New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2957557 = | 48 (0.750) | 3 (0.050) | 3/236 | NT | 6.1% | coding (317/1494 nt) | PP_2589 | aldehyde dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | 2957615 = | 48 (0.810) | coding (375/1494 nt) | PP_2589 | aldehyde dehydrogenase family protein |
GGCGCCGGGCGAGCGCAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGATATGGCCGCCTG > NC_002947/2957468‑2957761 | ggCGCCGGGCGAGCGCAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATgtgt > 1:125801/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGGCGAGCGCAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGtt < 2:125801/149‑1 (MQ=255) cgcCGGGCGAGCGCAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTc < 4:354985/149‑1 (MQ=255) gAGCGCAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTa > 1:387032/1‑149 (MQ=255) cgcAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACgg < 7:160122/149‑1 (MQ=255) gcAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGc > 3:78145/1‑149 (MQ=255) aaaGAAATTTCTGCTGCGGCTGGGCGATCTGATCATGGGCCATCGTGAATAACTTGCATTGCTGGACTAGCTGAACATGGGCTAACCGGTGATGTATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCg < 3:347514/148‑1 (MQ=255) gAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTg > 4:405688/1‑138 (MQ=255) ctgctgcGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGa > 1:104859/1‑149 (MQ=255) ctgcggcGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGACGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTgg < 3:255071/148‑1 (MQ=255) tggcagcagtgggcgccacctggtcatacagcttgtccagcgcctcgccgtaccaggcgaacACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCAtgtg > 1:218940‑M1/63‑121 (MQ=255) tggcagcagtgggcgccacctggtcatacagcttgtccagcgcctcgccgtaccaggcgaacACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCAtgtg < 2:218940‑M1/59‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGc < 2:387032/148‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTg > 2:20371/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGa > 5:6862/1‑149 (MQ=255) ccGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGAc > 6:249218/1‑149 (MQ=255) aTGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGgcgc < 6:6862/148‑1 (MQ=255) gCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCAc < 1:20371/149‑1 (MQ=255) ccATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCActg < 6:168008/149‑1 (MQ=255) ccATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGACTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCAct > 5:392571/1‑148 (MQ=255) tCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCActgctg < 7:265675/149‑1 (MQ=255) gTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGcc < 1:196483/149‑1 (MQ=255) tGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGcc > 8:192135/1‑148 (MQ=255) aagaaCTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAAt < 2:104859/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATgcg < 5:249218/149‑1 (MQ=255) aCTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCAACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATgcgc > 1:101579/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTAt > 7:87857/1‑112 (MQ=255) aTTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTAt < 8:87857/112‑1 (MQ=255) aTTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGCTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGcca > 3:307113/1‑149 (MQ=255) gACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCAc < 3:174520/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGAACATGGTCAAACCGGTGAGTGATTCCTACAACATCTAGGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGTACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCAccc < 6:392571/149‑1 (MQ=255) gCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCcgc > 7:107227/1‑148 (MQ=255) cTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTg > 5:133173/1‑108 (MQ=255) cTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTg < 6:133173/108‑1 (MQ=255) tGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGgcg < 3:271597/110‑1 (MQ=255) tGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGgcg > 4:271597/1‑110 (MQ=255) cacatgggcagaacccggcacgtcgatgttgtaggcatccatcaccggtttgcccatgtGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCa > 1:218940‑M2/60‑121 (MQ=255) cacatgggcagaacccggcacgtcgatgttgtaggcatccatcaccggtttgcccatgtGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCa < 2:218940‑M2/62‑1 (MQ=255) aaCATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGaa < 8:107227/147‑1 (MQ=255) aaCATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGc < 4:78145/149‑1 (MQ=255) catgggcagaacccggcacgtcgatgttgtaggcatccatcaccggtttgcccatgtGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGccc > 5:360822‑M2/58‑149 (MQ=255) GCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGc < 8:324085‑M1/149‑1 (MQ=255) cGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTc > 1:44270/1‑149 (MQ=255) cGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTc > 5:90104/1‑149 (MQ=255) ggTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCg > 6:197175/1‑149 (MQ=255) gCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCgtggt > 2:139987/1‑149 (MQ=255) ccTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCgtggt < 6:90104/148‑1 (MQ=255) tACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGc > 1:1649/1‑148 (MQ=255) tACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGc > 7:138876/1‑148 (MQ=255) tACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGc > 5:30754/1‑148 (MQ=255) tACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGc > 7:133032/1‑148 (MQ=255) acaacaTCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGAc > 1:40450/1‑59 (MQ=255) acaacaTCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGAc < 2:40450/59‑1 (MQ=255) caacaTCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCa < 7:10031/148‑1 (MQ=255) aCGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTc < 8:138876/149‑1 (MQ=255) aCGTGCCGGGGTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTc < 8:133032/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTATGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCt < 1:139987/149‑1 (MQ=255) gTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGat < 2:1649/149‑1 (MQ=255) cTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGATATg > 1:330232/1‑149 (MQ=255) gCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGATGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGAGCCAACTGCTGCAAATGCGCTGGCCACAATCACCCGCGAAGCCCTCTGCGTGATCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTACCGCGAGAAATGgc > 7:375972/1‑149 (MQ=255) cccatgtGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGATATGgcc > 4:404515‑M2/8‑149 (MQ=255) catgtGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACGCGCGAAGCGCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGACCTTCCCGCTCGATATGggcgc > 8:181303‑M2/6‑149 (MQ=255) atgtGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGATATGgccgcc > 5:274095‑M2/5‑149 (MQ=255) tGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGATATGGCCGCCTg > 4:89071‑M2/2‑148 (MQ=255) | GGCGCCGGGCGAGCGCAAGAAAGTGCTGCTGCGGCTGGCCGAGCTGATCATGGCCCATCGTGAAGAACTGGCATTGCTGGACTCGCTGAACATGGGCAAACCGGTGATGGATGCCTACAACATCGACGTGCCGGGTTCTGCCCATGTGTTCGCCTGGTACGGCGAGGCGCTGGACAAGCTGTATGACCAGGTGGCGCCCACTGCTGCCAATGCGCTGGCCACCATCACCCGCGAAGCCCTCGGCGTGGTCGCTGCCGTGGTGCCATGGAACTTCCCGCTCGATATGGCCGCCTG > NC_002947/2957468‑2957761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |