| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCGAACACGGTTTTGCCGG > NC_002947/6164905‑6165196 | gctcgcGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGga > 7:273946‑M2/1‑146 (MQ=255) gctaGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCATAAAAACGCTTGTCCAGCTTGTTCTCGTATCTTTCTTTCTTTTAATCTCGGCGATACTCCAGATGGTGG‑ATGGAAACGGCCTCTTTGGGTTTAAGGGATGGTGGAGt < 4:168955/146‑1 (MQ=255) gcgAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATggagga < 1:200862/147‑1 (MQ=255) 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< 6:242857/139‑1 (MQ=255) aTTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCg < 5:99965/149‑1 (MQ=255) ttttGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCGCATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGc < 1:297128/147‑1 (MQ=255) ttttGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGc > 2:297128/1‑146 (MQ=255) ctcgCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGt < 2:326620/145‑1 (MQ=255) gCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCa < 3:397750/148‑1 (MQ=255) 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5:359908‑M2/1‑35 (MQ=255) tCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAggtgggt < 5:312446/125‑1 (MQ=255) tCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAggtgggt > 6:312446/1‑125 (MQ=255) g‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCttt < 3:185452/147‑1 (MQ=255) ggcgttgCCATCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAAtt > 3:339208/7‑149 (MQ=255) gCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGgagcatctggagtatcggcgagcttcaaagaaagaaagctacgagcagaaggtggacaagcgttttgctgcgatatctggcttggttgctcgccaaaatgaaatcctcgcgagcgatgat > 5:352781‑M2/1‑28 (MQ=255) 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aCGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGAc < 6:197617/149‑1 (MQ=255) cGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGtt < 4:295114/126‑1 (MQ=255) cGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGtt > 3:295114/1‑126 (MQ=255) cGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGAcc < 4:298095/149‑1 (MQ=255) cGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCg > 3:120789/1‑148 (MQ=255) tAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCGAACACGGtt < 1:283937/148‑1 (MQ=255) tAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCGAACACGGtt < 3:302394/148‑1 (MQ=255) ccATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCGAACACGGTTTTGcc < 4:339208/149‑1 (MQ=255) cATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCa > 7:281926/1‑111 (MQ=255) cATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCa < 8:281926/111‑1 (MQ=255) cATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCGAACACGGTTTTGCCg > 5:248745/1‑149 (MQ=255) | GCTCGCGAGGATTTCATTTTGGCGAGCAACCAAGCCAGATATCGCAGCAAAACGCTTGTCCACCTTCTGCTCGTAGCTTTCTTTCTTTGAAGCTCGCCGATACTCCAGATGCTCG‑ATGGCAACGCCCTCGATGGGTGTAAGCCATGGAGGAGTTGAATCGGCCGGTCCATCCTCAACCAGCCACCCATTCTCGACTGCCTCCTCAAAATCAAACTGGCTCAGTTGGATCAGGTGGGTGCTGATGTGTTTCCCATCGTCTTTGAATTCGACCAAGCGAACACGGTTTTGCCGG > NC_002947/6164905‑6165196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |