| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2273507 = | 55 (0.860) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.7% | coding (860/1041 nt) | PP_2004 | AraC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 2273535 = | 47 (0.760) | coding (832/1041 nt) | PP_2004 | AraC family transcriptional regulator | |||||
TGCGCGCTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCT > NC_002947/2273389‑2273683 | tGCGCGCTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCt < 6:331046/149‑1 (MQ=255) cgcgcTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCtt < 4:227900/148‑1 (MQ=255) cgcgcTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTCCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTg < 8:289521/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTgc > 5:223482/1‑149 (MQ=255) tgggtgagcgcatcacccacctgctgggcccgctgctcaatggcggccgtgaaccggacctggaagaagtggcgctgcacttgcagctaccaagctggaccttgcgccgcaagcTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTgcg > 3:42997‑M1/115‑149 (MQ=255) gcTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGCCTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCGCCGCGAGCTGgcgg > 7:283154/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGgcgc > 3:68089/1‑148 (MQ=255) gAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGCTCTCGGCCATGTCGCGCACGGTATAGTTGAACAGCTCGCGAA‑AGCGCGACACTTCCTCCGCGAGCTTGCGgcgc > 6:28590/1‑148 (MQ=255) ccTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGATCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTc < 5:28590/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAACGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTc > 1:139443/1‑148 (MQ=255) gAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTgg < 6:223482/149‑1 (MQ=255) aGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTgg > 3:24602/1‑147 (MQ=255) aGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTa < 2:12127/149‑1 (MQ=255) gCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAACAGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAg < 1:268868/136‑1 (MQ=255) gCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGCTCGCGCCCCGTTTAGTAGAGAAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAg > 2:268868/1‑135 (MQ=255) cAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGc < 8:141800/149‑1 (MQ=255) cccAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCaa < 6:73612/128‑1 (MQ=255) cccAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCaa > 5:73612/1‑128 (MQ=255) cccAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTAAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCaa > 3:265887/1‑149 (MQ=255) ccAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAg > 7:215693/1‑149 (MQ=255) aGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAg > 7:370862/1‑149 (MQ=255) gATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGTGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAgc < 8:215693/149‑1 (MQ=255) gCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGGTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCAc > 5:217165/1‑149 (MQ=255) cGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCAGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACttcttc > 4:248003/1‑148 (MQ=255) gCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTAGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACttcttc > 2:411174/1‑147 (MQ=255) cAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTcc < 7:311489/146‑1 (MQ=255) cAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAgg > 3:83688/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTCAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCgg < 4:265887/149‑1 (MQ=255) gtgtCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGgcc < 4:24602/149‑1 (MQ=255) cGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCAtt < 3:248003/149‑1 (MQ=255) aTGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTgcg > 6:18020/1‑77 (MQ=255) aTGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTgcg < 5:18020/77‑1 (MQ=255) aGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCCAGGCCGCCATTGagcagc > 4:44130/1‑149 (MQ=255) ggTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCg > 3:138772/1‑149 (MQ=255) gTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGC‑TGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACGTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCggg > 2:127886/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCggg > 2:181527/1‑149 (MQ=255) ttgcagctaccaagctggaccttgcgccgcaagcTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGc < 8:326794‑M1/30‑1 (MQ=255) ttgcagctaccaagctggaccttgcgccgcaagcTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGc > 7:326794‑M1/35‑64 (MQ=255) ctcGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGc > 1:392781/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCcagc < 6:217165/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAggtg > 2:69076/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAggtggg < 4:83688/149‑1 (MQ=255) gagacGGGTTTCGTTGAGCTGGTGGCTAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCTAGCTTGCGGCGCAAGGTCGAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCGTCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAggtggg < 8:370862/145‑1 (MQ=255) gcCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAggtgggt > 2:116084/1‑148 (MQ=255) cGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGAt < 1:116084/149‑1 (MQ=255) gTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGc > 6:16755/1‑81 (MQ=255) gTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGc < 5:16755/81‑1 (MQ=255) tttCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATgcgc > 6:109889/1‑149 (MQ=255) tCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCt < 4:68089/148‑1 (MQ=255) gTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCAc > 5:394902/1‑149 (MQ=255) tGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCAc < 1:257112/102‑1 (MQ=255) tGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCAc > 2:257112/1‑102 (MQ=255) cgcaagctcgcggaggaaggcacgcgctttcgcgaGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCa > 3:42997‑M2/36‑149 (MQ=255) gCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTGACCCAGa > 1:165992/1‑149 (MQ=255) gctcgcggaggaaggcacgcgctttcgcgaGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCaa < 8:326794‑M2/34‑1 (MQ=255) gctcgcggaggaaggcacgcgctttcgcgaGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCaa > 7:326794‑M2/31‑64 (MQ=255) TCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTgcg > 1:411174‑M1/1‑149 (MQ=255) GCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTgcgc > 6:71543‑M1/1‑148 (MQ=255) GAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAggtggg > 1:194908‑M1/1‑123 (MQ=255) GAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAggtggg < 2:194908‑M1/123‑1 (MQ=255) GAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTGCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCCACCAGCCTGCGCAcc < 8:299255‑M1/149‑1 (MQ=255) cctccGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACGCGGGTgcgcagtct < 6:394902/148‑6 (MQ=255) gcgaGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGctc > 7:64642‑M2/5‑149 (MQ=255) gCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATg > 6:324712/1‑104 (MQ=255) gCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATg < 5:324712/104‑1 (MQ=255) gCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCt > 8:78660/1‑149 (MQ=255) | TGCGCGCTGGAAGGCCTCGGCCGAAGCAAACCCCAACAGATAGGCTATCTCGCCAAAGGCCAGCGCCGTGTCACGGATGTAGGTCTCGGCCAGGTCGCGCCGGGTTTCGTTGAGCAGGTCGCGAA‑AGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCT > NC_002947/2273389‑2273683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |