New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3604849 = | 47 (0.730) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.2% | coding (69/1041 nt) | PP_3180 | Smp‑30/Cgr1 family protein |
? | NC_002947 | 3604934 = | 45 (0.730) | coding (154/1041 nt) | PP_3180 | Smp‑30/Cgr1 family protein |
TTACTCACCTGGCCGGTGCGCTGTGCCATCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTGGCGGGCGCATCAACGGCCT > NC_002947/3604788‑3605070 | ttACTCACCTGGCCGGTGCGCTGTGCCATCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGc < 2:140412/149‑1 (MQ=255) caaggtccgcgcgcgtgttggccactttgaccggcacgtaattgcattccttgatgcggctCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGc > 7:31045‑M1/62‑149 (MQ=255) cTGGCCGGTGCGCTGTGCCATCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCCCACGCGGGACCTTGACCGGGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATc > 1:364640/1‑147 (MQ=255) cGGTGCGCTGTGCCATCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACCAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAAt < 7:178099/149‑1 (MQ=255) tgCCATCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGt < 7:279923/149‑1 (MQ=255) aTCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAAtt < 5:9736/141‑1 (MQ=255) aTCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAAtt > 6:9736/1‑141 (MQ=255) aTCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGACACCCGCTACAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGAGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATCCAATTACGTCCCg > 1:374526/1‑149 (MQ=255) cACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGaa < 8:156210/130‑1 (MQ=255) cACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGaa > 7:156210/1‑130 (MQ=255) cACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGa > 5:33619/1‑129 (MQ=255) cACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGa < 6:33619/129‑1 (MQ=255) cACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTc > 7:107834/1‑148 (MQ=255) aCTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCTGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCa > 3:372744/1‑148 (MQ=255) aCTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAg < 2:88415/126‑1 (MQ=255) aCTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAg > 1:88415/1‑126 (MQ=255) aTTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGt < 4:191756/148‑1 (MQ=255) aTTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTg > 3:191756/1‑149 (MQ=255) aTTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTg > 1:247373/1‑149 (MQ=255) gcCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACAcgcgcgc > 1:250101/1‑149 (MQ=255) tAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACTCTCGGGAGCTTGTCCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCATGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGAGCTTg < 2:374526/149‑1 (MQ=255) gctccagcgctcggccacctgcacacggtcaaggtcccgagtgtggctgacactgctgtgttcgttgaagcgggtggcgatgtgctggAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTg > 7:31045‑M2/89‑149 (MQ=255) gCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGt < 8:53078/149‑1 (MQ=255) ccagcgctcggccacctgcacacggtcaaggtcccgagtgtggctgacactgctgtgttcgttgaagcgggtggcgatgtgctggAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGc > 5:347895‑M2/86‑126 (MQ=255) ccagcgctcggccacctgcacacggtcaaggtcccgagtgtggctgacactgctgtgttcgttgaagcgggtggcgatgtgctggAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGc < 6:347895‑M2/41‑1 (MQ=255) GCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCTGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGaaa > 4:372744‑M1/1‑149 (MQ=255) GCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGaaa > 2:247373‑M1/1‑149 (MQ=255) GCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGa < 2:185630‑M1/147‑1 (MQ=255) acaTCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGc > 6:124492/1‑149 (MQ=255) cGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACAATCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATAACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACCCGCGCGGACCATGGTGAAAGCCAgg > 3:127641/1‑149 (MQ=255) cACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGt > 8:20944/1‑136 (MQ=255) cACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGt < 7:20944/136‑1 (MQ=255) ccGCTTCAACGAAGACAGCAGTGTCAGCCACACTAGGGACCTTGACGGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTggg < 4:127641/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTg > 6:15663/1‑147 (MQ=255) ccGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTg < 5:15663/147‑1 (MQ=255) gCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGAt < 8:107834/149‑1 (MQ=255) cacacggtcaaggtcccgagtgtggctgacactgctgtgttcgttgaagcgggtggcgatgtgctggAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGa < 8:31045‑M2/80‑1 (MQ=255) ttCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATg > 5:347128/1‑148 (MQ=255) acacAGCAGTGGCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAACGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTg < 2:364640/149‑1 (MQ=255) acaGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGc < 1:185630/149‑1 (MQ=255) agcagTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGt > 2:169598/1‑149 (MQ=255) gcagTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTg < 2:250101/149‑1 (MQ=255) tgtCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGc < 8:348533/146‑1 (MQ=255) tgtCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGc > 7:348533/1‑146 (MQ=255) ccACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTg < 6:347128/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTg > 8:291639/1‑149 (MQ=255) cTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTgg > 5:424501/1‑149 (MQ=255) tGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTggcg > 3:226249/1‑149 (MQ=255) gACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTAc < 3:312925/51‑1 (MQ=255) gACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTAc > 4:312925/1‑51 (MQ=255) aGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTGGCGGGCGCATCAAc > 3:123953/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTGGCGGGCGCATCAACGGCCt < 5:124492/149‑1 (MQ=255) ccGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTggc < 6:401896/131‑1 (MQ=255) ccGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTggc > 5:401896/1‑131 (MQ=255) | TTACTCACCTGGCCGGTGCGCTGTGCCATCCCACTGATTGCACCTTGCGCGCCAGCAATAGCCAGCACATCGCCACCCGCTTCAACGAACACAGCAGTGTCAGCCACACTCGGGACCTTGACCGTGTGCAGGTGGCCGAGCGCTGGAGCCGCATCAAGGAATGCAATTACGTGCCGGTCAAAGTGGCCAACACGCGCGCGGACCTTGGTGAAAGCCTGGTCTGGGATGAACGCAGTGGCGTGCTGTACTTTGTCGATATCTCTGGCGGGCGCATCAACGGCCT > NC_002947/3604788‑3605070 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |