New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6059076 | 47 (0.730) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 8.4% | coding (116/1404 nt) | PP_5311 | signal transduction protein |
? | NC_002947 | = 6059088 | 43 (0.710) | coding (128/1404 nt) | PP_5311 | signal transduction protein |
CAGTGGATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGATGCTCGACAA > NC_002947/6058946‑6059235 | cAGTGGATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTgcagg > 7:211838‑M2/1‑143 (MQ=255) cAGTGGATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCCGCGGCTTCGCGGGTgcagg > 2:177803‑M2/1‑143 (MQ=255) gTGGATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTg > 3:288804/1‑149 (MQ=255) tGGATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGt > 2:164943/1‑149 (MQ=255) gATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTc < 8:165477/148‑1 (MQ=255) cGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTtct < 1:164943/149‑1 (MQ=255) ggACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCCGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTtctc > 6:91094/1‑149 (MQ=255) aTGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTcgacga > 5:165147/1‑149 (MQ=255) aCTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTcgacgac > 7:96950/1‑147 (MQ=255) cTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTtc < 1:86785/138‑1 (MQ=255) cTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTtc > 2:86785/1‑138 (MQ=255) cccTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGcc > 7:221102/1‑149 (MQ=255) ccTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTcc < 8:235558/125‑1 (MQ=255) tGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGgc < 2:383518/143‑1 (MQ=255) tGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGgc > 1:383518/1‑143 (MQ=255) gACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCAt < 6:165147/149‑1 (MQ=255) acacCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATg < 4:288804/149‑1 (MQ=255) acacCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGCCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATg < 7:216526/149‑1 (MQ=255) cGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACCCTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGCGGTCGGCGCCCTCATGGTGc > 5:200147/1‑149 (MQ=255) gCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCt < 2:339605/149‑1 (MQ=255) cccACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTcc > 4:268131/1‑149 (MQ=255) cacaCGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCg > 7:30169/1‑149 (MQ=255) cacaCGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCg > 5:105731/1‑149 (MQ=255) acGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCag > 4:341913/1‑149 (MQ=255) cccTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCa > 8:360343/1‑149 (MQ=255) gTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACctgct > 7:197619/1‑149 (MQ=255) ctCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGAcc < 4:274205/139‑1 (MQ=255) ctCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGAcc > 3:274205/1‑139 (MQ=255) gACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTgg < 8:30169/148‑1 (MQ=255) gACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTgg < 6:105731/148‑1 (MQ=255) gACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGc > 2:100599/1‑149 (MQ=255) aaaCTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGa < 1:100599/149‑1 (MQ=255) aaCTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAg < 5:91094/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCt > 2:27765/1‑148 (MQ=255) ccTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGgcgc < 1:86935/149‑1 (MQ=255) ccTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGgcg > 2:86935/1‑148 (MQ=255) ccTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCAGAGCTGACCGGgcg > 8:296908/1‑148 (MQ=255) tggtCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGAccgcc < 7:360343/149‑1 (MQ=255) gtCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCaga < 6:152677/91‑1 (MQ=255) gtCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCaga > 5:152677/1‑91 (MQ=255) gAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTc > 8:125567/1‑149 (MQ=255) cTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTgcaggcaggtgcgagtgttcgaccacctggcggtagggcacgccgagtttgtcgagcagcagcctgatgacggaggg > 5:404954‑M2/1‑27 (MQ=255) cTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTgcaggcaggtgcgagtgttcgaccacctggcggtagggcacgccgagtttgtcgagcagcagcctgatgacggaggg < 6:404954‑M2/104‑78 (MQ=255) tCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTgcaggcaggtgcgagtgttcgaccacctggcggtagggcacgccgagtttgtcgagcagcagcctgatgacggagggggcgtgtggggttgcggtgtccag < 3:299548‑M2/127‑102 (MQ=255) tCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTgcaggcaggtgcgagtgttcgaccacctggcggtagggcacgccgagtttgtcgagcagcagcctgatgacggagggggcgtgtggggttgcggtgtccag > 4:299548‑M2/1‑26 (MQ=255) aCCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCgcgc > 4:305255/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCgcgc > 4:374579/1‑149 (MQ=255) ctgcctgcGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCt > 1:86607/1‑149 (MQ=255) gcGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAg > 3:152100/1‑147 (MQ=255) gCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGAt > 1:214133/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGATGCTc < 8:221102/149‑1 (MQ=255) gcgGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGATGCTc < 8:197619/148‑1 (MQ=255) gcgGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGATGCTc < 4:152100/148‑1 (MQ=255) gTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGATGCTCGACaa < 3:305255/149‑1 (MQ=255) | CAGTGGATACGGACCATGACTGAAGTTGCCCTGGACACCGCAACCCCACACGCCCCCTCCGTCATCAGGCTGCTGCTCGACAAACTCGGCGTGCCCTACCGCCAGGTGGTCGAACACTCGCACCTGCCTGCGGCTTCGCGGGTGCAGGCTGTCCTTCTCGACGACGAGGTCGGCGCCCTCATGGTGCTGTTCCCGCAGAGCCACCTGCTGGACCTCAACCGGCTGGCCGAGCTGACCGGGCGCAAGCTGACCGCCGTGTCGGTGCCGCGCCTGAAGCAGATGCTCGACAA > NC_002947/6058946‑6059235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |