| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4958360 = | 54 (0.840) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.4% | coding (340/1020 nt) | fliG | flagellar motor switch protein |
| ? | NC_002947 | 4958434 = | 55 (0.910) | coding (266/1020 nt) | fliG | flagellar motor switch protein | |||||
ATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCACACCCACCCGCTGCAC > NC_002947/4958287‑4958579 | agttcgtcgacatcgtcggcgaccagaccagcctgggcgtcggttctgatgcgtacatccgcaagatgctcaaCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGtt > 7:314672‑M1/74‑149 (MQ=255) cTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGCGCAGGCTGCGGTCGACCAGGCCCTTGGCCTTTTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCa > 1:369561/1‑149 (MQ=255) gATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCt < 3:347190/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCgg < 6:102835/148‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGa > 7:212923/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGa < 8:19212/149‑1 (MQ=255) tCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCgg > 1:153700/1‑141 (MQ=255) tCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCgg < 2:153700/141‑1 (MQ=255) tCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACg > 6:333881/1‑148 (MQ=255) tAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATc < 5:333881/149‑1 (MQ=255) aTCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAAcc < 8:266560/149‑1 (MQ=255) aCGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTAc < 3:112192/135‑1 (MQ=255) aCGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTAc > 4:112192/1‑135 (MQ=255) ggCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGccc < 5:35168/148‑1 (MQ=255) ggCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGccc > 6:35168/1‑148 (MQ=255) gCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGGCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAAc > 1:122835/1‑139 (MQ=255) gCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGGCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAAc < 2:122835/139‑1 (MQ=255) gCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctggt < 6:248155/149‑1 (MQ=255) aCGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGCTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctggtct > 2:282516/1‑149 (MQ=255) ggCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGTGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCtggtctggtc > 4:194759/1‑149 (MQ=255) ggCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCtggtctggtc < 4:163360/149‑1 (MQ=255) cTCAATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGAGGATGTACGCATCAGAACCGACGccc > 3:161940/1‑133 (MQ=255) catccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCcga < 4:179697/149‑1 (MQ=255) atccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGa < 1:281653/94‑1 (MQ=255) atccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGa > 2:281653/1‑94 (MQ=255) tccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctg > 6:377586/1‑134 (MQ=255) tccaCTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGctg < 5:377586/134‑1 (MQ=255) aGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGc > 1:26726/1‑87 (MQ=255) aGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGc < 2:26726/87‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACt > 7:105855/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGAt > 6:293738/1‑137 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGAt < 5:293738/137‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTc > 3:46953/1‑149 (MQ=255) aaccaggccctgggcgaggacaaggccaacggcctggtcgaccgcatcctgctcggcggcaataccagcggcctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACt > 7:314672‑M2/77‑149 (MQ=255) ccaggccctgggcgaggacaaggccaacggcctggtcgaccgcatcctgctcggcggcaataccagcggcctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGAt < 7:388204‑M2/62‑1 (MQ=255) ccaggccctgggcgaggacaaggccaacggcctggtcgaccgcatcctgctcggcggcaataccagcggcctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGAt > 8:388204‑M2/75‑136 (MQ=255) GGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGTGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCtc > 3:194759‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCTTGTATTGCCGCGGAGCAGGTTGCGGTCGACCAGGCCGTGGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCtcatc > 2:369561‑M1/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTc < 8:212923/149‑1 (MQ=255) ccgccgAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGCCGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCgcc > 7:367505/1‑147 (MQ=255) ccgccgAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGAc < 4:46953/149‑1 (MQ=255) gccgAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGAcc > 1:106464/1‑149 (MQ=255) aGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCGCAGGCtggtctggtc > 8:68558/1‑104 (MQ=255) aGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACg > 8:128436/1‑149 (MQ=255) gATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGt > 5:393318/1‑149 (MQ=255) aTGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTg > 8:116189/1‑149 (MQ=255) ggTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGcaca > 6:345858/1‑149 (MQ=255) ggTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCACAACCGACGCCCAGGCAGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCAc > 3:121086/1‑124 (MQ=255) cGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTg < 6:393318/149‑1 (MQ=255) gACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGc < 2:106464/149‑1 (MQ=255) gACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGc > 5:402943/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGATCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCa > 5:263727/1‑148 (MQ=255) cGTTGGCCTTGTCCTCGCGCTTGGCCT‑GGGTGAGCATCTTGCGTATGTACGCATCATAACGGAGGCCCTGGCTGGTCTGGTCGGCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTgc < 6:263727/149‑1 (MQ=255) cGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTgc > 1:152782/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTgcgc < 8:105855/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATg < 7:22698/149‑1 (MQ=255) gTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTcga < 4:270549/86‑1 (MQ=255) gTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTcga > 3:270549/1‑86 (MQ=255) tCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCcaca < 5:271206/147‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCcaca > 6:271206/1‑147 (MQ=255) tCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCAcacc > 6:392676/1‑149 (MQ=255) tCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGACGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCAcacc > 3:192751/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCAcaccca > 7:301235/1‑149 (MQ=255) gcctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCACACCCACCCGCTg < 7:116189‑M2/143‑1 (MQ=255) ctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACg > 5:164494‑M2/5‑105 (MQ=255) ctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACg < 6:164494‑M2/101‑1 (MQ=255) ctggTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGACCATCTGCGCCATGGCCACACACACCCGCTGCa > 5:341310‑M2/5‑149 (MQ=255) gTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCACACCCACCCGCTGCAc < 5:345858‑M2/146‑1 (MQ=255) | ATGGCCTGGATCTGCGGGTGCTCATAGCGGATCACGTCGGCCACGGCACGCGGCTCCATCCACTTGAGGCTGTCCAGGCCGCTGGTATTGCCGCCGAGCAGGATGCGGTCGACCAGGCCGTTGGCCTTGTCCTCGCCCAGGGCCT‑GGTTGAGCATCTTGCGGATGTACGCATCAGAACCGACGCCCAGGCTGGTCTGGTCGCCGACGATGTCGACGAACTCGCTCATCACCTGTTCGACCTGGTCACGGTGCACATTGCCCATCTGCGCCATGGCCACACCCACCCGCTGCAC > NC_002947/4958287‑4958579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |