| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GGCGTAGGCGTTAATTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTT > NC_002947/6164872‑6165165 | ggCGTAGGCGTTAATTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑a > 8:273946/1‑149 (MQ=255) gCGTAGGCGTTAATTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑At < 7:251371/149‑1 (MQ=255) gTTAATTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGc > 6:99965/1‑149 (MQ=255) aTTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCt < 6:318159/148‑1 (MQ=255) aTTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTc < 7:313151/149‑1 (MQ=255) ttAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTc > 3:168955/1‑148 (MQ=255) gggCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATg < 1:87497/149‑1 (MQ=255) ggCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATgg < 3:134494/149‑1 (MQ=255) gATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGc < 8:238759/149‑1 (MQ=255) atcatcGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCcatggcttacacccatcgagggcgttgc > 5:352781‑M1/1‑120 (MQ=255) tcatcGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCa > 1:382654/1‑149 (MQ=255) catcGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCAt > 1:269454/1‑149 (MQ=255) gctcgcGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGga > 7:273946‑M2/1‑146 (MQ=255) gctcgcGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCACATGCTCcatggcttacacccatcgagggcgttgccatcgag > 5:359908‑M1/1‑114 (MQ=255) gcgAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCcatggcttacacccatcgagggcgttgccatcgagcatc < 6:352781‑M1/149‑40 (MQ=255) gcgAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCcatggcttacacccatcgagggcgttgccatcgagcat < 6:359908‑M1/148‑39 (MQ=255) gcgAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATggagga < 6:395517/147‑1 (MQ=255) gcgAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATggagga < 5:101075/147‑1 (MQ=255) 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cTCGCCGATACTCCGGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTg < 4:320387/149‑1 (MQ=255) tCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGa > 3:75221/1‑149 (MQ=255) gCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGAt < 2:286838/148‑1 (MQ=255) cGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTg > 3:50396/1‑144 (MQ=255) gATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATgtgt < 1:115009/149‑1 (MQ=255) gATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTACTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATGAggt < 5:151399/135‑1 (MQ=255) aTACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGtt > 3:78618/1‑149 (MQ=255) taatCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTAAATCGGACGGAAAATCATCAAACAGCCACCCAATCTAGACTTCCTACTAAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTACTGATGTGttt > 8:258678/4‑149 (MQ=255) cTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTcc < 4:78618/149‑1 (MQ=255) tCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGcc < 5:150770/96‑1 (MQ=255) tCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGcc > 6:150770/1‑96 (MQ=255) ccAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCa > 2:283937/1‑149 (MQ=255) cAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGcctcc > 3:224309/1‑97 (MQ=255) cAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGcctcc < 4:224309/97‑1 (MQ=255) aGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGgagcatctggagtatcggcgagcttcaaagaaagaaagctacgagcagaaggtggacaagcgttttgctgcgatatctggcttggttgctcgccaaaatgaaatcctcg < 7:126848‑M2/149‑110 (MQ=255) aGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATc < 2:143433/149‑1 (MQ=255) gATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGgagcatctggagtatcggcgagcttcaaagaaagaaagctacgagcagaaggtggacaagcgttttgctgcgatatctggcttggttgctcgccaaaatgaaatcctcgc < 6:352781‑M2/149‑111 (MQ=255) cTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGgagcatgtggagtatcggcgagcttcaaagaaagaaagctacgagcagaaggtggacaagcgttttgctgcgatatctggcttggttgctcgccaaaatgaaatcctcgcgagc > 5:359908‑M2/1‑35 (MQ=255) tCcatggcttacacccatcgagggcgttgccatcgagcatctggagtatcggcgagcttcaaagaaagaaagctacgagcagaaggtggacaagcgttttgctgcgatatctggcttggttgctcgccaaaatgaaatcctcgcgagc > 7:273946‑M1/1‑2 (MQ=255) tCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAggtgggt > 6:312446/1‑125 (MQ=255) tCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAggtgggt < 5:312446/125‑1 (MQ=255) tCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCttt > 2:264647/1‑149 (MQ=255) | GGCGTAGGCGTTAATTAGGGCGTCAGGATCATCGCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTT > NC_002947/6164872‑6165165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |