New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 744921 = | NA (NA) | 43 (1.190) | 38/288 | 0.1 | 93.5% | intergenic (‑586/+45) | PP_0636/PP_0637 | cold shock DNA‑binding domain‑containing protein/transposase |
? | NC_002947 | 748230 = | 3 (0.080) | coding (283/819 nt) | PP_5449 | hypothetical protein |
CCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745056‑744921 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAG > NC_002947/748230‑748373 CCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGAC < 7:106942/148‑1 GTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCC < 1:128315/148‑1 CTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCA > 3:88839/1‑148 AGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAAC < 6:146156/146‑1 ACTGCCGCACGCCTCGTCGGTAGCAGACTACTAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAG < 1:209994/148‑1 CTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGG < 8:35909/148‑1 CTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTT > 3:22861/1‑146 TCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTTCCATGGAACTGATCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTCGCTTCCACCATGACGTACGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCCGTTTGAccg > 4:58136/1‑145 AGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGAT < 4:88839/148‑1 TACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGG > 7:23868/1‑139 ACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGA < 8:23868/139‑1 GAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCT > 3:34892/1‑148 GAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGGTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGTGCGGATGGTCTTGT < 3:37215/146‑1 GAAGCGCTGCTGCCAGGGCACTGGTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGgc < 6:34980/147‑3 GCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCCCGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGGAAGGTGCTCGGTTTGCGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAA > 7:91063/1‑147 ATGGAACTGTTCGACAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTACACATTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCC > 6:181485/1‑147 GGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCG > 8:101093/1‑146 AACTGTTCGCGAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAA < 3:58136/147‑1 AACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAG < 5:19506/148‑1 AACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAG < 4:34892/148‑1 AGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGAC > 7:60060/1‑148 GCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGA > 5:149295/1‑147 ACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAA > 4:128877/1‑126 CGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAA < 3:128877/126‑1 GGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCT > 5:159259/1‑148 TTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGTCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAA > 8:57186/1‑148 TTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAA < 8:60060/148‑1 TTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAA < 2:104114/148‑1 GGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAG < 8:158388/146‑1 GCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGA < 3:15852/147‑1 TTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAA > 8:83249/1‑146 ACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCC > 4:106159/1‑148 CCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCC < 6:149295/148‑1 TGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAA < 5:181485/147‑1 GTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGATGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAA > 6:58165/1‑146 GTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAG > 3:19130/1‑148 AGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAG < 1:77511/148‑1 TTCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAG > 2:56495/1‑121 TCATGGATCGGTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGG < 1:56495/121‑1 TGGATCGGTTACAGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGA < 1:41355/148‑1 GGATCGGTTCCCGAAGTTTGGCCTGCCTCAACTGTACGGTGCGCGGTCTGAGGGCGGATGGGCTGGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTAGGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAA < 8:60106/148‑1 GTTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGA < 7:17176/148‑1 gTACCGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGAGGGTCTGGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAG < 8:119882/147‑1 CCACGTCCTGGAGCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/745056‑744921 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAAGTTTGGACTGCCTCAACTGTAAGGTGCTCGGTTTGAGGGCGGATGGTCTTGTCTGGAATTATGATCCGAAAGGGCCGTATGACGTAGATCAGCTACTCAAGGAACAAGCCCGGAAAAGAGAAGAGGCCTTGAATGCTGAG > NC_002947/748230‑748373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |