New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2968028 | 37 (0.580) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 9.7% | coding (386/1794 nt) | PP_2596 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 2968071 | 38 (0.610) | coding (343/1794 nt) | PP_2596 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
AATCAGCACGGCGCCCACGGTGCGGCCCAGTGTGGTGAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGCCCGATGTGGCG > NC_002947/2967928‑2968219 | aaTCAGCACGGCGCCCACGGTGCGGCCCAGTGTGGTGAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCt < 1:354179/149‑1 (MQ=255) cccACGGTGCGGCCCAGTGTGGTGAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCAc < 4:116624/149‑1 (MQ=255) ccACGGTGCGGCCCAGTGTGGTGAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTCGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCAcg > 5:4571/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTGTGGTGAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAggtgat > 3:158698/1‑149 (MQ=255) tgAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTgg > 3:30379/1‑149 (MQ=255) gAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCTCTTGATGCCCGCTCGCAGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGt > 7:261417/1‑149 (MQ=255) gAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGt > 2:245302/1‑149 (MQ=255) aaaaGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTCGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGtt < 6:4571/148‑1 (MQ=255) cgcgGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCt < 3:105970/149‑1 (MQ=255) cAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAggtgatgggtgatg < 2:133387/121‑1 (MQ=255) cAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAggtgatgggtgatg > 1:133387/1‑121 (MQ=255) gtgtGCCGATGTCGGCCTGGATGGCCCGTTTCTCTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACGAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCAtttag < 8:83112/149‑3 (MQ=255) cGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCg > 6:224357/1‑149 (MQ=255) gCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCTCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTc < 8:261417/149‑1 (MQ=255) gCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCAt < 3:304996/146‑1 (MQ=255) gCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCAt > 4:304996/1‑146 (MQ=255) gCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGc < 5:224357/148‑1 (MQ=255) cccGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCa < 5:237540/149‑1 (MQ=255) ccGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAgg > 5:40530/1‑139 (MQ=255) ccGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAgg < 6:40530/139‑1 (MQ=255) tttCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGgcgaagtgaaacgggccacgcaggacgacatcggcacactgcacagcctgaccgcgcactttttcaccacactgggccgcaccgtgggcgccgtg < 6:177729‑M2/149‑96 (MQ=255) tttCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGa < 4:30379/149‑1 (MQ=255) aCTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCAt < 8:196354/137‑1 (MQ=255) aCTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCAt > 7:196354/1‑137 (MQ=255) aCTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAg > 6:169697/1‑149 (MQ=255) ttCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGc > 7:91250/1‑149 (MQ=255) ttGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGgcgaagtgaaacgggccatgcaggacgacatcggca < 1:388831‑M2/79‑37 (MQ=255) ttGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGgcgaagtgaaacgggccatgcaggacgacatcggca > 2:388831‑M2/1‑43 (MQ=255) tGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATgc > 4:60915/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATgct > 4:97450/1‑149 (MQ=255) cccGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGgcgaagtgaaacgggccatgcaggacgacatcggcacactgcacagcctgaccgcgcactttttcaccacactgggccgcaccgttggcgccgggcggagttccgtggccta < 4:239308‑M2/149‑113 (MQ=255) ccGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCTCAGGTGATGGTTGATGTGGTTGTCGGCATGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGATGGCGATgctgg > 4:403664/1‑149 (MQ=255) gctGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGa > 6:190971/1‑149 (MQ=255) gctGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGa < 3:97450/149‑1 (MQ=255) aaCCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGc > 5:323892/1‑149 (MQ=255) cAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCg > 6:70731/1‑149 (MQ=255) aGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAAt < 5:70731/149‑1 (MQ=255) aCTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGcc > 3:128844/1‑149 (MQ=255) cTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGccc < 5:190971/149‑1 (MQ=255) ttGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGccc > 7:77448/1‑148 (MQ=255) ttGCATCAGGCCCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGt < 8:97287/102‑1 (MQ=255) ttGCATCAGGCACTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGt > 7:97287/1‑102 (MQ=255) gCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGCCCGa < 5:169697/148‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGCCCGATGTGGCg > 2:82085/1‑149 (MQ=255) | AATCAGCACGGCGCCCACGGTGCGGCCCAGTGTGGTGAAAAAGTGCGCGGTCAGGCTGTGCAGTGTGCCGATGTCGTCCTGCATGGCCCGTTTCACTTCGCTTGATGCCCGCTCGCTGAACCAGCCGAGCGGCACTTGCATCAGGCGCTGGCCGATCGCCACGCGCAGGTGATGGGTGATGTGGTTGTCGGCCTGGTGCGCCAGCATTTCGGCTGCGGTGATCAGGGTCATGCCAGTGAACAGGCTGGCGATGCTGGCTGCGATGGCCCGGCCAATGGCGCCCGATGTGGCG > NC_002947/2967928‑2968219 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |