New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4948510 = | 53 (0.830) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.9% | coding (338/435 nt) | fliO | flagellar protein FliO |
? | NC_002947 | 4948556 = | 46 (0.760) | coding (292/435 nt) | fliO | flagellar protein FliO |
ACTTGTTGTCCTTAGGGTCCTTGCCCATCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATCAGG > NC_002947/4948415‑4948701 | aCTTGTTGTCCTTAGGGTCCTTGCCCATCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATc > 5:185213/1‑149 (MQ=255) gggtgggcaggtgatcgagattgtcggcagccgtgccatcggcccgcgtgaccgcctgctgctggtgcaggtgggcaaggagcagatcctgaTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGAt > 1:296236‑M1/93‑139 (MQ=255) gggtgggcaggtgatcgagattgtcggcagccgtgccatcggcccgcgtgaccgcctgctgctggtgcaggtgggcaaggagcagatcctgaTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGAt < 2:296236‑M1/47‑1 (MQ=255) cTTGCCCATCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCa > 6:350464/1‑149 (MQ=255) ccATCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACcag > 6:301566/1‑148 (MQ=255) cATCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACcag > 3:234446/1‑147 (MQ=255) aTCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGCTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCAACCTGCACcagcag > 3:384226/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACcagcag > 1:406542/1‑148 (MQ=255) cATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCg < 3:353936/147‑1 (MQ=255) cATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGCGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCg > 4:353936/1‑147 (MQ=255) tCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCAc < 5:148413/127‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCAc > 6:148413/1‑127 (MQ=255) gCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCAcgc > 5:88268/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGc < 4:238103/126‑1 (MQ=255) cGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGc > 3:238103/1‑126 (MQ=255) tGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGc > 4:2856/1‑115 (MQ=255) tGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGc < 3:2856/115‑1 (MQ=255) aaaCTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATgg < 4:234446/149‑1 (MQ=255) gTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGcc > 8:21561/1‑149 (MQ=255) cTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACa > 6:223024/1‑148 (MQ=255) aCGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAAtct < 5:350464/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAAtctc < 7:21561/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAAtcac < 5:223024/149‑3 (MQ=255) gggCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCa < 2:317207/75‑1 (MQ=255) gggCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCa > 1:317207/1‑75 (MQ=255) gcgcTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGAt < 2:406542/149‑1 (MQ=255) gcTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACTTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCa > 7:121270/1‑149 (MQ=255) gcTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCgg > 3:357832/1‑117 (MQ=255) gcTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCgg < 4:357832/117‑1 (MQ=255) ttGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCAcc > 3:377015/1‑149 (MQ=255) gCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTg > 3:16868/1‑149 (MQ=255) gCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTg > 2:333124/1‑149 (MQ=255) ccGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCCCGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGc > 2:156713/1‑149 (MQ=255) ccGGCACTTCCACGGGTGCGGCCAGTACGTGCTGGGCGTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGc < 1:133334/149‑1 (MQ=255) cTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACAGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCAccc < 3:273063/149‑1 (MQ=255) ccACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGa > 8:322692/1‑123 (MQ=255) ccACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGGCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGa < 7:322692/123‑1 (MQ=255) cACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTTCACACCTGCACCCGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCa > 5:1043/1‑149 (MQ=255) cACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCa > 2:352975/1‑149 (MQ=255) cACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCa > 6:182408/1‑149 (MQ=255) gggTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTg < 4:377015/149‑1 (MQ=255) atcggccatacccccggcaccatcgaggccctgcacgtactggccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCAccc > 1:296236‑M2/48‑139 (MQ=255) atcggccatacccccggcaccatcgaggccctgcacgtactggccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCAccc < 2:296236‑M2/92‑1 (MQ=255) CCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAAtc < 3:23582‑M1/116‑1 (MQ=255) CCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAAtc > 4:23582‑M1/1‑116 (MQ=255) CCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCg < 5:254863‑M1/119‑1 (MQ=255) CCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCg > 6:254863‑M1/1‑119 (MQ=255) catacccccggcaccatcgaggccctgcacgtactggccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGctct > 1:195356‑M2/42‑149 (MQ=255) gTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGC‑GTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTg > 6:222977/1‑147 (MQ=255) gTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGgc > 6:260004/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGAt < 6:380353/88‑1 (MQ=255) gCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGAt > 5:380353/1‑88 (MQ=255) cAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCTGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGcgcc < 8:121270/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGgcgc < 4:16868/148‑1 (MQ=255) ggCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCgca > 8:248223/1‑149 (MQ=255) ccTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCgcag > 5:112958/1‑148 (MQ=255) gTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAgccaggc > 6:390422/1‑149 (MQ=255) ggccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGC‑GTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATc < 5:222977‑M2/142‑1 (MQ=255) gccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATc < 6:1043‑M2/143‑1 (MQ=255) ccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATCAg < 5:390422‑M2/145‑1 (MQ=255) ccgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATCAg < 6:185213‑M2/145‑1 (MQ=255) cgaTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATCAgg < 6:88268‑M2/146‑1 (MQ=255) aTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCagaaaga < 7:319254‑M2/138‑1 (MQ=255) aTCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCagaaaga > 8:319254‑M2/2‑139 (MQ=255) tCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCagaaagaa > 1:373572/1‑139 (MQ=255) tCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCagaaagaa < 2:373572/139‑1 (MQ=255) | ACTTGTTGTCCTTAGGGTCCTTGCCCATCAGCTCCATCAGCCGCTGGGCAAACTCCGGCGTCGCCTGACGGGCGCTTGCCGGCACTTCCACGGGTTCGGCCAGTACGTGCAGGGCCTCGATGGTGCCGGGGGTATGGCCGATCAGGATCTGCTCCTTGCCCACCTGCACCAGCAGCAGGCGGTCACGCGGGCCGATGGCACGGCTGCCGACAATCTCGATCACCTGCCCACCCTTCACTGCGGTGCTCTGCAGGCGCCGCAGCAGCCAGGCCAGAAAGAAGATCAGG > NC_002947/4948415‑4948701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |