGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATg < 1:330034/147‑1 (MQ=255) aGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCg > 5:102835/1‑149 (MQ=255) aCTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTc > 1:1939/1‑149 (MQ=255) cACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGAc > 6:37493/1‑148 (MQ=255) ccGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTc > 4:135534/1‑143 (MQ=255) ccGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTc < 3:135534/143‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAg < 8:275/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACTCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCg > 7:266560/1‑149 (MQ=255) cgtgaccaggtcgaacaggtgatgagcgagttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAg < 6:164494‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtgaccaggtcgaacaggtgatgagcgagttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAg > 5:164494‑M1/102‑105 (MQ=255) gTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTg < 2:283897/148‑1 (MQ=255) tCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGc < 5:37493/149‑1 (MQ=255) ggggTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGcc < 8:228271/148‑1 (MQ=255) ggTCGAGGTAGGCGACCCCGATTGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTACATCAACTTGAGGCTGTCCACGCCGCTTGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGCCCa > 6:15111/1‑135 (MQ=255) ggTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACAAGGCCAACGGCCTGGTcgac < 6:362850/148‑4 (MQ=255) gTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCATGTCCTCGc > 5:248155/1‑149 (MQ=255) cGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAgg < 2:1939/149‑1 (MQ=255) cGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAgg > 7:19212/1‑149 (MQ=255) ccACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGcc < 4:395727/149‑1 (MQ=255) cACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCt > 3:163360/1‑149 (MQ=255) agttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGtt > 7:314672‑M1/74‑149 (MQ=255) cTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGCGCAGGCTGCGGTCGACCAGGCCCTTGGCCTTTTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCa > 1:369561/1‑149 (MQ=255) cTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGt < 2:211102/116‑1 (MQ=255) cTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGt > 1:211102/1‑116 (MQ=255) ggATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTgg < 8:149299/140‑1 (MQ=255) ggATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTgg > 7:149299/1‑140 (MQ=255) gATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCt < 3:347190/149‑1 (MQ=255) atcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTgg < 7:388204‑M1/74‑1 (MQ=255) atcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTgg > 8:388204‑M1/63‑136 (MQ=255) tGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGtt > 6:305629/1‑110 (MQ=255) cGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCgg < 6:102835/148‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGa > 7:212923/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGa < 8:19212/149‑1 (MQ=255) tCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCgg > 1:153700/1‑141 (MQ=255) tCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCgg < 2:153700/141‑1 (MQ=255) tCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACg > 6:333881/1‑148 (MQ=255) tAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATc < 5:333881/149‑1 (MQ=255) aTCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAAcc < 8:266560/149‑1 (MQ=255) aCGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTAc < 3:112192/135‑1 (MQ=255) aCGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTAc > 4:112192/1‑135 (MQ=255) ggCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGccc < 5:35168/148‑1 (MQ=255) ggCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGccc > 6:35168/1‑148 (MQ=255) gCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGGCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAAc > 1:122835/1‑139 (MQ=255) gCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGGCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAAc < 2:122835/139‑1 (MQ=255) gCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctggt < 6:248155/149‑1 (MQ=255) aCGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGCTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctggtct > 2:282516/1‑149 (MQ=255) ggCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGTGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCtggtctggtc > 4:194759/1‑149 (MQ=255) ggCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCtggtctggtc < 4:163360/149‑1 (MQ=255) cTCAATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGAGGATGTACGCATCAGAACCGACGccc > 3:161940/1‑133 (MQ=255) catccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCcga < 4:179697/149‑1 (MQ=255) atccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGa > 2:281653/1‑94 (MQ=255) atccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGa < 1:281653/94‑1 (MQ=255) tccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctg > 6:377586/1‑134 (MQ=255) tccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctg < 5:377586/134‑1 (MQ=255) aGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGc < 2:26726/87‑1 (MQ=255) aGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGc > 1:26726/1‑87 (MQ=255) gTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACt > 7:105855/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGAt > 6:293738/1‑137 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGAt < 5:293738/137‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTc > 3:46953/1‑149 (MQ=255) | GTCCAGGCGCACCTTGTGGTCGAAGTTGCTCAGCACTTCACCGGCCTGGTCGGGGTCGAGGTAGGCGACCACGATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTC > NC_002947/4958214‑4958507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |